MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Nitrosopumilus sp. AR2 chromosome

Total Repeats: 33938

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_018656	AGC	2	6	420252	420257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407464365
8502	NC_018656	CAA	2	6	420262	420267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407464365
8503	NC_018656	CAA	2	6	420303	420308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407464365
8504	NC_018656	ACA	2	6	420363	420368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407464365
8505	NC_018656	TGAT	2	8	420376	420383	25 %	50 %	25 %	0 %	407464365
8506	NC_018656	GAA	2	6	420409	420414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464365
8507	NC_018656	ATT	2	6	420455	420460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464365
8508	NC_018656	TGT	2	6	420469	420474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464365
8509	NC_018656	CAT	2	6	420514	420519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464365
8510	NC_018656	GTT	2	6	420612	420617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464365
8511	NC_018656	AAAT	2	8	420635	420642	75 %	25 %	0 %	0 %	407464365
8512	NC_018656	GAT	2	6	420662	420667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464365
8513	NC_018656	TGC	2	6	420683	420688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464365
8514	NC_018656	TTA	2	6	420723	420728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464365
8515	NC_018656	ATG	2	6	420778	420783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464365
8516	NC_018656	CACT	2	8	420791	420798	25 %	25 %	0 %	50 %	407464365
8517	NC_018656	TGA	2	6	420818	420823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464365
8518	NC_018656	TCT	2	6	420832	420837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464365
8519	NC_018656	AGG	2	6	420865	420870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407464365
8520	NC_018656	ACA	2	6	420970	420975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407464365
8521	NC_018656	TGA	2	6	420995	421000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464365
8522	NC_018656	TTG	2	6	421015	421020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464365
8523	NC_018656	AAG	2	6	421127	421132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464366
8524	NC_018656	A	6	6	421162	421167	100 %	0 %	0 %	0 %	407464366
8525	NC_018656	ATGCTG	2	12	421223	421234	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407464366
8526	NC_018656	TGA	2	6	421257	421262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464366
8527	NC_018656	CTG	2	6	421328	421333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464366
8528	NC_018656	CTC	2	6	421337	421342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407464366
8529	NC_018656	CTA	2	6	421502	421507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464367
8530	NC_018656	AGA	2	6	421596	421601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464367
8531	NC_018656	CAA	2	6	421622	421627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407464367
8532	NC_018656	A	6	6	421656	421661	100 %	0 %	0 %	0 %	407464367
8533	NC_018656	ATT	2	6	421672	421677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464367
8534	NC_018656	ACT	2	6	421690	421695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464367
8535	NC_018656	AATT	2	8	421701	421708	50 %	50 %	0 %	0 %	407464367
8536	NC_018656	AAG	2	6	421742	421747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464367
8537	NC_018656	ATT	2	6	421753	421758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464367
8538	NC_018656	CAT	2	6	421777	421782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464367
8539	NC_018656	GAT	2	6	421849	421854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464367
8540	NC_018656	GAT	2	6	421873	421878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464367
8541	NC_018656	A	6	6	421964	421969	100 %	0 %	0 %	0 %	407464367
8542	NC_018656	T	6	6	422068	422073	0 %	100 %	0 %	0 %	407464367
8543	NC_018656	TGG	3	9	422163	422171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407464367
8544	NC_018656	TGT	2	6	422259	422264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464367
8545	NC_018656	TGC	2	6	422274	422279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464367
8546	NC_018656	GTG	3	9	422411	422419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407464367
8547	NC_018656	ATG	2	6	422453	422458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464367
8548	NC_018656	ATT	2	6	422467	422472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464367
8549	NC_018656	GAA	2	6	422476	422481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464367
8550	NC_018656	TCA	2	6	422502	422507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464367
8551	NC_018656	TGC	2	6	422541	422546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464367
8552	NC_018656	TTTACA	2	12	422564	422575	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407464367
8553	NC_018656	ATT	2	6	422680	422685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464368
8554	NC_018656	ATG	2	6	422722	422727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464368
8555	NC_018656	ATTGAC	2	12	422766	422777	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407464368
8556	NC_018656	TGA	2	6	422786	422791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464368
8557	NC_018656	A	7	7	422908	422914	100 %	0 %	0 %	0 %	407464368
8558	NC_018656	CTTT	2	8	422976	422983	0 %	75 %	0 %	25 %	407464368
8559	NC_018656	AGA	2	6	423059	423064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464368
8560	NC_018656	GCA	2	6	423066	423071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407464368
8561	NC_018656	AAT	2	6	423151	423156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464369
8562	NC_018656	ATG	2	6	423176	423181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464369
8563	NC_018656	CTT	2	6	423221	423226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464369
8564	NC_018656	TGA	2	6	423234	423239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464369
8565	NC_018656	TG	3	6	423263	423268	0 %	50 %	50 %	0 %	407464369
8566	NC_018656	TAC	2	6	423303	423308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464369
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8568	NC_018656	ATT	2	6	423321	423326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464369
8569	NC_018656	GAA	2	6	423388	423393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464369
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8574	NC_018656	TTG	3	9	423592	423600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464370
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8579	NC_018656	CATC	2	8	423781	423788	25 %	25 %	0 %	50 %	407464370
8580	NC_018656	TGAG	2	8	423863	423870	25 %	25 %	50 %	0 %	407464370
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8584	NC_018656	GTCT	2	8	424015	424022	0 %	50 %	25 %	25 %	407464370
8585	NC_018656	CCT	2	6	424035	424040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407464370
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8588	NC_018656	CT	3	6	424097	424102	0 %	50 %	0 %	50 %	407464370
8589	NC_018656	CAA	2	6	424105	424110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407464370
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8591	NC_018656	CTA	2	6	424147	424152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464370
8592	NC_018656	TG	3	6	424168	424173	0 %	50 %	50 %	0 %	407464370
8593	NC_018656	AAT	2	6	424206	424211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464370
8594	NC_018656	CA	3	6	424279	424284	50 %	0 %	0 %	50 %	407464370
8595	NC_018656	TATTT	2	10	424371	424380	20 %	80 %	0 %	0 %	407464370
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8603	NC_018656	GGGT	2	8	425155	425162	0 %	25 %	75 %	0 %	407464371
8604	NC_018656	ATG	2	6	425163	425168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464371
8605	NC_018656	CAT	2	6	425169	425174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464371
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8608	NC_018656	GA	3	6	425237	425242	50 %	0 %	50 %	0 %	407464371
8609	NC_018656	GATG	2	8	425323	425330	25 %	25 %	50 %	0 %	407464371
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8613	NC_018656	TGT	2	6	425540	425545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464372
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8615	NC_018656	T	7	7	425609	425615	0 %	100 %	0 %	0 %	407464372
8616	NC_018656	ATGATA	2	12	425721	425732	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407464372
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