MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci WS/RT/E30 chromosome

Total Repeats: 21342

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_018622	TCC	2	6	966991	966996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458446
18003	NC_018622	GCT	2	6	967008	967013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458446
18004	NC_018622	TG	3	6	967027	967032	0 %	50 %	50 %	0 %	407458446
18005	NC_018622	GAG	2	6	967090	967095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407458446
18006	NC_018622	CCT	2	6	967119	967124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458446
18007	NC_018622	A	6	6	967156	967161	100 %	0 %	0 %	0 %	407458446
18008	NC_018622	AGA	2	6	967178	967183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458446
18009	NC_018622	GAA	2	6	967184	967189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458446
18010	NC_018622	CAC	2	6	967217	967222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407458446
18011	NC_018622	GAAA	2	8	967258	967265	75 %	0 %	25 %	0 %	407458446
18012	NC_018622	AGA	2	6	967329	967334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458446
18013	NC_018622	AGG	2	6	967346	967351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407458446
18014	NC_018622	ATC	2	6	967359	967364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458446
18015	NC_018622	GAAGG	2	10	967381	967390	40 %	0 %	60 %	0 %	407458446
18016	NC_018622	AGA	2	6	967436	967441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458446
18017	NC_018622	ATT	2	6	967588	967593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458446
18018	NC_018622	AT	3	6	967710	967715	50 %	50 %	0 %	0 %	407458447
18019	NC_018622	CAA	2	6	967821	967826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458447
18020	NC_018622	GAAA	2	8	967829	967836	75 %	0 %	25 %	0 %	407458447
18021	NC_018622	T	6	6	967847	967852	0 %	100 %	0 %	0 %	407458447
18022	NC_018622	CTC	2	6	967963	967968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458447
18023	NC_018622	CTT	2	6	967978	967983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458447
18024	NC_018622	TTTG	2	8	967995	968002	0 %	75 %	25 %	0 %	407458447
18025	NC_018622	TCC	2	6	968175	968180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458447
18026	NC_018622	CAA	2	6	968182	968187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458447
18027	NC_018622	AGC	2	6	968234	968239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458447
18028	NC_018622	ATA	2	6	968328	968333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458447
18029	NC_018622	CTG	2	6	968443	968448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458447
18030	NC_018622	TCC	2	6	968450	968455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458447
18031	NC_018622	AAT	2	6	968489	968494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458447
18032	NC_018622	TCG	2	6	968541	968546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458447
18033	NC_018622	TC	3	6	968552	968557	0 %	50 %	0 %	50 %	407458447
18034	NC_018622	AG	4	8	968570	968577	50 %	0 %	50 %	0 %	407458447
18035	NC_018622	GAAA	2	8	968589	968596	75 %	0 %	25 %	0 %	407458447
18036	NC_018622	TTC	2	6	968651	968656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458447
18037	NC_018622	TTA	2	6	968682	968687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458447
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18039	NC_018622	TAC	2	6	968702	968707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458447
18040	NC_018622	CTT	2	6	968806	968811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458447
18041	NC_018622	TG	4	8	968834	968841	0 %	50 %	50 %	0 %	407458447
18042	NC_018622	GCT	2	6	968860	968865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458447
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18044	NC_018622	TCT	2	6	968967	968972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458447
18045	NC_018622	A	6	6	968988	968993	100 %	0 %	0 %	0 %	407458447
18046	NC_018622	CAT	2	6	969089	969094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458447
18047	NC_018622	CATC	2	8	969096	969103	25 %	25 %	0 %	50 %	407458447
18048	NC_018622	CCAG	2	8	969105	969112	25 %	0 %	25 %	50 %	407458447
18049	NC_018622	TC	3	6	969250	969255	0 %	50 %	0 %	50 %	407458447
18050	NC_018622	CAT	2	6	969322	969327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458447
18051	NC_018622	AGACA	2	10	969377	969386	60 %	0 %	20 %	20 %	407458447
18052	NC_018622	ATATCT	2	12	969558	969569	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407458447
18053	NC_018622	T	6	6	969878	969883	0 %	100 %	0 %	0 %	407458448
18054	NC_018622	TCT	2	6	969918	969923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458448
18055	NC_018622	GAAT	2	8	969973	969980	50 %	25 %	25 %	0 %	407458448
18056	NC_018622	T	7	7	969994	970000	0 %	100 %	0 %	0 %	407458448
18057	NC_018622	AC	3	6	970091	970096	50 %	0 %	0 %	50 %	407458448
18058	NC_018622	TTC	2	6	970113	970118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458448
18059	NC_018622	TTGCTT	2	12	970168	970179	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	407458448
18060	NC_018622	GAT	2	6	970245	970250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458448
18061	NC_018622	CTT	2	6	970365	970370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458448
18062	NC_018622	GTG	2	6	970378	970383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407458448
18063	NC_018622	AGC	2	6	970397	970402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458448
18064	NC_018622	CTC	2	6	970405	970410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458448
18065	NC_018622	CAG	2	6	970477	970482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458448
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18070	NC_018622	AAG	2	6	970894	970899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458448
18071	NC_018622	AGA	2	6	970910	970915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458448
18072	NC_018622	GTG	2	6	970942	970947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407458448
18073	NC_018622	TCT	4	12	970974	970985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458448
18074	NC_018622	CATC	2	8	970987	970994	25 %	25 %	0 %	50 %	407458448
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18077	NC_018622	GA	3	6	971197	971202	50 %	0 %	50 %	0 %	407458448
18078	NC_018622	TTG	2	6	971212	971217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458448
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18086	NC_018622	TTAT	2	8	972099	972106	25 %	75 %	0 %	0 %	407458449
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18089	NC_018622	ACA	2	6	972199	972204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458449
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18091	NC_018622	ACT	2	6	972257	972262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458449
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18095	NC_018622	AT	3	6	972429	972434	50 %	50 %	0 %	0 %	407458449
18096	NC_018622	CTAT	2	8	972481	972488	25 %	50 %	0 %	25 %	407458450
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18101	NC_018622	TCTT	2	8	972642	972649	0 %	75 %	0 %	25 %	407458450
18102	NC_018622	CCT	2	6	972664	972669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458450
18103	NC_018622	TCA	2	6	972682	972687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458450
18104	NC_018622	A	6	6	972766	972771	100 %	0 %	0 %	0 %	407458450
18105	NC_018622	AAC	2	6	972789	972794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458450
18106	NC_018622	GATC	2	8	972891	972898	25 %	25 %	25 %	25 %	407458450
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18110	NC_018622	ATC	2	6	973033	973038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458450
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18113	NC_018622	TTG	2	6	973400	973405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458450
18114	NC_018622	TATC	2	8	973413	973420	25 %	50 %	0 %	25 %	407458450
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18118	NC_018622	TACAA	2	10	973522	973531	60 %	20 %	0 %	20 %	407458450
18119	NC_018622	AAG	2	6	973547	973552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458450
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18491	NC_018622	AT	3	6	997675	997680	50 %	50 %	0 %	0 %	407458465
18492	NC_018622	TTGG	2	8	997720	997727	0 %	50 %	50 %	0 %	407458465
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