MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci 84/55 chromosome

Total Repeats: 21909

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_018619	GAA	2	6	670226	670231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454139
12502	NC_018619	AGG	2	6	670266	670271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407454140
12503	NC_018619	TCC	2	6	670279	670284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407454140
12504	NC_018619	CTG	2	6	670301	670306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407454140
12505	NC_018619	CTA	3	9	670318	670326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454140
12506	NC_018619	ATG	2	6	670430	670435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454140
12507	NC_018619	ATC	2	6	670466	670471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454140
12508	NC_018619	TTC	2	6	670476	670481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454140
12509	NC_018619	A	6	6	670540	670545	100 %	0 %	0 %	0 %	407454140
12510	NC_018619	ATC	2	6	670606	670611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454140
12511	NC_018619	ATC	2	6	670640	670645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454140
12512	NC_018619	GGT	2	6	670669	670674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407454140
12513	NC_018619	T	6	6	670701	670706	0 %	100 %	0 %	0 %	407454140
12514	NC_018619	AAAAC	2	10	670801	670810	80 %	0 %	0 %	20 %	407454140
12515	NC_018619	AGA	2	6	671053	671058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454141
12516	NC_018619	TAA	2	6	671107	671112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407454142
12517	NC_018619	TAG	2	6	671127	671132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454142
12518	NC_018619	ACA	2	6	671143	671148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454142
12519	NC_018619	CGC	2	6	671188	671193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407454142
12520	NC_018619	TGA	2	6	671236	671241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454142
12521	NC_018619	GGGAA	2	10	671313	671322	40 %	0 %	60 %	0 %	407454142
12522	NC_018619	TTG	3	9	671394	671402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407454142
12523	NC_018619	TGGA	2	8	671487	671494	25 %	25 %	50 %	0 %	407454142
12524	NC_018619	TAT	2	6	671550	671555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407454142
12525	NC_018619	AAGTA	2	10	671563	671572	60 %	20 %	20 %	0 %	407454142
12526	NC_018619	ACA	2	6	671644	671649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454142
12527	NC_018619	ATC	2	6	671724	671729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454142
12528	NC_018619	GAT	2	6	671734	671739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454142
12529	NC_018619	CTC	2	6	671781	671786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407454142
12530	NC_018619	GCA	2	6	671813	671818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407454142
12531	NC_018619	CTT	2	6	671819	671824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454142
12532	NC_018619	GA	3	6	671890	671895	50 %	0 %	50 %	0 %	407454143
12533	NC_018619	CTT	2	6	671991	671996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454143
12534	NC_018619	ATT	2	6	672003	672008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407454143
12535	NC_018619	AAG	2	6	672082	672087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454143
12536	NC_018619	CT	3	6	672104	672109	0 %	50 %	0 %	50 %	407454143
12537	NC_018619	CAG	2	6	672163	672168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407454143
12538	NC_018619	CTT	2	6	672263	672268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454143
12539	NC_018619	CT	3	6	672288	672293	0 %	50 %	0 %	50 %	407454143
12540	NC_018619	TGT	2	6	672596	672601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407454144
12541	NC_018619	AGG	2	6	672620	672625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407454144
12542	NC_018619	CCAT	2	8	672670	672677	25 %	25 %	0 %	50 %	407454144
12543	NC_018619	GAC	2	6	672678	672683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407454144
12544	NC_018619	TC	3	6	672725	672730	0 %	50 %	0 %	50 %	407454144
12545	NC_018619	A	6	6	672832	672837	100 %	0 %	0 %	0 %	407454144
12546	NC_018619	CTTT	2	8	672844	672851	0 %	75 %	0 %	25 %	407454144
12547	NC_018619	CTC	2	6	672937	672942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407454144
12548	NC_018619	AT	3	6	673081	673086	50 %	50 %	0 %	0 %	407454144
12549	NC_018619	A	7	7	673141	673147	100 %	0 %	0 %	0 %	407454144
12550	NC_018619	ACT	2	6	673153	673158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454144
12551	NC_018619	TTA	2	6	673194	673199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407454144
12552	NC_018619	TA	3	6	673213	673218	50 %	50 %	0 %	0 %	407454144
12553	NC_018619	AGA	2	6	673424	673429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454144
12554	NC_018619	CTC	2	6	673487	673492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407454144
12555	NC_018619	CA	3	6	673504	673509	50 %	0 %	0 %	50 %	407454144
12556	NC_018619	TG	3	6	673678	673683	0 %	50 %	50 %	0 %	407454144
