MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Nitrosopumilus koreensis AR1 chromosome

Total Repeats: 32676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018655	TGT	2	6	214	219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407461553
2	NC_018655	ATC	2	6	299	304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407461553
3	NC_018655	CAA	2	6	317	322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407461553
4	NC_018655	A	6	6	338	343	100 %	0 %	0 %	0 %	407461553
5	NC_018655	A	6	6	371	376	100 %	0 %	0 %	0 %	407461553
6	NC_018655	ATT	2	6	385	390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407461553
7	NC_018655	GTT	2	6	416	421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407461553
8	NC_018655	AC	3	6	429	434	50 %	0 %	0 %	50 %	407461553
9	NC_018655	A	7	7	499	505	100 %	0 %	0 %	0 %	407461553
10	NC_018655	AAG	2	6	553	558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407461553
11	NC_018655	A	7	7	582	588	100 %	0 %	0 %	0 %	407461553
12	NC_018655	A	8	8	669	676	100 %	0 %	0 %	0 %	407461553
13	NC_018655	A	7	7	683	689	100 %	0 %	0 %	0 %	407461553
14	NC_018655	TTA	2	6	690	695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407461553
15	NC_018655	A	6	6	695	700	100 %	0 %	0 %	0 %	407461553
16	NC_018655	CTT	2	6	763	768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407461553
17	NC_018655	A	7	7	769	775	100 %	0 %	0 %	0 %	407461553
18	NC_018655	A	7	7	833	839	100 %	0 %	0 %	0 %	407461553
19	NC_018655	TAAAAA	2	12	846	857	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407461553
20	NC_018655	TCAA	2	8	916	923	50 %	25 %	0 %	25 %	407461553
21	NC_018655	T	6	6	958	963	0 %	100 %	0 %	0 %	407461553
22	NC_018655	T	6	6	996	1001	0 %	100 %	0 %	0 %	407461554
23	NC_018655	TAA	2	6	1049	1054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407461554
24	NC_018655	TCT	2	6	1081	1086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407461554
25	NC_018655	T	7	7	1092	1098	0 %	100 %	0 %	0 %	407461554
26	NC_018655	ATT	2	6	1123	1128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407461554
27	NC_018655	T	6	6	1127	1132	0 %	100 %	0 %	0 %	407461554
28	NC_018655	T	6	6	1176	1181	0 %	100 %	0 %	0 %	407461554
29	NC_018655	CTT	2	6	1199	1204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407461554
30	NC_018655	T	6	6	1277	1282	0 %	100 %	0 %	0 %	407461554
31	NC_018655	AAT	2	6	1323	1328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407461554
32	NC_018655	AGC	3	9	1368	1376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407461554
33	NC_018655	CTTT	2	8	1424	1431	0 %	75 %	0 %	25 %	407461554
34	NC_018655	ACA	2	6	1495	1500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407461554
35	NC_018655	T	7	7	1509	1515	0 %	100 %	0 %	0 %	407461554
36	NC_018655	TCTCT	2	10	1541	1550	0 %	60 %	0 %	40 %	407461554
37	NC_018655	CAG	2	6	1559	1564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407461554
38	NC_018655	CAT	2	6	1565	1570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407461554
39	NC_018655	T	6	6	1581	1586	0 %	100 %	0 %	0 %	407461554
40	NC_018655	T	6	6	1657	1662	0 %	100 %	0 %	0 %	407461554
41	NC_018655	CAAC	2	8	1699	1706	50 %	0 %	0 %	50 %	407461554
42	NC_018655	A	6	6	1707	1712	100 %	0 %	0 %	0 %	407461554
43	NC_018655	ACC	2	6	1730	1735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407461555
44	NC_018655	ATC	2	6	1765	1770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407461555
45	NC_018655	ATT	2	6	1799	1804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407461555
46	NC_018655	ATTA	2	8	1876	1883	50 %	50 %	0 %	0 %	407461555
47	NC_018655	T	6	6	1931	1936	0 %	100 %	0 %	0 %	407461555
48	NC_018655	ATG	2	6	1968	1973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407461555
49	NC_018655	ATT	2	6	1976	1981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407461555
50	NC_018655	TACT	2	8	2007	2014	25 %	50 %	0 %	25 %	407461555
51	NC_018655	TA	3	6	2121	2126	50 %	50 %	0 %	0 %	407461555
52	NC_018655	T	6	6	2159	2164	0 %	100 %	0 %	0 %	407461555
53	NC_018655	TAA	2	6	2167	2172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407461555
54	NC_018655	TTC	2	6	2212	2217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407461555
55	NC_018655	T	6	6	2270	2275	0 %	100 %	0 %	0 %	407461555
56	NC_018655	AAT	2	6	2284	2289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407461555
57	NC_018655	CAA	2	6	2295	2300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407461555
58	NC_018655	TCT	2	6	2324	2329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407461555
59	NC_018655	TCCTAT	2	12	2416	2427	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	407461555
60	NC_018655	TAGAT	2	10	2471	2480	40 %	40 %	20 %	0 %	407461556
61	NC_018655	CAT	2	6	2520	2525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407461556
