MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci NJ1 chromosome

Total Repeats: 22069

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_018626	CAA	2	6	318201	318206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406593220
6002	NC_018626	ATT	2	6	318257	318262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593220
6003	NC_018626	AGC	2	6	318389	318394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406593220
6004	NC_018626	ATT	2	6	318416	318421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593220
6005	NC_018626	GTC	2	6	318433	318438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593220
6006	NC_018626	TGT	2	6	318545	318550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593220
6007	NC_018626	ATT	2	6	318560	318565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593220
6008	NC_018626	TGTT	2	8	318566	318573	0 %	75 %	25 %	0 %	406593220
6009	NC_018626	AAG	2	6	318641	318646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593220
6010	NC_018626	TGT	2	6	319172	319177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593221
6011	NC_018626	AAT	2	6	319190	319195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406593221
6012	NC_018626	GTA	2	6	319205	319210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593221
6013	NC_018626	CG	3	6	319222	319227	0 %	0 %	50 %	50 %	406593221
6014	NC_018626	TTA	2	6	319231	319236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593221
6015	NC_018626	CTT	2	6	319300	319305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593221
6016	NC_018626	ATG	2	6	319306	319311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593221
6017	NC_018626	AAG	2	6	319340	319345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593221
6018	NC_018626	GTT	2	6	319353	319358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593221
6019	NC_018626	TC	3	6	319365	319370	0 %	50 %	0 %	50 %	406593221
6020	NC_018626	TAGG	2	8	319385	319392	25 %	25 %	50 %	0 %	406593221
6021	NC_018626	TGC	2	6	319409	319414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593221
6022	NC_018626	TGA	2	6	319462	319467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593221
6023	NC_018626	AGA	2	6	319513	319518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593221
6024	NC_018626	GTT	2	6	319603	319608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593221
6025	NC_018626	GTAG	2	8	319620	319627	25 %	25 %	50 %	0 %	406593221
6026	NC_018626	TGTT	2	8	319634	319641	0 %	75 %	25 %	0 %	406593221
6027	NC_018626	AG	3	6	319763	319768	50 %	0 %	50 %	0 %	406593221
6028	NC_018626	GTT	2	6	319788	319793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593221
6029	NC_018626	ATC	2	6	319854	319859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406593221
6030	NC_018626	T	6	6	320129	320134	0 %	100 %	0 %	0 %	406593221
6031	NC_018626	AGG	2	6	320196	320201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406593221
6032	NC_018626	TTG	2	6	320210	320215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593221
6033	NC_018626	CTG	2	6	320222	320227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593221
6034	NC_018626	AGT	3	9	320232	320240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593221
6035	NC_018626	GAA	2	6	320287	320292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593221
6036	NC_018626	TGT	2	6	320364	320369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593221
6037	NC_018626	TGC	2	6	320373	320378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593221
6038	NC_018626	C	6	6	320406	320411	0 %	0 %	0 %	100 %	406593221
6039	NC_018626	TTAG	2	8	320440	320447	25 %	50 %	25 %	0 %	406593221
6040	NC_018626	ACA	2	6	320503	320508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406593221
6041	NC_018626	CTG	2	6	320516	320521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593221
6042	NC_018626	T	7	7	320532	320538	0 %	100 %	0 %	0 %	406593221
6043	NC_018626	GTT	2	6	320594	320599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593221
6044	NC_018626	TTC	2	6	320634	320639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593221
6045	NC_018626	AGA	2	6	320660	320665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593221
6046	NC_018626	AGT	2	6	320682	320687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593221
6047	NC_018626	TTTA	2	8	320700	320707	25 %	75 %	0 %	0 %	406593221
6048	NC_018626	TTC	2	6	320715	320720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593221
6049	NC_018626	AGA	2	6	320753	320758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593221
6050	NC_018626	TGA	2	6	320861	320866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593221
6051	NC_018626	ATC	2	6	320928	320933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406593221
6052	NC_018626	TAAA	2	8	320934	320941	75 %	25 %	0 %	0 %	406593221
6053	NC_018626	TTA	2	6	320980	320985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593221
6054	NC_018626	AGA	2	6	321054	321059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593221
6055	NC_018626	ATT	2	6	321084	321089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593221
6056	NC_018626	AAGAC	2	10	321166	321175	60 %	0 %	20 %	20 %	406593221
6057	NC_018626	TAG	2	6	321191	321196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593221
6058	NC_018626	GGA	2	6	321238	321243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406593221
6059	NC_018626	TTGC	3	12	321322	321333	0 %	50 %	25 %	25 %	406593221
6060	NC_018626	GTA	2	6	321334	321339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593221
6061	NC_018626	CAAAG	2	10	321347	321356	60 %	0 %	20 %	20 %	406593221
6062	NC_018626	AAG	2	6	321373	321378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593221
6063	NC_018626	AGT	2	6	321390	321395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593221
6064	NC_018626	ACT	2	6	321408	321413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406593221
6065	NC_018626	AT	3	6	321452	321457	50 %	50 %	0 %	0 %	406593221
6066	NC_018626	TAG	2	6	321494	321499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593221
6067	NC_018626	T	6	6	321560	321565	0 %	100 %	0 %	0 %	406593221
6068	NC_018626	AGAA	2	8	321769	321776	75 %	0 %	25 %	0 %	406593222