12557	NC_018619	TTAA	2	8	673755	673762	50 %	50 %	0 %	0 %	407454144
12558	NC_018619	ATT	2	6	673773	673778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407454144
12559	NC_018619	A	6	6	673825	673830	100 %	0 %	0 %	0 %	407454144
12560	NC_018619	ACGC	2	8	673867	673874	25 %	0 %	25 %	50 %	407454144
12561	NC_018619	GTG	2	6	674005	674010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407454145
12562	NC_018619	CT	3	6	674033	674038	0 %	50 %	0 %	50 %	407454145
12563	NC_018619	TCA	2	6	674076	674081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454145
12564	NC_018619	A	6	6	674170	674175	100 %	0 %	0 %	0 %	407454145
12565	NC_018619	GAA	2	6	674350	674355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454145
12566	NC_018619	AGA	2	6	674457	674462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454145
12567	NC_018619	CATC	2	8	674512	674519	25 %	25 %	0 %	50 %	407454145
12568	NC_018619	GCTC	2	8	674538	674545	0 %	25 %	25 %	50 %	407454145
12569	NC_018619	GTT	2	6	674550	674555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407454145
12570	NC_018619	AG	3	6	674578	674583	50 %	0 %	50 %	0 %	407454145
12571	NC_018619	A	7	7	674675	674681	100 %	0 %	0 %	0 %	407454145
12572	NC_018619	TAC	2	6	674689	674694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454145
12573	NC_018619	CAT	2	6	674733	674738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454145
12574	NC_018619	GCA	2	6	674755	674760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407454145
12575	NC_018619	TGAT	2	8	674780	674787	25 %	50 %	25 %	0 %	407454145
12576	NC_018619	CA	3	6	674853	674858	50 %	0 %	0 %	50 %	407454145
12577	NC_018619	TAC	2	6	674912	674917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454145
12578	NC_018619	TCCT	2	8	674969	674976	0 %	50 %	0 %	50 %	407454145
12579	NC_018619	ACTCA	2	10	674979	674988	40 %	20 %	0 %	40 %	407454145
12580	NC_018619	T	6	6	675006	675011	0 %	100 %	0 %	0 %	407454145
12581	NC_018619	CAA	2	6	675040	675045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454145
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12586	NC_018619	T	6	6	675164	675169	0 %	100 %	0 %	0 %	407454145
12587	NC_018619	CAA	3	9	675190	675198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454145
12588	NC_018619	T	6	6	675252	675257	0 %	100 %	0 %	0 %	407454145
12589	NC_018619	A	6	6	675260	675265	100 %	0 %	0 %	0 %	407454145
12590	NC_018619	TATC	2	8	675283	675290	25 %	50 %	0 %	25 %	407454145
12591	NC_018619	AGG	2	6	675294	675299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407454145
12592	NC_018619	CCA	2	6	675372	675377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407454145
12593	NC_018619	AAC	2	6	675406	675411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454145
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12595	NC_018619	TTC	2	6	675596	675601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454145
12596	NC_018619	TA	3	6	675603	675608	50 %	50 %	0 %	0 %	407454145
12597	NC_018619	GTT	2	6	675882	675887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407454146
12598	NC_018619	CT	3	6	675913	675918	0 %	50 %	0 %	50 %	407454146
12599	NC_018619	CT	3	6	675999	676004	0 %	50 %	0 %	50 %	407454146
12600	NC_018619	GCTC	2	8	676042	676049	0 %	25 %	25 %	50 %	407454146
12601	NC_018619	GAA	2	6	676151	676156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454146
12602	NC_018619	TCT	2	6	676204	676209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454146
12603	NC_018619	TGA	2	6	676236	676241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454146
12604	NC_018619	TTC	2	6	676355	676360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454146
12605	NC_018619	CTT	2	6	676565	676570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454146
12606	NC_018619	A	7	7	676572	676578	100 %	0 %	0 %	0 %	407454146
12607	NC_018619	TGGG	2	8	676589	676596	0 %	25 %	75 %	0 %	407454146
12608	NC_018619	AGA	2	6	676624	676629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454146
12609	NC_018619	CAT	2	6	676634	676639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454146
12610	NC_018619	TAA	2	6	676717	676722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407454146
12611	NC_018619	TTA	2	6	676769	676774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407454146
12612	NC_018619	CCG	2	6	676814	676819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407454146
12613	NC_018619	ATCA	2	8	676848	676855	50 %	25 %	0 %	25 %	407454146
12614	NC_018619	AGA	2	6	676858	676863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454146
12615	NC_018619	CG	3	6	676880	676885	0 %	0 %	50 %	50 %	407454146
12616	NC_018619	AAG	2	6	676893	676898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454146
12617	NC_018619	CTCA	2	8	676912	676919	25 %	25 %	0 %	50 %	407454146
12618	NC_018619	ATT	2	6	676940	676945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407454146
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12620	NC_018619	CAA	2	6	677169	677174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454146
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