MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci VS225 chromosome

Total Repeats: 21840

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_018621	TGC	2	6	158435	158440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456339
3002	NC_018621	TGA	2	6	158448	158453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456339
3003	NC_018621	ACG	2	6	158472	158477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456339
3004	NC_018621	TTAT	2	8	158478	158485	25 %	75 %	0 %	0 %	407456339
3005	NC_018621	GTT	2	6	158517	158522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456339
3006	NC_018621	TTG	2	6	158555	158560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456339
3007	NC_018621	TTGT	2	8	158568	158575	0 %	75 %	25 %	0 %	407456339
3008	NC_018621	CTT	2	6	158654	158659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456339
3009	NC_018621	AGCA	2	8	158661	158668	50 %	0 %	25 %	25 %	407456339
3010	NC_018621	T	8	8	158693	158700	0 %	100 %	0 %	0 %	407456339
3011	NC_018621	GAA	2	6	158714	158719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456339
3012	NC_018621	CAA	2	6	158742	158747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456339
3013	NC_018621	TTTA	2	8	158759	158766	25 %	75 %	0 %	0 %	407456339
3014	NC_018621	ATG	2	6	158815	158820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456340
3015	NC_018621	TCT	2	6	158873	158878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456340
3016	NC_018621	TTG	2	6	158944	158949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456340
3017	NC_018621	A	6	6	158983	158988	100 %	0 %	0 %	0 %	407456340
3018	NC_018621	GAA	2	6	159063	159068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456340
3019	NC_018621	TCA	2	6	159092	159097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456340
3020	NC_018621	TCC	2	6	159128	159133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407456340
3021	NC_018621	GTC	2	6	159137	159142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456340
3022	NC_018621	GTT	2	6	159366	159371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456341
3023	NC_018621	TGA	2	6	159449	159454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456341
3024	NC_018621	A	7	7	159657	159663	100 %	0 %	0 %	0 %	407456341
3025	NC_018621	T	7	7	159673	159679	0 %	100 %	0 %	0 %	407456341
3026	NC_018621	CCTT	2	8	159688	159695	0 %	50 %	0 %	50 %	407456341
3027	NC_018621	TTG	2	6	159715	159720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456341
3028	NC_018621	TCT	2	6	159747	159752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456341
3029	NC_018621	ACTG	2	8	159792	159799	25 %	25 %	25 %	25 %	407456341
3030	NC_018621	GGA	2	6	159922	159927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407456341
3031	NC_018621	GAA	2	6	159955	159960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456341
3032	NC_018621	TTC	2	6	159968	159973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456341
3033	NC_018621	TTC	2	6	159977	159982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456341
3034	NC_018621	TTTC	2	8	160452	160459	0 %	75 %	0 %	25 %	407456342
3035	NC_018621	AAG	2	6	160614	160619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456342
3036	NC_018621	CTT	2	6	160729	160734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456342
3037	NC_018621	CTC	2	6	160748	160753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407456342
3038	NC_018621	TGGATT	2	12	160762	160773	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407456342
3039	NC_018621	GA	3	6	160788	160793	50 %	0 %	50 %	0 %	407456342
3040	NC_018621	CGA	2	6	160798	160803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456342
3041	NC_018621	GAA	2	6	160847	160852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456342
3042	NC_018621	AAGGT	2	10	160888	160897	40 %	20 %	40 %	0 %	407456342
3043	NC_018621	CTT	2	6	161037	161042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456343
3044	NC_018621	AC	3	6	161060	161065	50 %	0 %	0 %	50 %	407456343
3045	NC_018621	TCT	2	6	161170	161175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456343
3046	NC_018621	CAG	2	6	161192	161197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456343
3047	NC_018621	T	7	7	161264	161270	0 %	100 %	0 %	0 %	407456343
3048	NC_018621	ATG	2	6	161273	161278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456343
3049	NC_018621	TGT	2	6	161283	161288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456343
3050	NC_018621	GA	3	6	161290	161295	50 %	0 %	50 %	0 %	407456343
3051	NC_018621	A	7	7	161389	161395	100 %	0 %	0 %	0 %	407456343
3052	NC_018621	A	6	6	161399	161404	100 %	0 %	0 %	0 %	407456343
3053	NC_018621	GTA	2	6	161471	161476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456343
3054	NC_018621	AGT	2	6	161527	161532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456343
3055	NC_018621	GGA	2	6	161545	161550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407456343
3056	NC_018621	A	6	6	161634	161639	100 %	0 %	0 %	0 %	407456343
3057	NC_018621	AAG	2	6	161643	161648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456343
3058	NC_018621	ATG	2	6	161679	161684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456343
3059	NC_018621	ATA	2	6	161773	161778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456344
3060	NC_018621	TTTTG	2	10	161827	161836	0 %	80 %	20 %	0 %	407456344
