MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni NCTC 11168-BN148

Total Repeats: 35803

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
35501	NC_018521	TTC	2	6	1623040	1623045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403056418
35502	NC_018521	TTTG	2	8	1623049	1623056	0 %	75 %	25 %	0 %	403056418
35503	NC_018521	GAT	2	6	1623208	1623213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403056418
35504	NC_018521	CTA	2	6	1623261	1623266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403056418
35505	NC_018521	CCA	2	6	1623305	1623310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403056418
35506	NC_018521	CCT	2	6	1623323	1623328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403056418
35507	NC_018521	ATT	2	6	1623361	1623366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403056418
35508	NC_018521	GAAG	2	8	1623464	1623471	50 %	0 %	50 %	0 %	403056418
35509	NC_018521	TCT	2	6	1623483	1623488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403056418
35510	NC_018521	T	8	8	1623488	1623495	0 %	100 %	0 %	0 %	403056418
35511	NC_018521	TTG	2	6	1623530	1623535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403056418
35512	NC_018521	TCATTT	2	12	1623560	1623571	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	403056418
35513	NC_018521	T	7	7	1623589	1623595	0 %	100 %	0 %	0 %	403056418
35514	NC_018521	TTTATA	2	12	1623604	1623615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403056418
35515	NC_018521	T	6	6	1623626	1623631	0 %	100 %	0 %	0 %	403056418
35516	NC_018521	TTTA	2	8	1623658	1623665	25 %	75 %	0 %	0 %	403056418
35517	NC_018521	GTT	2	6	1623820	1623825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403056419
35518	NC_018521	TCA	2	6	1623885	1623890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403056419
35519	NC_018521	TCA	2	6	1623913	1623918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403056419
35520	NC_018521	TGG	2	6	1623935	1623940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403056419
35521	NC_018521	TTTC	2	8	1623978	1623985	0 %	75 %	0 %	25 %	403056419
35522	NC_018521	GAA	2	6	1624014	1624019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403056419
35523	NC_018521	CTT	2	6	1624033	1624038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403056419
35524	NC_018521	TCT	2	6	1624101	1624106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403056419
35525	NC_018521	ATA	2	6	1624136	1624141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403056419
35526	NC_018521	A	6	6	1624158	1624163	100 %	0 %	0 %	0 %	403056419
35527	NC_018521	TCA	2	6	1624173	1624178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403056419
35528	NC_018521	T	6	6	1624257	1624262	0 %	100 %	0 %	0 %	403056419
35529	NC_018521	GAT	2	6	1624391	1624396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403056419
35530	NC_018521	A	6	6	1624422	1624427	100 %	0 %	0 %	0 %	403056419
35531	NC_018521	T	7	7	1624442	1624448	0 %	100 %	0 %	0 %	403056419
35532	NC_018521	ATT	2	6	1624544	1624549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403056420
35533	NC_018521	GA	3	6	1624695	1624700	50 %	0 %	50 %	0 %	403056420
35534	NC_018521	AGAAAA	2	12	1624795	1624806	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	403056420
35535	NC_018521	TTC	2	6	1624834	1624839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403056420
35536	NC_018521	T	7	7	1624891	1624897	0 %	100 %	0 %	0 %	403056420
35537	NC_018521	TG	3	6	1624968	1624973	0 %	50 %	50 %	0 %	403056420
35538	NC_018521	CAA	2	6	1624974	1624979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403056420
35539	NC_018521	A	6	6	1625014	1625019	100 %	0 %	0 %	0 %	403056420
35540	NC_018521	TCA	2	6	1625020	1625025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403056420
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35543	NC_018521	T	6	6	1625126	1625131	0 %	100 %	0 %	0 %	403056421
35544	NC_018521	GAA	2	6	1625136	1625141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403056421
35545	NC_018521	A	6	6	1625149	1625154	100 %	0 %	0 %	0 %	403056421
35546	NC_018521	AAT	2	6	1625211	1625216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403056421
35547	NC_018521	AGA	2	6	1625387	1625392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403056421
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35549	NC_018521	TCT	2	6	1625448	1625453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403056421
35550	NC_018521	GGT	2	6	1625499	1625504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403056421
35551	NC_018521	A	6	6	1625556	1625561	100 %	0 %	0 %	0 %	403056421
35552	NC_018521	TA	3	6	1625599	1625604	50 %	50 %	0 %	0 %	403056421
35553	NC_018521	ATG	2	6	1625794	1625799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403056421
35554	NC_018521	CGAAC	2	10	1625805	1625814	40 %	0 %	20 %	40 %	403056421
35555	NC_018521	GAAG	2	8	1626015	1626022	50 %	0 %	50 %	0 %	403056421
35556	NC_018521	TA	3	6	1626025	1626030	50 %	50 %	0 %	0 %	403056421
35557	NC_018521	TAA	2	6	1626077	1626082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403056421
35558	NC_018521	GCT	2	6	1626129	1626134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403056421
35559	NC_018521	AAAG	2	8	1626147	1626154	75 %	0 %	25 %	0 %	403056421
35560	NC_018521	AAC	2	6	1626202	1626207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403056422
35561	NC_018521	TGT	2	6	1626208	1626213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403056422