6069	NC_018626	ACTG	2	8	321835	321842	25 %	25 %	25 %	25 %	406593222
6070	NC_018626	TCG	2	6	321913	321918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593222
6071	NC_018626	TACA	2	8	321992	321999	50 %	25 %	0 %	25 %	406593222
6072	NC_018626	TC	4	8	322022	322029	0 %	50 %	0 %	50 %	406593222
6073	NC_018626	GCT	2	6	322085	322090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593222
6074	NC_018626	TGT	2	6	322109	322114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593222
6075	NC_018626	AGA	2	6	322187	322192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593222
6076	NC_018626	TGT	2	6	322294	322299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593222
6077	NC_018626	TGG	2	6	322300	322305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406593222
6078	NC_018626	AAC	2	6	322363	322368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406593222
6079	NC_018626	TCA	2	6	322401	322406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406593222
6080	NC_018626	ATA	2	6	322424	322429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406593222
6081	NC_018626	TTAC	2	8	322461	322468	25 %	50 %	0 %	25 %	406593222
6082	NC_018626	CT	3	6	322523	322528	0 %	50 %	0 %	50 %	406593222
6083	NC_018626	GAA	2	6	322610	322615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593222
6084	NC_018626	ACG	2	6	322643	322648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406593222
6085	NC_018626	ACG	2	6	322745	322750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406593222
6086	NC_018626	TTA	2	6	322818	322823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593222
6087	NC_018626	GT	3	6	322865	322870	0 %	50 %	50 %	0 %	406593222
6088	NC_018626	ACA	2	6	322884	322889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406593222
6089	NC_018626	TGT	3	9	322904	322912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593222
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6091	NC_018626	CAA	2	6	322999	323004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406593222
6092	NC_018626	CAG	2	6	323038	323043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406593222
6093	NC_018626	TCT	2	6	323118	323123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593222
6094	NC_018626	CTG	2	6	323170	323175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593222
6095	NC_018626	GA	3	6	323179	323184	50 %	0 %	50 %	0 %	406593222
6096	NC_018626	CAG	2	6	323230	323235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406593222
6097	NC_018626	CAG	2	6	323281	323286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406593222
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6100	NC_018626	TTTA	2	8	323354	323361	25 %	75 %	0 %	0 %	406593222
6101	NC_018626	CAG	2	6	323374	323379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406593222
6102	NC_018626	ACCAAT	2	12	323573	323584	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	406593222
6103	NC_018626	ATAA	2	8	323625	323632	75 %	25 %	0 %	0 %	406593222
6104	NC_018626	TCC	2	6	323639	323644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406593222
6105	NC_018626	TGA	2	6	323687	323692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593222
6106	NC_018626	TGA	2	6	323747	323752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593222
6107	NC_018626	CAG	2	6	323791	323796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406593222
6108	NC_018626	GTT	3	9	323810	323818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593222
6109	NC_018626	ACA	2	6	323823	323828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406593222
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6111	NC_018626	AGC	2	6	323948	323953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406593222
6112	NC_018626	T	6	6	323966	323971	0 %	100 %	0 %	0 %	406593222
6113	NC_018626	GTG	2	6	323985	323990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406593222
6114	NC_018626	CCA	2	6	324045	324050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406593222
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6116	NC_018626	ATT	2	6	324089	324094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593222
6117	NC_018626	CTC	2	6	324109	324114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406593222
6118	NC_018626	ATT	2	6	324137	324142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593222
6119	NC_018626	AGA	2	6	324149	324154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593222
6120	NC_018626	TCC	2	6	324227	324232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406593222
6121	NC_018626	GTT	2	6	324275	324280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593222
6122	NC_018626	GAA	2	6	324321	324326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593222
6123	NC_018626	AGC	2	6	324332	324337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406593222
6124	NC_018626	TCC	2	6	324389	324394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406593222
6125	NC_018626	TGCA	2	8	324467	324474	25 %	25 %	25 %	25 %	406593222
6126	NC_018626	CCT	2	6	324707	324712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406593223
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6131	NC_018626	T	6	6	324957	324962	0 %	100 %	0 %	0 %	406593223
6132	NC_018626	TCC	2	6	325030	325035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406593223
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6135	NC_018626	GAAAG	2	10	325087	325096	60 %	0 %	40 %	0 %	406593223
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6155	NC_018626	CTT	2	6	326250	326255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593223
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6232	NC_018626	GGTT	2	8	329599	329606	0 %	50 %	50 %	0 %	406593226
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6237	NC_018626	AGA	2	6	329857	329862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593227
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6239	NC_018626	GAA	2	6	329894	329899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593227
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6242	NC_018626	ACT	2	6	330017	330022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406593227
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