MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci WS/RT/E30 chromosome

Total Repeats: 21342

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_018622	TCC	2	6	1049672	1049677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458509
19502	NC_018622	TTA	2	6	1049695	1049700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458509
19503	NC_018622	TTTGCA	2	12	1049810	1049821	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407458509
19504	NC_018622	AAAC	2	8	1049833	1049840	75 %	0 %	0 %	25 %	407458509
19505	NC_018622	GGTAC	2	10	1049859	1049868	20 %	20 %	40 %	20 %	407458509
19506	NC_018622	A	6	6	1049879	1049884	100 %	0 %	0 %	0 %	407458509
19507	NC_018622	GCTTTT	2	12	1049892	1049903	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	407458509
19508	NC_018622	A	6	6	1050058	1050063	100 %	0 %	0 %	0 %	407458509
19509	NC_018622	TCT	2	6	1050091	1050096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458509
19510	NC_018622	TCC	2	6	1050119	1050124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458509
19511	NC_018622	TTA	2	6	1050183	1050188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458509
19512	NC_018622	ACC	2	6	1050208	1050213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407458509
19513	NC_018622	TGA	2	6	1050233	1050238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458509
19514	NC_018622	AC	3	6	1050255	1050260	50 %	0 %	0 %	50 %	407458509
19515	NC_018622	TTG	2	6	1050325	1050330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458509
19516	NC_018622	CAA	2	6	1050337	1050342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458509
19517	NC_018622	TTC	2	6	1050346	1050351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458509
19518	NC_018622	AC	3	6	1050362	1050367	50 %	0 %	0 %	50 %	407458509
19519	NC_018622	AGTA	2	8	1050389	1050396	50 %	25 %	25 %	0 %	407458509
19520	NC_018622	T	6	6	1050397	1050402	0 %	100 %	0 %	0 %	407458509
19521	NC_018622	CCT	2	6	1050435	1050440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458509
19522	NC_018622	TTTA	2	8	1050692	1050699	25 %	75 %	0 %	0 %	407458509
19523	NC_018622	A	6	6	1050713	1050718	100 %	0 %	0 %	0 %	407458509
19524	NC_018622	CTG	2	6	1050724	1050729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458509
19525	NC_018622	GAT	2	6	1050735	1050740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458509
19526	NC_018622	TTA	2	6	1050765	1050770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458509
19527	NC_018622	AAG	2	6	1050794	1050799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458509
19528	NC_018622	A	6	6	1050804	1050809	100 %	0 %	0 %	0 %	407458509
19529	NC_018622	TTC	2	6	1050814	1050819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458509
19530	NC_018622	ATT	2	6	1050846	1050851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458509
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19532	NC_018622	TATC	2	8	1050885	1050892	25 %	50 %	0 %	25 %	407458509
19533	NC_018622	CAA	2	6	1050921	1050926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458509
19534	NC_018622	AGA	2	6	1050938	1050943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458509
19535	NC_018622	TTG	2	6	1050975	1050980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458509
19536	NC_018622	TCT	2	6	1051079	1051084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458509
19537	NC_018622	ATC	2	6	1051097	1051102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458509
19538	NC_018622	GTT	2	6	1051113	1051118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458509
19539	NC_018622	TGT	2	6	1051156	1051161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458509
19540	NC_018622	GCA	2	6	1051281	1051286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458509
19541	NC_018622	CTG	2	6	1051306	1051311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458509
19542	NC_018622	GTC	2	6	1051317	1051322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458509
19543	NC_018622	TGG	2	6	1051338	1051343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407458509
19544	NC_018622	TATT	2	8	1051405	1051412	25 %	75 %	0 %	0 %	407458509
19545	NC_018622	AGA	2	6	1051439	1051444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458509
19546	NC_018622	GAAAA	2	10	1051464	1051473	80 %	0 %	20 %	0 %	407458509
19547	NC_018622	TGG	2	6	1051574	1051579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407458509
19548	NC_018622	AGA	3	9	1051604	1051612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458509
19549	NC_018622	AGTC	2	8	1051741	1051748	25 %	25 %	25 %	25 %	407458510
19550	NC_018622	AAG	2	6	1051789	1051794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458510
19551	NC_018622	CAA	2	6	1051815	1051820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458510
19552	NC_018622	TCAGAT	2	12	1051847	1051858	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407458510
19553	NC_018622	TCT	2	6	1051910	1051915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458510
19554	NC_018622	GAA	2	6	1051916	1051921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458510
19555	NC_018622	GAAA	2	8	1051966	1051973	75 %	0 %	25 %	0 %	407458510
19556	NC_018622	GAA	2	6	1051982	1051987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458510
19557	NC_018622	TCC	2	6	1051990	1051995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458510
