MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Nitrosopumilus sp. AR2 chromosome

Total Repeats: 33938

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_018656	AATG	2	8	617405	617412	50 %	25 %	25 %	0 %	407464609
12502	NC_018656	AGA	2	6	617434	617439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464609
12503	NC_018656	GGT	3	9	617495	617503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407464609
12504	NC_018656	TGG	2	6	617509	617514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407464609
12505	NC_018656	CGG	2	6	617521	617526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407464609
12506	NC_018656	TGG	2	6	617530	617535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407464609
12507	NC_018656	AGA	2	6	617558	617563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464609
12508	NC_018656	GAC	2	6	617564	617569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407464609
12509	NC_018656	ATG	2	6	617586	617591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464609
12510	NC_018656	AGA	2	6	617641	617646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464609
12511	NC_018656	TGT	2	6	617769	617774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464610
12512	NC_018656	ATAAA	2	10	617796	617805	80 %	20 %	0 %	0 %	407464610
12513	NC_018656	GCG	2	6	618160	618165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407464611
12514	NC_018656	GTA	2	6	618168	618173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464611
12515	NC_018656	GAT	2	6	618183	618188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464611
12516	NC_018656	TCA	2	6	618284	618289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464611
12517	NC_018656	ATTT	2	8	618362	618369	25 %	75 %	0 %	0 %	407464612
12518	NC_018656	CAA	2	6	618393	618398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407464612
12519	NC_018656	T	6	6	618407	618412	0 %	100 %	0 %	0 %	407464612
12520	NC_018656	ATT	2	6	618419	618424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464612
12521	NC_018656	T	7	7	618480	618486	0 %	100 %	0 %	0 %	407464612
12522	NC_018656	T	6	6	618547	618552	0 %	100 %	0 %	0 %	407464612
12523	NC_018656	A	6	6	618605	618610	100 %	0 %	0 %	0 %	407464612
12524	NC_018656	T	6	6	618615	618620	0 %	100 %	0 %	0 %	407464612
12525	NC_018656	ATTC	2	8	618631	618638	25 %	50 %	0 %	25 %	407464612
12526	NC_018656	ATT	2	6	618966	618971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464613
12527	NC_018656	TTC	2	6	618974	618979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464613
12528	NC_018656	TCT	2	6	618987	618992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464613
12529	NC_018656	GTT	2	6	618993	618998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464613
12530	NC_018656	TCT	2	6	618999	619004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464613
12531	NC_018656	TGC	2	6	619087	619092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464613
12532	NC_018656	ATT	2	6	619136	619141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464613
12533	NC_018656	ATC	2	6	619205	619210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464613
12534	NC_018656	TTC	2	6	619250	619255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464613
12535	NC_018656	TTC	2	6	619285	619290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464613
12536	NC_018656	TTC	2	6	619325	619330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464613
12537	NC_018656	TTC	2	6	619343	619348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464613
12538	NC_018656	TAA	2	6	619361	619366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464613
12539	NC_018656	ATG	2	6	619543	619548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464613
12540	NC_018656	CTC	2	6	619600	619605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407464613
12541	NC_018656	TAC	2	6	619700	619705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464613
12542	NC_018656	TAC	2	6	619715	619720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464613
12543	NC_018656	CTA	2	6	619765	619770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464613
12544	NC_018656	AAT	2	6	619830	619835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464613
12545	NC_018656	ATG	2	6	620048	620053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464614
12546	NC_018656	A	6	6	620079	620084	100 %	0 %	0 %	0 %	407464614
12547	NC_018656	ATG	2	6	620096	620101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464614
12548	NC_018656	CAA	2	6	620125	620130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407464614
12549	NC_018656	A	8	8	620146	620153	100 %	0 %	0 %	0 %	407464614
12550	NC_018656	ATCA	2	8	620164	620171	50 %	25 %	0 %	25 %	407464614
12551	NC_018656	GTTGAA	2	12	620224	620235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464614
12552	NC_018656	AAG	2	6	620237	620242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464614
12553	NC_018656	AAAG	2	8	620274	620281	75 %	0 %	25 %	0 %	407464614
12554	NC_018656	AATTGA	2	12	620298	620309	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407464614
