MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci WS/RT/E30 chromosome

Total Repeats: 21342

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_018622	GCT	2	6	854629	854634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458338
16002	NC_018622	T	6	6	854663	854668	0 %	100 %	0 %	0 %	407458338
16003	NC_018622	CGC	2	6	854735	854740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407458338
16004	NC_018622	TCA	2	6	855022	855027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458339
16005	NC_018622	CTT	2	6	855047	855052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458339
16006	NC_018622	T	6	6	855075	855080	0 %	100 %	0 %	0 %	407458339
16007	NC_018622	TCTTTC	2	12	855085	855096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458339
16008	NC_018622	TACA	2	8	855137	855144	50 %	25 %	0 %	25 %	407458339
16009	NC_018622	CAG	2	6	855242	855247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458339
16010	NC_018622	TCTG	2	8	855278	855285	0 %	50 %	25 %	25 %	407458339
16011	NC_018622	CAAA	2	8	855784	855791	75 %	0 %	0 %	25 %	407458340
16012	NC_018622	A	6	6	855789	855794	100 %	0 %	0 %	0 %	407458340
16013	NC_018622	AG	3	6	855850	855855	50 %	0 %	50 %	0 %	407458340
16014	NC_018622	CT	3	6	855864	855869	0 %	50 %	0 %	50 %	407458340
16015	NC_018622	CTT	2	6	855903	855908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458340
16016	NC_018622	TCT	2	6	855944	855949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458340
16017	NC_018622	TTA	2	6	855959	855964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458340
16018	NC_018622	A	7	7	856014	856020	100 %	0 %	0 %	0 %	407458340
16019	NC_018622	AAG	2	6	856106	856111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458340
16020	NC_018622	TGT	2	6	856208	856213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458340
16021	NC_018622	AAG	2	6	856357	856362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458341
16022	NC_018622	TAT	2	6	856424	856429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458341
16023	NC_018622	GTTTT	2	10	856477	856486	0 %	80 %	20 %	0 %	407458341
16024	NC_018622	ACT	2	6	856524	856529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458341
16025	NC_018622	CTT	2	6	856549	856554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458341
16026	NC_018622	TTTCT	2	10	856555	856564	0 %	80 %	0 %	20 %	407458341
16027	NC_018622	TCT	2	6	856578	856583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458341
16028	NC_018622	TGG	2	6	856631	856636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407458341
16029	NC_018622	GAA	2	6	856740	856745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458341
16030	NC_018622	TTC	2	6	856826	856831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458341
16031	NC_018622	CAA	2	6	856887	856892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458341
16032	NC_018622	AGG	2	6	856979	856984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407458341
16033	NC_018622	AAG	2	6	857044	857049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458341
16034	NC_018622	AGA	3	9	857105	857113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458341
16035	NC_018622	TAT	2	6	857120	857125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458341
16036	NC_018622	ATA	2	6	857186	857191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458342
16037	NC_018622	TAC	2	6	857290	857295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458342
16038	NC_018622	GAG	2	6	857310	857315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407458342
16039	NC_018622	CTA	2	6	857316	857321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458342
16040	NC_018622	GTT	2	6	857351	857356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458342
16041	NC_018622	T	6	6	857355	857360	0 %	100 %	0 %	0 %	407458342
16042	NC_018622	AGT	2	6	857365	857370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458342
16043	NC_018622	TTC	2	6	857479	857484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458342
16044	NC_018622	CAT	2	6	857541	857546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458342
16045	NC_018622	GAC	2	6	857677	857682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458342
16046	NC_018622	CTTT	2	8	857846	857853	0 %	75 %	0 %	25 %	407458343
16047	NC_018622	AAT	2	6	857939	857944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458343
16048	NC_018622	GTT	2	6	857972	857977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458343
16049	NC_018622	GAA	2	6	857996	858001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458343
16050	NC_018622	ATC	2	6	858012	858017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458343
16051	NC_018622	CTA	2	6	858044	858049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458343
16052	NC_018622	AAC	2	6	858135	858140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458343
16053	NC_018622	ATT	2	6	858366	858371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458343
16054	NC_018622	TTC	2	6	858381	858386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458343
16055	NC_018622	AAT	2	6	858419	858424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458343
16056	NC_018622	CAT	2	6	858443	858448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458343
16057	NC_018622	TTC	2	6	858468	858473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458343
16058	NC_018622	A	8	8	858476	858483	100 %	0 %	0 %	0 %	407458343
16059	NC_018622	GCA	2	6	858703	858708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458344