62	NC_018655	GTT	2	6	2536	2541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407461556
63	NC_018655	TCC	2	6	2718	2723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407461556
64	NC_018655	T	7	7	2808	2814	0 %	100 %	0 %	0 %	407461556
65	NC_018655	T	9	9	2818	2826	0 %	100 %	0 %	0 %	407461556
66	NC_018655	GAC	2	6	2875	2880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407461556
67	NC_018655	CTTGC	2	10	2959	2968	0 %	40 %	20 %	40 %	407461556
68	NC_018655	CTT	3	9	2987	2995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407461556
69	NC_018655	TCA	2	6	3031	3036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407461556
70	NC_018655	AAC	2	6	3198	3203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407461557
71	NC_018655	CTT	2	6	3204	3209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407461557
72	NC_018655	TCTG	2	8	3210	3217	0 %	50 %	25 %	25 %	407461557
73	NC_018655	AAT	2	6	3249	3254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407461557
74	NC_018655	A	6	6	3264	3269	100 %	0 %	0 %	0 %	407461557
75	NC_018655	TCT	2	6	3300	3305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407461557
76	NC_018655	TTC	2	6	3306	3311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407461557
77	NC_018655	TGC	2	6	3339	3344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407461557
78	NC_018655	ATTT	2	8	3386	3393	25 %	75 %	0 %	0 %	407461557
79	NC_018655	CTC	2	6	3498	3503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407461557
80	NC_018655	CTT	2	6	3513	3518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407461557
81	NC_018655	T	6	6	3549	3554	0 %	100 %	0 %	0 %	407461557
82	NC_018655	ACT	2	6	3737	3742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407461558
83	NC_018655	GTAA	2	8	3745	3752	50 %	25 %	25 %	0 %	407461558
84	NC_018655	CAT	2	6	3793	3798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407461558
85	NC_018655	ATG	2	6	3820	3825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407461558
86	NC_018655	TCT	2	6	3909	3914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407461558
87	NC_018655	TTAAAA	2	12	3919	3930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407461558
88	NC_018655	A	6	6	3927	3932	100 %	0 %	0 %	0 %	407461558
89	NC_018655	T	6	6	4012	4017	0 %	100 %	0 %	0 %	407461558
90	NC_018655	ATG	2	6	4043	4048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407461558
91	NC_018655	GCA	2	6	4068	4073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407461558
92	NC_018655	CCT	2	6	4126	4131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407461558
93	NC_018655	ACT	2	6	4186	4191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407461558
94	NC_018655	GCA	2	6	4201	4206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407461558
95	NC_018655	GAA	2	6	4217	4222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407461558
96	NC_018655	A	7	7	4236	4242	100 %	0 %	0 %	0 %	407461558
97	NC_018655	A	8	8	4281	4288	100 %	0 %	0 %	0 %	407461558
98	NC_018655	A	8	8	4338	4345	100 %	0 %	0 %	0 %	407461558
99	NC_018655	ATT	2	6	4357	4362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407461558
100	NC_018655	A	6	6	4397	4402	100 %	0 %	0 %	0 %	407461558
101	NC_018655	AAAC	2	8	4451	4458	75 %	0 %	0 %	25 %	407461558
102	NC_018655	ATCC	2	8	4515	4522	25 %	25 %	0 %	50 %	407461558
103	NC_018655	AAG	2	6	4540	4545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407461558
104	NC_018655	AG	3	6	4602	4607	50 %	0 %	50 %	0 %	407461558
105	NC_018655	A	6	6	4611	4616	100 %	0 %	0 %	0 %	407461558
106	NC_018655	A	6	6	4763	4768	100 %	0 %	0 %	0 %	407461558
107	NC_018655	CTC	2	6	4787	4792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407461558
108	NC_018655	ATT	2	6	4812	4817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407461558
109	NC_018655	AAG	2	6	4828	4833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407461558
110	NC_018655	ATCAA	2	10	4864	4873	60 %	20 %	0 %	20 %	407461558
111	NC_018655	A	6	6	4882	4887	100 %	0 %	0 %	0 %	407461558
112	NC_018655	AGAA	2	8	4948	4955	75 %	0 %	25 %	0 %	407461558
113	NC_018655	GGT	2	6	4976	4981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407461558
114	NC_018655	TGG	2	6	5010	5015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407461558
115	NC_018655	TGC	2	6	5022	5027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407461558
116	NC_018655	TGT	2	6	5040	5045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407461558
117	NC_018655	T	6	6	5104	5109	0 %	100 %	0 %	0 %	407461558
118	NC_018655	ATGA	2	8	5146	5153	50 %	25 %	25 %	0 %	407461558
119	NC_018655	GTTT	2	8	5170	5177	0 %	75 %	25 %	0 %	407461558
120	NC_018655	TAG	2	6	5178	5183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407461558
121	NC_018655	GA	3	6	5190	5195	50 %	0 %	50 %	0 %	407461558
