MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci 84/55 chromosome

Total Repeats: 21909

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_018619	CAT	2	6	698756	698761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454164
13002	NC_018619	CTC	2	6	698846	698851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407454164
13003	NC_018619	CAT	2	6	698852	698857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454164
13004	NC_018619	C	6	6	698914	698919	0 %	0 %	0 %	100 %	407454164
13005	NC_018619	TGATC	2	10	699018	699027	20 %	40 %	20 %	20 %	407454164
13006	NC_018619	TAAA	2	8	699068	699075	75 %	25 %	0 %	0 %	407454164
13007	NC_018619	AC	3	6	699077	699082	50 %	0 %	0 %	50 %	407454164
13008	NC_018619	TAA	2	6	699089	699094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407454164
13009	NC_018619	ATC	2	6	699124	699129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454164
13010	NC_018619	CTA	2	6	699161	699166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454164
13011	NC_018619	AAT	2	6	699174	699179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407454164
13012	NC_018619	GTT	2	6	699271	699276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407454164
13013	NC_018619	CG	3	6	699282	699287	0 %	0 %	50 %	50 %	407454164
13014	NC_018619	TC	3	6	699343	699348	0 %	50 %	0 %	50 %	407454164
13015	NC_018619	CAA	2	6	699646	699651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454165
13016	NC_018619	GAA	2	6	699675	699680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454165
13017	NC_018619	TACCT	2	10	699683	699692	20 %	40 %	0 %	40 %	407454165
13018	NC_018619	GAA	2	6	699777	699782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454165
13019	NC_018619	GGTAA	2	10	699793	699802	40 %	20 %	40 %	0 %	407454165
13020	NC_018619	ATT	2	6	699825	699830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407454165
13021	NC_018619	ATC	2	6	699917	699922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454165
13022	NC_018619	AAAG	2	8	699948	699955	75 %	0 %	25 %	0 %	407454165
13023	NC_018619	TGT	2	6	699960	699965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407454165
13024	NC_018619	TCT	2	6	700110	700115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454165
13025	NC_018619	AAC	2	6	700175	700180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454165
13026	NC_018619	GAT	2	6	700192	700197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454165
13027	NC_018619	A	7	7	700222	700228	100 %	0 %	0 %	0 %	407454165
13028	NC_018619	T	6	6	700234	700239	0 %	100 %	0 %	0 %	407454165
13029	NC_018619	AC	3	6	700316	700321	50 %	0 %	0 %	50 %	407454165
13030	NC_018619	CAA	2	6	700384	700389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454165
13031	NC_018619	AAT	2	6	700397	700402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407454165
13032	NC_018619	TC	3	6	700451	700456	0 %	50 %	0 %	50 %	407454165
13033	NC_018619	TCT	2	6	700572	700577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454165
13034	NC_018619	TCT	2	6	700662	700667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454165
13035	NC_018619	ATC	2	6	700670	700675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454165
13036	NC_018619	CAC	2	6	700685	700690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407454165
13037	NC_018619	GA	3	6	700739	700744	50 %	0 %	50 %	0 %	407454165
13038	NC_018619	CGA	2	6	700747	700752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407454165
13039	NC_018619	CT	3	6	700805	700810	0 %	50 %	0 %	50 %	407454165
13040	NC_018619	ACA	2	6	700813	700818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454165
13041	NC_018619	TCT	2	6	700848	700853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454165
13042	NC_018619	TGC	2	6	700892	700897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407454165
13043	NC_018619	ACA	2	6	700909	700914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454165
13044	NC_018619	CCA	2	6	700926	700931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407454165
13045	NC_018619	GCA	2	6	700932	700937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407454165
13046	NC_018619	A	7	7	701011	701017	100 %	0 %	0 %	0 %	407454165
13047	NC_018619	GCGT	2	8	701074	701081	0 %	25 %	50 %	25 %	407454165
13048	NC_018619	CT	3	6	701152	701157	0 %	50 %	0 %	50 %	407454165
13049	NC_018619	ATA	2	6	701365	701370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407454165
13050	NC_018619	TGC	2	6	701385	701390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407454165
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13052	NC_018619	TCATA	2	10	701419	701428	40 %	40 %	0 %	20 %	407454165
13053	NC_018619	GAA	2	6	701455	701460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454165
13054	NC_018619	ATA	2	6	701462	701467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407454165
13055	NC_018619	ATC	2	6	701474	701479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454165
13056	NC_018619	TTC	2	6	701480	701485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454165
13057	NC_018619	AG	4	8	701499	701506	50 %	0 %	50 %	0 %	407454165
13058	NC_018619	TGCA	2	8	701532	701539	25 %	25 %	25 %	25 %	407454165
13059	NC_018619	ATT	2	6	701598	701603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407454166
13060	NC_018619	ACGATG	2	12	701604	701615	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407454166
13061	NC_018619	ATC	2	6	701628	701633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454166
13062	NC_018619	CAC	2	6	701752	701757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407454166
13063	NC_018619	CATAT	2	10	701775	701784	40 %	40 %	0 %	20 %	407454166
13064	NC_018619	CTG	2	6	701816	701821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407454166
13065	NC_018619	CAC	2	6	701867	701872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407454166
13066	NC_018619	AGC	2	6	701952	701957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407454166
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13069	NC_018619	TCC	2	6	702231	702236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407454166
13070	NC_018619	CTT	2	6	702281	702286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454166
13071	NC_018619	TCT	3	9	702289	702297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454166
13072	NC_018619	TAA	2	6	702327	702332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407454166
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13077	NC_018619	ATA	2	6	702737	702742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407454166
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13086	NC_018619	AG	3	6	703170	703175	50 %	0 %	50 %	0 %	407454166
13087	NC_018619	TTG	2	6	703193	703198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407454166
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13091	NC_018619	CTT	2	6	703688	703693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454167
13092	NC_018619	GAA	2	6	703751	703756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454167
13093	NC_018619	ACA	2	6	703830	703835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454167
13094	NC_018619	CAA	2	6	703889	703894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454167
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13100	NC_018619	T	6	6	704220	704225	0 %	100 %	0 %	0 %	407454168
13101	NC_018619	A	6	6	704234	704239	100 %	0 %	0 %	0 %	407454168
13102	NC_018619	TAA	2	6	704626	704631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407454169
13103	NC_018619	CAAG	2	8	704658	704665	50 %	0 %	25 %	25 %	407454169
13104	NC_018619	CCAA	2	8	704667	704674	50 %	0 %	0 %	50 %	407454169
13105	NC_018619	AAC	2	6	704690	704695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454169
13106	NC_018619	CCA	2	6	704715	704720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407454169
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13109	NC_018619	CTA	2	6	704770	704775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454169
13110	NC_018619	TGC	2	6	704777	704782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407454169
13111	NC_018619	TTA	2	6	704823	704828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407454169
13112	NC_018619	AGC	2	6	704876	704881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407454169
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13363	NC_018619	TAA	2	6	718442	718447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407454178
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13478	NC_018619	A	6	6	726034	726039	100 %	0 %	0 %	0 %	407454188
13479	NC_018619	ATACT	2	10	726164	726173	40 %	40 %	0 %	20 %	407454188
13480	NC_018619	GCA	2	6	726184	726189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407454188
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