MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Nitrosopumilus sp. AR2 chromosome

Total Repeats: 33938

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_018656	TGAA	2	8	541200	541207	50 %	25 %	25 %	0 %	407464515
11002	NC_018656	CAA	2	6	541244	541249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407464515
11003	NC_018656	T	6	6	541264	541269	0 %	100 %	0 %	0 %	407464515
11004	NC_018656	GCT	2	6	541366	541371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464515
11005	NC_018656	ATT	2	6	541401	541406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464515
11006	NC_018656	T	6	6	541425	541430	0 %	100 %	0 %	0 %	407464515
11007	NC_018656	ATC	2	6	541446	541451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464515
11008	NC_018656	GCT	2	6	541561	541566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464515
11009	NC_018656	TGC	2	6	541572	541577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464515
11010	NC_018656	CTG	2	6	541586	541591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464515
11011	NC_018656	TCC	2	6	541593	541598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407464515
11012	NC_018656	ATCATA	2	12	541614	541625	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407464515
11013	NC_018656	TTC	2	6	541626	541631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464515
11014	NC_018656	AATT	2	8	541636	541643	50 %	50 %	0 %	0 %	407464515
11015	NC_018656	ATT	2	6	541685	541690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464516
11016	NC_018656	T	7	7	541689	541695	0 %	100 %	0 %	0 %	407464516
11017	NC_018656	TC	3	6	541721	541726	0 %	50 %	0 %	50 %	407464516
11018	NC_018656	TTTCAT	2	12	541841	541852	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407464516
11019	NC_018656	TCATT	2	10	542129	542138	20 %	60 %	0 %	20 %	407464517
11020	NC_018656	GTT	2	6	542146	542151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464517
11021	NC_018656	GTT	2	6	542193	542198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464517
11022	NC_018656	CATT	2	8	542209	542216	25 %	50 %	0 %	25 %	407464517
11023	NC_018656	TGT	2	6	542271	542276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464517
11024	NC_018656	TCT	2	6	542277	542282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464517
11025	NC_018656	TCT	2	6	542310	542315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464517
11026	NC_018656	ATC	2	6	542380	542385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464518
11027	NC_018656	TGC	2	6	542465	542470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464518
11028	NC_018656	TCT	2	6	542481	542486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464518
11029	NC_018656	TCTT	2	8	542513	542520	0 %	75 %	0 %	25 %	407464518
11030	NC_018656	CTTG	2	8	542532	542539	0 %	50 %	25 %	25 %	407464518
11031	NC_018656	ATC	2	6	542543	542548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464518
11032	NC_018656	TGA	2	6	542575	542580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464518
11033	NC_018656	CTT	2	6	542613	542618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464518
11034	NC_018656	TGG	2	6	542665	542670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407464518
11035	NC_018656	CAG	2	6	542798	542803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407464518
11036	NC_018656	AATT	2	8	542813	542820	50 %	50 %	0 %	0 %	407464518
11037	NC_018656	T	6	6	542819	542824	0 %	100 %	0 %	0 %	407464518
11038	NC_018656	TCA	2	6	542949	542954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464518
11039	NC_018656	GAC	2	6	543044	543049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407464518
11040	NC_018656	TCCT	2	8	543056	543063	0 %	50 %	0 %	50 %	407464518
11041	NC_018656	GTTT	2	8	543201	543208	0 %	75 %	25 %	0 %	407464519
11042	NC_018656	ATTT	2	8	543214	543221	25 %	75 %	0 %	0 %	407464519
11043	NC_018656	T	7	7	543219	543225	0 %	100 %	0 %	0 %	407464519
11044	NC_018656	CTT	2	6	543267	543272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464519
11045	NC_018656	CTT	2	6	543291	543296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464519
11046	NC_018656	TGG	2	6	543351	543356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407464519
11047	NC_018656	T	7	7	543364	543370	0 %	100 %	0 %	0 %	407464519
11048	NC_018656	GTA	2	6	543389	543394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464519
11049	NC_018656	T	8	8	543424	543431	0 %	100 %	0 %	0 %	407464519
11050	NC_018656	T	6	6	543499	543504	0 %	100 %	0 %	0 %	407464519
11051	NC_018656	A	6	6	543601	543606	100 %	0 %	0 %	0 %	407464519
11052	NC_018656	TTTG	2	8	543610	543617	0 %	75 %	25 %	0 %	407464519
11053	NC_018656	AATTG	2	10	543619	543628	40 %	40 %	20 %	0 %	407464519
11054	NC_018656	CAT	2	6	543673	543678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464519
11055	NC_018656	T	6	6	543770	543775	0 %	100 %	0 %	0 %	407464519
11056	NC_018656	AATT	2	8	543811	543818	50 %	50 %	0 %	0 %	407464519
11057	NC_018656	ATT	2	6	543941	543946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464519
11058	NC_018656	T	6	6	543972	543977	0 %	100 %	0 %	0 %	407464519
11059	NC_018656	AAATCT	2	12	544007	544018	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407464519
