MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci WC chromosome

Total Repeats: 22186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_018624	TTGT	2	8	158600	158607	0 %	75 %	25 %	0 %	407460323
3002	NC_018624	CTT	2	6	158686	158691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460323
3003	NC_018624	AGCA	2	8	158693	158700	50 %	0 %	25 %	25 %	407460323
3004	NC_018624	T	9	9	158725	158733	0 %	100 %	0 %	0 %	407460323
3005	NC_018624	GAA	2	6	158747	158752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460323
3006	NC_018624	CAA	2	6	158775	158780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407460323
3007	NC_018624	TTTA	2	8	158792	158799	25 %	75 %	0 %	0 %	407460323
3008	NC_018624	ATG	2	6	158848	158853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460323
3009	NC_018624	TCT	2	6	158906	158911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460323
3010	NC_018624	TTG	2	6	158977	158982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460323
3011	NC_018624	A	6	6	159016	159021	100 %	0 %	0 %	0 %	407460323
3012	NC_018624	GAA	2	6	159096	159101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460323
3013	NC_018624	TCA	2	6	159125	159130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460323
3014	NC_018624	TCC	2	6	159161	159166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407460323
3015	NC_018624	GTC	2	6	159170	159175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460323
3016	NC_018624	GTT	2	6	159399	159404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460324
3017	NC_018624	TGA	2	6	159482	159487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460324
3018	NC_018624	A	7	7	159690	159696	100 %	0 %	0 %	0 %	407460324
3019	NC_018624	T	7	7	159706	159712	0 %	100 %	0 %	0 %	407460324
3020	NC_018624	CCTT	2	8	159721	159728	0 %	50 %	0 %	50 %	407460324
3021	NC_018624	TTG	2	6	159748	159753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460324
3022	NC_018624	TCT	2	6	159780	159785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460324
3023	NC_018624	ACTG	2	8	159825	159832	25 %	25 %	25 %	25 %	407460324
3024	NC_018624	GGA	2	6	159955	159960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407460324
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3028	NC_018624	TTTC	2	8	160485	160492	0 %	75 %	0 %	25 %	407460325
3029	NC_018624	AAG	2	6	160647	160652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460325
3030	NC_018624	CTT	2	6	160762	160767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460325
3031	NC_018624	CTC	2	6	160781	160786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407460325
3032	NC_018624	TGGATT	2	12	160795	160806	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407460325
3033	NC_018624	GA	3	6	160821	160826	50 %	0 %	50 %	0 %	407460325
3034	NC_018624	CGA	2	6	160831	160836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460325
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3039	NC_018624	TCT	2	6	161203	161208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460326
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3044	NC_018624	GA	3	6	161323	161328	50 %	0 %	50 %	0 %	407460326
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3046	NC_018624	A	6	6	161432	161437	100 %	0 %	0 %	0 %	407460326
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3052	NC_018624	ATG	2	6	161712	161717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460326
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3055	NC_018624	TGTT	2	8	161884	161891	0 %	75 %	25 %	0 %	407460327
3056	NC_018624	T	6	6	161893	161898	0 %	100 %	0 %	0 %	407460327
3057	NC_018624	ACA	2	6	161906	161911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407460327
3058	NC_018624	ATA	2	6	161930	161935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407460327
3059	NC_018624	TAA	2	6	161947	161952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407460327
3060	NC_018624	TTG	2	6	161965	161970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460327
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3063	NC_018624	GGGGC	2	10	162007	162016	0 %	0 %	80 %	20 %	407460327
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3069	NC_018624	TCG	2	6	162285	162290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460327
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3072	NC_018624	GATT	2	8	162472	162479	25 %	50 %	25 %	0 %	407460328
3073	NC_018624	TTCT	2	8	162480	162487	0 %	75 %	0 %	25 %	407460328
3074	NC_018624	AG	3	6	162488	162493	50 %	0 %	50 %	0 %	407460328
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3081	NC_018624	T	6	6	162644	162649	0 %	100 %	0 %	0 %	407460328
3082	NC_018624	T	7	7	162694	162700	0 %	100 %	0 %	0 %	407460328
3083	NC_018624	TGT	2	6	162735	162740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460328