16060	NC_018622	A	6	6	858735	858740	100 %	0 %	0 %	0 %	407458344
16061	NC_018622	TTA	2	6	858751	858756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458344
16062	NC_018622	TTCT	2	8	858821	858828	0 %	75 %	0 %	25 %	407458344
16063	NC_018622	ACG	2	6	858831	858836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458344
16064	NC_018622	ACGT	2	8	858849	858856	25 %	25 %	25 %	25 %	407458344
16065	NC_018622	GCAA	2	8	858899	858906	50 %	0 %	25 %	25 %	407458344
16066	NC_018622	TCT	2	6	858997	859002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458344
16067	NC_018622	GAAA	2	8	859107	859114	75 %	0 %	25 %	0 %	407458344
16068	NC_018622	ATG	2	6	859156	859161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458344
16069	NC_018622	TAG	2	6	859162	859167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458344
16070	NC_018622	TAA	2	6	859181	859186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458344
16071	NC_018622	ATC	2	6	859260	859265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458344
16072	NC_018622	GC	3	6	859282	859287	0 %	0 %	50 %	50 %	407458344
16073	NC_018622	CGTATG	2	12	859350	859361	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407458344
16074	NC_018622	CTT	2	6	859367	859372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458344
16075	NC_018622	AATA	2	8	859387	859394	75 %	25 %	0 %	0 %	407458344
16076	NC_018622	CTA	2	6	859451	859456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458344
16077	NC_018622	CTG	2	6	859463	859468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458344
16078	NC_018622	CTT	2	6	859771	859776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458345
16079	NC_018622	CATC	2	8	859844	859851	25 %	25 %	0 %	50 %	407458345
16080	NC_018622	GCT	2	6	859905	859910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458345
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16082	NC_018622	T	6	6	859976	859981	0 %	100 %	0 %	0 %	407458345
16083	NC_018622	ATAAAT	2	12	859996	860007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458345
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16085	NC_018622	ATC	2	6	860108	860113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458345
16086	NC_018622	ATC	2	6	860159	860164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458345
16087	NC_018622	ATA	2	6	860301	860306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458345
16088	NC_018622	ATG	2	6	860404	860409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458345
16089	NC_018622	TAA	2	6	860531	860536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458345
16090	NC_018622	ATA	2	6	860555	860560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458345
16091	NC_018622	GTTAGC	2	12	860684	860695	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407458345
16092	NC_018622	CTT	2	6	860698	860703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458345
16093	NC_018622	CTG	2	6	860839	860844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458345
16094	NC_018622	AAC	2	6	860890	860895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458345
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16097	NC_018622	TA	3	6	861022	861027	50 %	50 %	0 %	0 %	407458345
16098	NC_018622	TTC	2	6	861062	861067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458345
16099	NC_018622	CAT	2	6	861115	861120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458345
16100	NC_018622	CTG	2	6	861146	861151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458345
16101	NC_018622	AAAT	2	8	861167	861174	75 %	25 %	0 %	0 %	407458345
16102	NC_018622	TCA	2	6	861219	861224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458345
16103	NC_018622	TTCT	2	8	861231	861238	0 %	75 %	0 %	25 %	407458345
16104	NC_018622	TCCAG	2	10	861416	861425	20 %	20 %	20 %	40 %	407458345
16105	NC_018622	AGCAT	2	10	861456	861465	40 %	20 %	20 %	20 %	407458345
16106	NC_018622	CTGTA	2	10	861503	861512	20 %	40 %	20 %	20 %	407458345
16107	NC_018622	ATC	2	6	861632	861637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458345
16108	NC_018622	A	6	6	861676	861681	100 %	0 %	0 %	0 %	407458345
16109	NC_018622	TTGA	2	8	861713	861720	25 %	50 %	25 %	0 %	407458345
16110	NC_018622	AT	3	6	861775	861780	50 %	50 %	0 %	0 %	407458345
16111	NC_018622	AGC	2	6	861945	861950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458345
16112	NC_018622	GCT	2	6	861954	861959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458345
16113	NC_018622	AGCA	2	8	862070	862077	50 %	0 %	25 %	25 %	407458345
16114	NC_018622	TGT	2	6	862088	862093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458345
16115	NC_018622	AAAT	2	8	862117	862124	75 %	25 %	0 %	0 %	407458345
16116	NC_018622	ATTT	2	8	862141	862148	25 %	75 %	0 %	0 %	407458345
16117	NC_018622	CAT	2	6	862180	862185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458345
16118	NC_018622	CTT	2	6	862189	862194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458345
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16120	NC_018622	CAA	2	6	862315	862320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458345
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16475	NC_018622	T	6	6	881475	881480	0 %	100 %	0 %	0 %	407458358
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16479	NC_018622	A	7	7	881574	881580	100 %	0 %	0 %	0 %	407458358
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16482	NC_018622	TGC	2	6	881684	881689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458358
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