12555	NC_018656	CTC	2	6	620321	620326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407464614
12556	NC_018656	ATT	2	6	620351	620356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464614
12557	NC_018656	AAT	2	6	620367	620372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464614
12558	NC_018656	TTG	2	6	620461	620466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464614
12559	NC_018656	AAGA	3	12	620478	620489	75 %	0 %	25 %	0 %	407464614
12560	NC_018656	A	6	6	620498	620503	100 %	0 %	0 %	0 %	407464614
12561	NC_018656	TCC	2	6	620535	620540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407464614
12562	NC_018656	GAT	2	6	620551	620556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464614
12563	NC_018656	T	7	7	620582	620588	0 %	100 %	0 %	0 %	407464614
12564	NC_018656	TTGAC	2	10	620639	620648	20 %	40 %	20 %	20 %	407464614
12565	NC_018656	CTT	2	6	620656	620661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464614
12566	NC_018656	GAAGT	2	10	620666	620675	40 %	20 %	40 %	0 %	407464614
12567	NC_018656	AATTT	2	10	620873	620882	40 %	60 %	0 %	0 %	407464615
12568	NC_018656	TTTC	2	8	620889	620896	0 %	75 %	0 %	25 %	407464615
12569	NC_018656	CAT	2	6	620909	620914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464615
12570	NC_018656	ATTT	2	8	621047	621054	25 %	75 %	0 %	0 %	407464615
12571	NC_018656	TGAT	2	8	621091	621098	25 %	50 %	25 %	0 %	407464615
12572	NC_018656	GAG	2	6	621103	621108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407464615
12573	NC_018656	TGT	3	9	621155	621163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464615
12574	NC_018656	ATGT	2	8	621165	621172	25 %	50 %	25 %	0 %	407464615
12575	NC_018656	TTG	2	6	621180	621185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464615
12576	NC_018656	TG	3	6	621200	621205	0 %	50 %	50 %	0 %	407464615
12577	NC_018656	TCC	2	6	621209	621214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407464615
12578	NC_018656	T	7	7	621242	621248	0 %	100 %	0 %	0 %	407464615
12579	NC_018656	CCT	2	6	621312	621317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407464615
12580	NC_018656	TCA	2	6	621333	621338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464615
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12582	NC_018656	AT	3	6	621396	621401	50 %	50 %	0 %	0 %	407464615
12583	NC_018656	GA	3	6	621443	621448	50 %	0 %	50 %	0 %	407464615
12584	NC_018656	TGA	2	6	621454	621459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464615
12585	NC_018656	TAC	2	6	621464	621469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464615
12586	NC_018656	TGC	2	6	621500	621505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464615
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12588	NC_018656	CA	3	6	621554	621559	50 %	0 %	0 %	50 %	407464615
12589	NC_018656	AATC	2	8	622216	622223	50 %	25 %	0 %	25 %	407464616
12590	NC_018656	C	6	6	622269	622274	0 %	0 %	0 %	100 %	407464616
12591	NC_018656	AAACTA	2	12	622278	622289	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407464616
12592	NC_018656	AGGA	2	8	622342	622349	50 %	0 %	50 %	0 %	407464616
12593	NC_018656	TGC	2	6	622433	622438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464616
12594	NC_018656	CTT	2	6	622461	622466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464616
12595	NC_018656	GTT	2	6	622467	622472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464616
12596	NC_018656	AAT	2	6	622491	622496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464616
12597	NC_018656	GA	4	8	622500	622507	50 %	0 %	50 %	0 %	407464616
12598	NC_018656	AAAAG	2	10	622525	622534	80 %	0 %	20 %	0 %	407464616
12599	NC_018656	ATT	2	6	622548	622553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464616
12600	NC_018656	TAT	2	6	622577	622582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464616
12601	NC_018656	TAAT	2	8	622627	622634	50 %	50 %	0 %	0 %	407464616
12602	NC_018656	ATG	2	6	622657	622662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464616
12603	NC_018656	TTGT	2	8	622690	622697	0 %	75 %	25 %	0 %	407464616
12604	NC_018656	AAC	2	6	622724	622729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407464616
12605	NC_018656	A	7	7	622748	622754	100 %	0 %	0 %	0 %	407464616
12606	NC_018656	AGC	2	6	622757	622762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407464616
12607	NC_018656	ACT	2	6	622859	622864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464616
12608	NC_018656	AAAC	2	8	622934	622941	75 %	0 %	0 %	25 %	407464616
12609	NC_018656	GAA	2	6	622984	622989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464616
12610	NC_018656	A	6	6	622988	622993	100 %	0 %	0 %	0 %	407464616
12611	NC_018656	GCA	2	6	623046	623051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407464616
12612	NC_018656	ATT	2	6	623059	623064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464616
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12617	NC_018656	T	6	6	623254	623259	0 %	100 %	0 %	0 %	407464616
12618	NC_018656	TCA	2	6	623261	623266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464616
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