MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci VS225 chromosome

Total Repeats: 21840

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_018621	GAA	2	6	1141240	1141245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457265
21502	NC_018621	TTG	2	6	1141256	1141261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457265
21503	NC_018621	TTA	2	6	1141342	1141347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457265
21504	NC_018621	AGT	2	6	1141360	1141365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457265
21505	NC_018621	TA	3	6	1141520	1141525	50 %	50 %	0 %	0 %	407457265
21506	NC_018621	CTTT	2	8	1141583	1141590	0 %	75 %	0 %	25 %	407457265
21507	NC_018621	GCT	2	6	1141594	1141599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457265
21508	NC_018621	CTT	2	6	1141625	1141630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457265
21509	NC_018621	CTT	2	6	1141691	1141696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457265
21510	NC_018621	AAG	2	6	1141713	1141718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457265
21511	NC_018621	TGAT	2	8	1141885	1141892	25 %	50 %	25 %	0 %	407457265
21512	NC_018621	TCT	2	6	1142072	1142077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457266
21513	NC_018621	CAG	2	6	1142124	1142129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457266
21514	NC_018621	TA	3	6	1142200	1142205	50 %	50 %	0 %	0 %	407457266
21515	NC_018621	GAG	2	6	1142214	1142219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407457266
21516	NC_018621	TAATCC	2	12	1142236	1142247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457266
21517	NC_018621	CTA	2	6	1142283	1142288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457266
21518	NC_018621	TTG	2	6	1142346	1142351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457266
21519	NC_018621	TAA	2	6	1142356	1142361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457266
21520	NC_018621	TCA	2	6	1142402	1142407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457266
21521	NC_018621	CTT	2	6	1142437	1142442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457266
21522	NC_018621	AATA	2	8	1142469	1142476	75 %	25 %	0 %	0 %	407457266
21523	NC_018621	T	6	6	1142491	1142496	0 %	100 %	0 %	0 %	407457266
21524	NC_018621	GTT	3	9	1142513	1142521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457266
21525	NC_018621	CAA	2	6	1142529	1142534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457266
21526	NC_018621	CTC	2	6	1142608	1142613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457266
21527	NC_018621	ATC	2	6	1142629	1142634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457266
21528	NC_018621	ATGAAC	2	12	1142635	1142646	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407457266
21529	NC_018621	TCC	2	6	1142719	1142724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457267
21530	NC_018621	GAA	2	6	1142747	1142752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457267
21531	NC_018621	CCA	2	6	1142800	1142805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407457267
21532	NC_018621	TCC	2	6	1142837	1142842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457267
21533	NC_018621	AGA	2	6	1142858	1142863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457267
21534	NC_018621	GTT	2	6	1142866	1142871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457267
21535	NC_018621	AGA	2	6	1142894	1142899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457267
21536	NC_018621	AAT	2	6	1142948	1142953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457267
21537	NC_018621	TTC	2	6	1142961	1142966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457267
21538	NC_018621	A	7	7	1143037	1143043	100 %	0 %	0 %	0 %	407457267
21539	NC_018621	TGC	3	9	1143150	1143158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457268
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21541	NC_018621	GTAA	2	8	1143197	1143204	50 %	25 %	25 %	0 %	407457268
21542	NC_018621	TGT	2	6	1143217	1143222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457268
21543	NC_018621	CAT	2	6	1143266	1143271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457268
21544	NC_018621	CAA	2	6	1143279	1143284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457268
21545	NC_018621	AAT	2	6	1143411	1143416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457268
21546	NC_018621	CAA	2	6	1143440	1143445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457268
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21548	NC_018621	GGA	2	6	1143526	1143531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407457268
21549	NC_018621	TGAT	2	8	1143544	1143551	25 %	50 %	25 %	0 %	407457268
21550	NC_018621	TAA	3	9	1143555	1143563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457268
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21552	NC_018621	CAT	2	6	1143611	1143616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457268
21553	NC_018621	CT	3	6	1143647	1143652	0 %	50 %	0 %	50 %	407457268
21554	NC_018621	TAA	2	6	1143653	1143658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457268
21555	NC_018621	TCAA	2	8	1143769	1143776	50 %	25 %	0 %	25 %	407457268
21556	NC_018621	TTGC	2	8	1143797	1143804	0 %	50 %	25 %	25 %	407457268
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21558	NC_018621	AT	3	6	1143877	1143882	50 %	50 %	0 %	0 %	407457268
21559	NC_018621	A	6	6	1143931	1143936	100 %	0 %	0 %	0 %	407457268
21560	NC_018621	GTA	2	6	1143937	1143942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457268
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21562	NC_018621	TAG	2	6	1144046	1144051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457268
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21566	NC_018621	A	7	7	1144287	1144293	100 %	0 %	0 %	0 %	407457268
21567	NC_018621	CAA	2	6	1144323	1144328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457268
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21572	NC_018621	AAG	2	6	1144663	1144668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457269
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21590	NC_018621	T	6	6	1145590	1145595	0 %	100 %	0 %	0 %	407457270
21591	NC_018621	T	6	6	1145638	1145643	0 %	100 %	0 %	0 %	407457270
21592	NC_018621	TCCA	2	8	1145660	1145667	25 %	25 %	0 %	50 %	407457270
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21599	NC_018621	TTTC	2	8	1145780	1145787	0 %	75 %	0 %	25 %	407457270
21600	NC_018621	AAGA	2	8	1145828	1145835	75 %	0 %	25 %	0 %	407457270
21601	NC_018621	GAC	2	6	1145883	1145888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457270
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21614	NC_018621	CT	3	6	1146238	1146243	0 %	50 %	0 %	50 %	407457270
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