35562	NC_018521	TGG	2	6	1626226	1626231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403056422
35563	NC_018521	GTA	2	6	1626242	1626247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403056422
35564	NC_018521	A	8	8	1626255	1626262	100 %	0 %	0 %	0 %	403056422
35565	NC_018521	ATT	2	6	1626265	1626270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403056422
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35568	NC_018521	ACAA	2	8	1627042	1627049	75 %	0 %	0 %	25 %	403056423
35569	NC_018521	ATG	2	6	1627069	1627074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403056423
35570	NC_018521	CAAA	2	8	1627106	1627113	75 %	0 %	0 %	25 %	403056423
35571	NC_018521	AAAGGC	2	12	1627119	1627130	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	403056423
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35573	NC_018521	A	6	6	1627309	1627314	100 %	0 %	0 %	0 %	403056423
35574	NC_018521	T	7	7	1627339	1627345	0 %	100 %	0 %	0 %	403056424
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35579	NC_018521	T	6	6	1627469	1627474	0 %	100 %	0 %	0 %	403056424
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35585	NC_018521	CT	3	6	1627662	1627667	0 %	50 %	0 %	50 %	403056424
35586	NC_018521	T	6	6	1627725	1627730	0 %	100 %	0 %	0 %	403056424
35587	NC_018521	CTTT	2	8	1627759	1627766	0 %	75 %	0 %	25 %	403056424
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35589	NC_018521	TAA	2	6	1627904	1627909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403056424
35590	NC_018521	TAT	2	6	1627941	1627946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403056425
35591	NC_018521	GCT	2	6	1627973	1627978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403056425
35592	NC_018521	TCA	2	6	1627992	1627997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403056425
35593	NC_018521	TTGAAG	2	12	1628043	1628054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403056425
35594	NC_018521	TCA	2	6	1628081	1628086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403056425
35595	NC_018521	CTT	2	6	1628172	1628177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403056425
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35597	NC_018521	TCT	2	6	1628267	1628272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403056425
35598	NC_018521	ATA	2	6	1628353	1628358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403056425
35599	NC_018521	T	6	6	1628418	1628423	0 %	100 %	0 %	0 %	403056425
35600	NC_018521	CAT	2	6	1628505	1628510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403056425
35601	NC_018521	TCA	2	6	1628522	1628527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403056425
35602	NC_018521	CTT	2	6	1628528	1628533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403056425
35603	NC_018521	TTC	2	6	1628566	1628571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403056425
35604	NC_018521	TCA	2	6	1628618	1628623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403056425
35605	NC_018521	AAATC	2	10	1628775	1628784	60 %	20 %	0 %	20 %	403056425
35606	NC_018521	GTAAA	2	10	1628970	1628979	60 %	20 %	20 %	0 %	403056425
35607	NC_018521	CTA	2	6	1628994	1628999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403056425
35608	NC_018521	CAT	2	6	1629135	1629140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403056425
35609	NC_018521	TAG	2	6	1629147	1629152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403056425
35610	NC_018521	TGCCAA	2	12	1629422	1629433	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	403056426
35611	NC_018521	TTC	2	6	1629467	1629472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403056426
35612	NC_018521	CTG	2	6	1629565	1629570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403056426
35613	NC_018521	TCA	2	6	1629648	1629653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403056426
35614	NC_018521	T	6	6	1629708	1629713	0 %	100 %	0 %	0 %	403056426
35615	NC_018521	GCA	2	6	1629726	1629731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403056426
35616	NC_018521	CCA	2	6	1629787	1629792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403056426
35617	NC_018521	T	6	6	1629848	1629853	0 %	100 %	0 %	0 %	403056426
35618	NC_018521	T	6	6	1629905	1629910	0 %	100 %	0 %	0 %	403056426
35619	NC_018521	CTTT	2	8	1629936	1629943	0 %	75 %	0 %	25 %	403056426
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35623	NC_018521	CAAA	2	8	1630084	1630091	75 %	0 %	0 %	25 %	403056426
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35719	NC_018521	AGCT	2	8	1636862	1636869	25 %	25 %	25 %	25 %	403056435
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35725	NC_018521	T	6	6	1637183	1637188	0 %	100 %	0 %	0 %	403056435
35726	NC_018521	A	7	7	1637230	1637236	100 %	0 %	0 %	0 %	403056435
35727	NC_018521	ATC	2	6	1637280	1637285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403056435
35728	NC_018521	GT	3	6	1637324	1637329	0 %	50 %	50 %	0 %	403056435
35729	NC_018521	CCA	2	6	1637350	1637355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403056435
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35732	NC_018521	AT	3	6	1637598	1637603	50 %	50 %	0 %	0 %	403056435
35733	NC_018521	CTT	2	6	1637617	1637622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403056435
35734	NC_018521	T	6	6	1637678	1637683	0 %	100 %	0 %	0 %	403056435
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.