122	NC_018655	A	6	6	5242	5247	100 %	0 %	0 %	0 %	407461558
123	NC_018655	TTC	2	6	5267	5272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407461558
124	NC_018655	AAG	2	6	5354	5359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407461558
125	NC_018655	A	8	8	5398	5405	100 %	0 %	0 %	0 %	407461558
126	NC_018655	AAT	2	6	5421	5426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407461558
127	NC_018655	TGG	2	6	5447	5452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407461558
128	NC_018655	TGC	2	6	5454	5459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407461558
129	NC_018655	A	8	8	5460	5467	100 %	0 %	0 %	0 %	407461558
130	NC_018655	GAA	2	6	5494	5499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407461558
131	NC_018655	A	7	7	5506	5512	100 %	0 %	0 %	0 %	407461558
132	NC_018655	TGA	2	6	5520	5525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407461558
133	NC_018655	TTA	2	6	5655	5660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407461559
134	NC_018655	GAA	2	6	5664	5669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407461559
135	NC_018655	TTCT	2	8	5672	5679	0 %	75 %	0 %	25 %	407461559
136	NC_018655	ATTTG	2	10	5774	5783	20 %	60 %	20 %	0 %	407461559
137	NC_018655	ACT	2	6	5810	5815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407461559
138	NC_018655	TGAT	2	8	5851	5858	25 %	50 %	25 %	0 %	407461559
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257	NC_018655	A	6	6	11384	11389	100 %	0 %	0 %	0 %	407461562
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259	NC_018655	GTT	2	6	11418	11423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407461562
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261	NC_018655	ATTAG	2	10	11499	11508	40 %	40 %	20 %	0 %	407461562
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264	NC_018655	CT	3	6	11586	11591	0 %	50 %	0 %	50 %	407461562
265	NC_018655	CAAAT	2	10	11634	11643	60 %	20 %	0 %	20 %	407461562
266	NC_018655	CT	3	6	11646	11651	0 %	50 %	0 %	50 %	407461562
267	NC_018655	AAC	2	6	11678	11683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407461562
268	NC_018655	ACTCTC	2	12	11735	11746	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	407461562
269	NC_018655	CT	3	6	11760	11765	0 %	50 %	0 %	50 %	407461562
270	NC_018655	CAAA	2	8	11808	11815	75 %	0 %	0 %	25 %	407461562
271	NC_018655	CT	3	6	11874	11879	0 %	50 %	0 %	50 %	407461562
272	NC_018655	TAT	2	6	11965	11970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407461562
273	NC_018655	TGA	2	6	12017	12022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407461562
274	NC_018655	TAC	2	6	12035	12040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407461562
275	NC_018655	ATC	2	6	12047	12052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407461562
276	NC_018655	TGG	2	6	12083	12088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407461562
277	NC_018655	GTATG	2	10	12114	12123	20 %	40 %	40 %	0 %	407461562
278	NC_018655	CA	3	6	12147	12152	50 %	0 %	0 %	50 %	407461562
279	NC_018655	AGG	2	6	12170	12175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407461562
280	NC_018655	TAC	2	6	12242	12247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407461562
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282	NC_018655	ACTGCA	2	12	12288	12299	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407461562
283	NC_018655	GAT	2	6	12345	12350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407461562
284	NC_018655	GTG	2	6	12394	12399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407461562
285	NC_018655	ATC	2	6	12422	12427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407461562
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291	NC_018655	ACTCT	2	10	12593	12602	20 %	40 %	0 %	40 %	407461562
292	NC_018655	TC	4	8	12688	12695	0 %	50 %	0 %	50 %	407461562
293	NC_018655	TCAC	2	8	12702	12709	25 %	25 %	0 %	50 %	407461562
294	NC_018655	GTATCA	2	12	12717	12728	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407461562
295	NC_018655	CT	3	6	12759	12764	0 %	50 %	0 %	50 %	407461562
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299	NC_018655	ACTA	2	8	12956	12963	50 %	25 %	0 %	25 %	407461562
300	NC_018655	AAT	2	6	13047	13052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407461562
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305	NC_018655	ACA	2	6	13365	13370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407461562
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393	NC_018655	CTT	2	6	17529	17534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407461564
394	NC_018655	CAT	2	6	17640	17645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407461564
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