19558	NC_018622	GGA	2	6	1052006	1052011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407458510
19559	NC_018622	CTT	2	6	1052100	1052105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458510
19560	NC_018622	ATGGC	2	10	1052112	1052121	20 %	20 %	40 %	20 %	407458510
19561	NC_018622	TGT	2	6	1052400	1052405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458511
19562	NC_018622	GCA	2	6	1052434	1052439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458511
19563	NC_018622	CTG	2	6	1052444	1052449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458511
19564	NC_018622	CAA	2	6	1052452	1052457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458511
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19566	NC_018622	CAA	2	6	1052485	1052490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458511
19567	NC_018622	TAG	2	6	1052540	1052545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458511
19568	NC_018622	A	6	6	1052637	1052642	100 %	0 %	0 %	0 %	407458511
19569	NC_018622	TCA	2	6	1052648	1052653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458511
19570	NC_018622	TAA	2	6	1052691	1052696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458511
19571	NC_018622	AGTA	2	8	1052779	1052786	50 %	25 %	25 %	0 %	407458511
19572	NC_018622	TAT	2	6	1052787	1052792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458511
19573	NC_018622	A	6	6	1052890	1052895	100 %	0 %	0 %	0 %	407458511
19574	NC_018622	TAT	2	6	1052901	1052906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458511
19575	NC_018622	GGT	3	9	1052908	1052916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407458511
19576	NC_018622	CAT	2	6	1053060	1053065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458511
19577	NC_018622	AACA	2	8	1053128	1053135	75 %	0 %	0 %	25 %	407458511
19578	NC_018622	GAA	2	6	1053136	1053141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458511
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19580	NC_018622	GTG	2	6	1053227	1053232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407458511
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19584	NC_018622	TCTT	2	8	1053435	1053442	0 %	75 %	0 %	25 %	407458511
19585	NC_018622	CAA	3	9	1053454	1053462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458511
19586	NC_018622	ATC	2	6	1053547	1053552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458511
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19588	NC_018622	TGT	2	6	1053588	1053593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458511
19589	NC_018622	GCA	2	6	1053604	1053609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458511
19590	NC_018622	TTA	2	6	1053721	1053726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458511
19591	NC_018622	CAA	2	6	1053728	1053733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458511
19592	NC_018622	CCT	2	6	1053751	1053756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458511
19593	NC_018622	ATGA	2	8	1053765	1053772	50 %	25 %	25 %	0 %	407458511
19594	NC_018622	CAA	2	6	1053798	1053803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458512
19595	NC_018622	TC	3	6	1053812	1053817	0 %	50 %	0 %	50 %	407458512
19596	NC_018622	GCT	2	6	1053946	1053951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458512
19597	NC_018622	TGA	2	6	1054055	1054060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458512
19598	NC_018622	AGA	2	6	1054139	1054144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458512
19599	NC_018622	GTT	2	6	1054156	1054161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458512
19600	NC_018622	TAT	2	6	1054169	1054174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458512
19601	NC_018622	TCA	2	6	1054184	1054189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458512
19602	NC_018622	CTA	2	6	1054204	1054209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458512
19603	NC_018622	TGCT	2	8	1054216	1054223	0 %	50 %	25 %	25 %	407458512
19604	NC_018622	TTTA	2	8	1054355	1054362	25 %	75 %	0 %	0 %	407458512
19605	NC_018622	AAATC	2	10	1054399	1054408	60 %	20 %	0 %	20 %	407458512
19606	NC_018622	AAAC	2	8	1054449	1054456	75 %	0 %	0 %	25 %	407458512
19607	NC_018622	TAC	2	6	1054569	1054574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458512
19608	NC_018622	TTG	2	6	1054928	1054933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458513
19609	NC_018622	CAG	2	6	1054976	1054981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458513
19610	NC_018622	TTC	2	6	1055032	1055037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458513
19611	NC_018622	CGC	2	6	1055054	1055059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407458513
19612	NC_018622	GCT	3	9	1055076	1055084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458513
19613	NC_018622	AGG	2	6	1055090	1055095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407458513
19614	NC_018622	AAC	2	6	1055107	1055112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458513
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19616	NC_018622	TTG	2	6	1055317	1055322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458513
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19748	NC_018622	T	7	7	1061141	1061147	0 %	100 %	0 %	0 %	407458520
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