11060	NC_018656	T	6	6	544071	544076	0 %	100 %	0 %	0 %	407464519
11061	NC_018656	TTC	2	6	544114	544119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464520
11062	NC_018656	T	6	6	544192	544197	0 %	100 %	0 %	0 %	407464520
11063	NC_018656	CTT	2	6	544216	544221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464520
11064	NC_018656	TGA	2	6	544227	544232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464520
11065	NC_018656	TCTTT	2	10	544233	544242	0 %	80 %	0 %	20 %	407464520
11066	NC_018656	TCC	2	6	544252	544257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407464520
11067	NC_018656	TGA	2	6	544293	544298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464520
11068	NC_018656	TCTT	2	8	544302	544309	0 %	75 %	0 %	25 %	407464520
11069	NC_018656	CTT	2	6	544443	544448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464520
11070	NC_018656	ATTG	2	8	544584	544591	25 %	50 %	25 %	0 %	407464521
11071	NC_018656	A	6	6	544610	544615	100 %	0 %	0 %	0 %	407464521
11072	NC_018656	TGC	2	6	544646	544651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464521
11073	NC_018656	ATC	2	6	544669	544674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464521
11074	NC_018656	TGA	3	9	544694	544702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464521
11075	NC_018656	AAT	2	6	544703	544708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464521
11076	NC_018656	TAA	2	6	544787	544792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464521
11077	NC_018656	TAA	2	6	544798	544803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464521
11078	NC_018656	ACATC	2	10	544804	544813	40 %	20 %	0 %	40 %	407464521
11079	NC_018656	T	6	6	544947	544952	0 %	100 %	0 %	0 %	407464522
11080	NC_018656	TG	4	8	545062	545069	0 %	50 %	50 %	0 %	407464522
11081	NC_018656	CAT	2	6	545116	545121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464522
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11083	NC_018656	A	6	6	545299	545304	100 %	0 %	0 %	0 %	407464523
11084	NC_018656	TTC	2	6	545386	545391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464523
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11086	NC_018656	A	6	6	545521	545526	100 %	0 %	0 %	0 %	407464524
11087	NC_018656	CTT	2	6	545591	545596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464524
11088	NC_018656	TAG	2	6	545759	545764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464524
11089	NC_018656	TTG	2	6	545801	545806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464524
11090	NC_018656	T	6	6	545814	545819	0 %	100 %	0 %	0 %	407464524
11091	NC_018656	AGC	2	6	545838	545843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407464524
11092	NC_018656	CAT	2	6	545849	545854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464524
11093	NC_018656	AGA	2	6	545862	545867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464524
11094	NC_018656	ATGG	2	8	545927	545934	25 %	25 %	50 %	0 %	407464524
11095	NC_018656	GCATTT	2	12	545956	545967	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407464524
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11097	NC_018656	CAA	2	6	546106	546111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407464524
11098	NC_018656	GTC	2	6	546177	546182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464525
11099	NC_018656	AT	3	6	546213	546218	50 %	50 %	0 %	0 %	407464525
11100	NC_018656	T	6	6	546236	546241	0 %	100 %	0 %	0 %	407464525
11101	NC_018656	GTTG	2	8	546249	546256	0 %	50 %	50 %	0 %	407464525
11102	NC_018656	TTG	2	6	546259	546264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464525
11103	NC_018656	A	6	6	546409	546414	100 %	0 %	0 %	0 %	407464525
11104	NC_018656	CAAAA	2	10	546416	546425	80 %	0 %	0 %	20 %	407464525
11105	NC_018656	A	6	6	546422	546427	100 %	0 %	0 %	0 %	407464525
11106	NC_018656	GGA	2	6	546433	546438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407464525
11107	NC_018656	TGC	2	6	546459	546464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464525
11108	NC_018656	ATT	2	6	546574	546579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464525
11109	NC_018656	ATA	2	6	546654	546659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464525
11110	NC_018656	TGA	2	6	546839	546844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464526
11111	NC_018656	GATA	2	8	546852	546859	50 %	25 %	25 %	0 %	407464526
11112	NC_018656	ATTT	2	8	546870	546877	25 %	75 %	0 %	0 %	407464526
11113	NC_018656	AATTT	2	10	546911	546920	40 %	60 %	0 %	0 %	407464526
11114	NC_018656	T	6	6	546951	546956	0 %	100 %	0 %	0 %	407464526
11115	NC_018656	GAGGG	2	10	546998	547007	20 %	0 %	80 %	0 %	407464526
11116	NC_018656	T	6	6	547016	547021	0 %	100 %	0 %	0 %	407464526
11117	NC_018656	TTG	2	6	547035	547040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464526
11118	NC_018656	AATT	2	8	547044	547051	50 %	50 %	0 %	0 %	407464526
11119	NC_018656	AG	3	6	547148	547153	50 %	0 %	50 %	0 %	407464527
11120	NC_018656	AATT	2	8	547188	547195	50 %	50 %	0 %	0 %	407464527
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11122	NC_018656	TGC	2	6	547246	547251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464527
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