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3087	NC_018624	AGCAT	2	10	163299	163308	40 %	20 %	20 %	20 %	407460329
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3089	NC_018624	CT	3	6	163344	163349	0 %	50 %	0 %	50 %	407460329
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3094	NC_018624	AGGG	2	8	163510	163517	25 %	0 %	75 %	0 %	407460329
3095	NC_018624	T	6	6	163567	163572	0 %	100 %	0 %	0 %	407460329
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3104	NC_018624	A	6	6	163901	163906	100 %	0 %	0 %	0 %	407460329
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3108	NC_018624	TGA	2	6	164248	164253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460329
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3110	NC_018624	CAG	2	6	164347	164352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460329
3111	NC_018624	GA	3	6	164359	164364	50 %	0 %	50 %	0 %	407460329
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3114	NC_018624	TAA	2	6	164402	164407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407460329
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3121	NC_018624	ATC	2	6	164737	164742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460330
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3123	NC_018624	AG	3	6	164763	164768	50 %	0 %	50 %	0 %	407460330
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3248	NC_018624	TTG	2	6	171906	171911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460335
3249	NC_018624	GAC	2	6	171935	171940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460335
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3263	NC_018624	TCG	2	6	173287	173292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460337
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3370	NC_018624	TGT	2	6	179085	179090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460342
3371	NC_018624	TTTC	2	8	179098	179105	0 %	75 %	0 %	25 %	407460342
3372	NC_018624	CTG	3	9	179159	179167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460342
3373	NC_018624	GCA	2	6	179553	179558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460343
3374	NC_018624	TGG	2	6	179570	179575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407460343
3375	NC_018624	TG	3	6	179577	179582	0 %	50 %	50 %	0 %	407460343
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3385	NC_018624	TGA	2	6	180334	180339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460343
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3400	NC_018624	TTGT	2	8	181026	181033	0 %	75 %	25 %	0 %	407460344
3401	NC_018624	GTA	2	6	181108	181113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460344
3402	NC_018624	CTT	2	6	181129	181134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460344
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3462	NC_018624	GGTAC	2	10	183760	183769	20 %	20 %	40 %	20 %	407460346
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3475	NC_018624	T	6	6	184420	184425	0 %	100 %	0 %	0 %	407460347
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3479	NC_018624	TA	3	6	184562	184567	50 %	50 %	0 %	0 %	407460347
3480	NC_018624	CAC	2	6	184628	184633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407460347
3481	NC_018624	AAG	2	6	184689	184694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460347
3482	NC_018624	ACA	2	6	184726	184731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407460347
3483	NC_018624	CCT	2	6	184797	184802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407460348
3484	NC_018624	CGT	2	6	184803	184808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460348
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3488	NC_018624	T	7	7	185029	185035	0 %	100 %	0 %	0 %	407460348
3489	NC_018624	ATG	2	6	185048	185053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460348
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3491	NC_018624	CCA	2	6	185088	185093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407460348
3492	NC_018624	TCC	2	6	185139	185144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407460348
3493	NC_018624	A	6	6	185269	185274	100 %	0 %	0 %	0 %	407460348
3494	NC_018624	CTT	2	6	185284	185289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460348
3495	NC_018624	AAT	2	6	185325	185330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407460348
3496	NC_018624	AAT	2	6	185366	185371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407460348
3497	NC_018624	GTA	2	6	185393	185398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460348
3498	NC_018624	AGA	2	6	185405	185410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460348
3499	NC_018624	ATG	2	6	185469	185474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460348
3500	NC_018624	GA	3	6	185534	185539	50 %	0 %	50 %	0 %	407460348

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