3061	NC_018621	TGTT	2	8	161851	161858	0 %	75 %	25 %	0 %	407456344
3062	NC_018621	T	6	6	161860	161865	0 %	100 %	0 %	0 %	407456344
3063	NC_018621	ACA	2	6	161873	161878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456344
3064	NC_018621	ATA	2	6	161897	161902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456344
3065	NC_018621	TAA	2	6	161914	161919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456344
3066	NC_018621	TTG	2	6	161932	161937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456344
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3068	NC_018621	CAG	2	6	161968	161973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456344
3069	NC_018621	GGGGC	2	10	161974	161983	0 %	0 %	80 %	20 %	407456344
3070	NC_018621	GAC	2	6	162051	162056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456344
3071	NC_018621	AGGC	2	8	162061	162068	25 %	0 %	50 %	25 %	407456344
3072	NC_018621	AGA	2	6	162086	162091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456344
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3080	NC_018621	AG	3	6	162455	162460	50 %	0 %	50 %	0 %	407456345
3081	NC_018621	T	7	7	162464	162470	0 %	100 %	0 %	0 %	407456345
3082	NC_018621	ATA	2	6	162491	162496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456345
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3087	NC_018621	T	6	6	162611	162616	0 %	100 %	0 %	0 %	407456345
3088	NC_018621	T	7	7	162661	162667	0 %	100 %	0 %	0 %	407456345
3089	NC_018621	TGT	2	6	162702	162707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456345
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3091	NC_018621	ATG	2	6	162834	162839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456345
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3093	NC_018621	AGCAT	2	10	163266	163275	40 %	20 %	20 %	20 %	407456346
3094	NC_018621	GGTG	2	8	163282	163289	0 %	25 %	75 %	0 %	407456346
3095	NC_018621	CT	3	6	163311	163316	0 %	50 %	0 %	50 %	407456346
3096	NC_018621	AAG	2	6	163361	163366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456346
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3100	NC_018621	AGGG	2	8	163477	163484	25 %	0 %	75 %	0 %	407456346
3101	NC_018621	T	6	6	163534	163539	0 %	100 %	0 %	0 %	407456346
3102	NC_018621	CTT	2	6	163549	163554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456346
3103	NC_018621	TTCT	2	8	163628	163635	0 %	75 %	0 %	25 %	407456346
3104	NC_018621	AGT	2	6	163650	163655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456346
3105	NC_018621	GT	3	6	163710	163715	0 %	50 %	50 %	0 %	407456346
3106	NC_018621	A	6	6	163778	163783	100 %	0 %	0 %	0 %	407456346
3107	NC_018621	AAC	2	6	163794	163799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456346
3108	NC_018621	AGC	2	6	163811	163816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456346
3109	NC_018621	TA	3	6	163829	163834	50 %	50 %	0 %	0 %	407456346
3110	NC_018621	A	6	6	163868	163873	100 %	0 %	0 %	0 %	407456346
3111	NC_018621	CTT	2	6	163882	163887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456346
3112	NC_018621	CTG	2	6	163933	163938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456346
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3117	NC_018621	GA	3	6	164326	164331	50 %	0 %	50 %	0 %	407456346
3118	NC_018621	AGA	2	6	164343	164348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456346
3119	NC_018621	AGAA	2	8	164354	164361	75 %	0 %	25 %	0 %	407456346
3120	NC_018621	CTA	2	6	164386	164391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456346
3121	NC_018621	TCA	2	6	164410	164415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456346
3122	NC_018621	CTT	2	6	164600	164605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456347
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3245	NC_018621	TCT	2	6	171531	171536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456354
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3248	NC_018621	GTT	2	6	171742	171747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456354
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3251	NC_018621	TTG	2	6	171881	171886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456354
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3370	NC_018621	TGC	2	6	179018	179023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456361
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3489	NC_018621	CGT	2	6	184776	184781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456368
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3492	NC_018621	TAA	2	6	184925	184930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456368
3493	NC_018621	T	7	7	185002	185008	0 %	100 %	0 %	0 %	407456368
3494	NC_018621	ATG	2	6	185021	185026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456368
3495	NC_018621	T	6	6	185030	185035	0 %	100 %	0 %	0 %	407456368
3496	NC_018621	CCA	2	6	185061	185066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407456368
3497	NC_018621	TCC	2	6	185112	185117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407456368
3498	NC_018621	A	6	6	185242	185247	100 %	0 %	0 %	0 %	407456368
3499	NC_018621	CTT	2	6	185257	185262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456368
3500	NC_018621	AAT	2	6	185298	185303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456368

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