MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci VS225 chromosome

Total Repeats: 21840

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19502	NC_018621	ACTTT	2	10	1041419	1041428	20 %	60 %	0 %	20 %	407457171
19503	NC_018621	CTT	2	6	1041438	1041443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457171
19504	NC_018621	GTA	2	6	1041527	1041532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457171
19505	NC_018621	TA	3	6	1041664	1041669	50 %	50 %	0 %	0 %	407457171
19506	NC_018621	GCA	3	9	1041677	1041685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457171
19507	NC_018621	AAAG	2	8	1041891	1041898	75 %	0 %	25 %	0 %	407457171
19508	NC_018621	CGT	2	6	1041916	1041921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457171
19509	NC_018621	ATT	2	6	1042116	1042121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457172
19510	NC_018621	AAT	2	6	1042142	1042147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457172
19511	NC_018621	CCT	2	6	1042212	1042217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457172
19512	NC_018621	TAG	2	6	1042243	1042248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457172
19513	NC_018621	CTC	2	6	1042342	1042347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457172
19514	NC_018621	AC	3	6	1042377	1042382	50 %	0 %	0 %	50 %	407457172
19515	NC_018621	TGT	2	6	1042518	1042523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457172
19516	NC_018621	CAA	2	6	1042578	1042583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457172
19517	NC_018621	AGA	2	6	1042600	1042605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457172
19518	NC_018621	ACG	2	6	1042675	1042680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457172
19519	NC_018621	AAT	2	6	1042690	1042695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457172
19520	NC_018621	ATT	2	6	1042720	1042725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457172
19521	NC_018621	GTA	2	6	1042763	1042768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457172
19522	NC_018621	GCA	2	6	1042787	1042792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457172
19523	NC_018621	CTC	2	6	1042797	1042802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457172
19524	NC_018621	AGG	2	6	1042843	1042848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407457172
19525	NC_018621	CCA	2	6	1042867	1042872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407457172
19526	NC_018621	A	7	7	1042978	1042984	100 %	0 %	0 %	0 %	407457172
19527	NC_018621	ATC	2	6	1043044	1043049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457172
19528	NC_018621	AC	3	6	1043054	1043059	50 %	0 %	0 %	50 %	407457172
19529	NC_018621	CTT	2	6	1043143	1043148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457172
19530	NC_018621	TA	3	6	1043215	1043220	50 %	50 %	0 %	0 %	407457172
19531	NC_018621	TTTC	2	8	1043245	1043252	0 %	75 %	0 %	25 %	407457172
19532	NC_018621	ACT	2	6	1043296	1043301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457172
19533	NC_018621	ATC	2	6	1043302	1043307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457172
19534	NC_018621	CTT	2	6	1043439	1043444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457172
19535	NC_018621	AC	3	6	1043473	1043478	50 %	0 %	0 %	50 %	407457172
19536	NC_018621	TTC	2	6	1043565	1043570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457172
19537	NC_018621	TCG	2	6	1043637	1043642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457172
19538	NC_018621	CTT	2	6	1043859	1043864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457172
19539	NC_018621	AC	3	6	1043982	1043987	50 %	0 %	0 %	50 %	407457173
19540	NC_018621	CCA	2	6	1044073	1044078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407457173
19541	NC_018621	AAT	2	6	1044156	1044161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457173
19542	NC_018621	TTG	2	6	1044162	1044167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457173
19543	NC_018621	CAG	2	6	1044317	1044322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457173
19544	NC_018621	ACG	2	6	1044351	1044356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457173
19545	NC_018621	ATA	2	6	1044367	1044372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457173
19546	NC_018621	TCA	2	6	1044376	1044381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457173
19547	NC_018621	TCA	2	6	1044385	1044390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457173
19548	NC_018621	CTA	2	6	1044416	1044421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457173
19549	NC_018621	C	6	6	1044423	1044428	0 %	0 %	0 %	100 %	407457173
19550	NC_018621	GAT	2	6	1044435	1044440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457173
19551	NC_018621	GGT	2	6	1044450	1044455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407457173
19552	NC_018621	TCC	2	6	1044456	1044461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457173
19553	NC_018621	AAT	2	6	1044471	1044476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457173
19554	NC_018621	GCT	2	6	1044520	1044525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457173
19555	NC_018621	TGC	2	6	1044650	1044655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457173
19556	NC_018621	TTAA	2	8	1044673	1044680	50 %	50 %	0 %	0 %	407457173
19557	NC_018621	TTCC	2	8	1044692	1044699	0 %	50 %	0 %	50 %	407457173
19558	NC_018621	A	7	7	1044920	1044926	100 %	0 %	0 %	0 %	407457173
19559	NC_018621	TTG	2	6	1044958	1044963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457173
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19563	NC_018621	TCA	3	9	1045073	1045081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457174
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19585	NC_018621	CCA	2	6	1045815	1045820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407457174
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19587	NC_018621	TAA	2	6	1045891	1045896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457174
19588	NC_018621	CGAA	2	8	1045981	1045988	50 %	0 %	25 %	25 %	407457174
19589	NC_018621	ATG	2	6	1046032	1046037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457174
19590	NC_018621	TA	3	6	1046076	1046081	50 %	50 %	0 %	0 %	407457174
19591	NC_018621	CAT	2	6	1046124	1046129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457174
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19601	NC_018621	T	7	7	1046746	1046752	0 %	100 %	0 %	0 %	407457175
19602	NC_018621	TCA	2	6	1046874	1046879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457175
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19609	NC_018621	CG	3	6	1047095	1047100	0 %	0 %	50 %	50 %	407457175
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19612	NC_018621	ATC	2	6	1047146	1047151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457175
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