MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Portiera aleyrodidarum BT-B chromosome

Total Repeats: 7349

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018507	TAC	2	6	30	35	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402575003
2	NC_018507	GT	3	6	42	47	0 %	50 %	50 %	0 %	402575003
3	NC_018507	TAC	2	6	102	107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402575003
4	NC_018507	TGA	2	6	129	134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402575003
5	NC_018507	ATG	2	6	233	238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402575003
6	NC_018507	A	8	8	360	367	100 %	0 %	0 %	0 %	402575003
7	NC_018507	A	7	7	370	376	100 %	0 %	0 %	0 %	402575003
8	NC_018507	CAG	2	6	377	382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402575003
9	NC_018507	ATT	2	6	386	391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402575003
10	NC_018507	A	6	6	398	403	100 %	0 %	0 %	0 %	402575003
11	NC_018507	TAA	2	6	416	421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402575003
12	NC_018507	CTA	2	6	458	463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402575003
13	NC_018507	TAAT	2	8	503	510	50 %	50 %	0 %	0 %	402575003
14	NC_018507	GCT	3	9	520	528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402575003
15	NC_018507	A	7	7	562	568	100 %	0 %	0 %	0 %	402575003
16	NC_018507	GGT	2	6	586	591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	402575003
17	NC_018507	AT	3	6	602	607	50 %	50 %	0 %	0 %	402575003
18	NC_018507	T	6	6	675	680	0 %	100 %	0 %	0 %	402575003
19	NC_018507	AGG	2	6	681	686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	402575003
20	NC_018507	AGA	2	6	687	692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402575003
21	NC_018507	TAA	2	6	707	712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402575003
22	NC_018507	TA	3	6	715	720	50 %	50 %	0 %	0 %	402575003
23	NC_018507	AGC	2	6	792	797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402575003
24	NC_018507	CAA	2	6	829	834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402575003
25	NC_018507	TA	3	6	853	858	50 %	50 %	0 %	0 %	402575003
26	NC_018507	CTG	2	6	860	865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402575003
27	NC_018507	TAA	2	6	935	940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402575003
28	NC_018507	A	6	6	961	966	100 %	0 %	0 %	0 %	402575003
29	NC_018507	ACT	2	6	988	993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402575003
30	NC_018507	GAT	2	6	1003	1008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402575003
31	NC_018507	ATA	2	6	1009	1014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402575003
32	NC_018507	GGT	2	6	1021	1026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	402575003
33	NC_018507	A	8	8	1049	1056	100 %	0 %	0 %	0 %	402575003
34	NC_018507	T	6	6	1066	1071	0 %	100 %	0 %	0 %	402575003
35	NC_018507	AAG	2	6	1076	1081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402575003
36	NC_018507	AGG	2	6	1134	1139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	402575003
37	NC_018507	GGT	2	6	1213	1218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	402575003
38	NC_018507	A	7	7	1238	1244	100 %	0 %	0 %	0 %	402575003
39	NC_018507	TAC	2	6	1245	1250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402575003
40	NC_018507	CTA	2	6	1256	1261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402575003
41	NC_018507	A	7	7	1261	1267	100 %	0 %	0 %	0 %	402575003
42	NC_018507	T	6	6	1274	1279	0 %	100 %	0 %	0 %	402575003
43	NC_018507	CAG	2	6	1283	1288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402575003
44	NC_018507	GAAA	2	8	1330	1337	75 %	0 %	25 %	0 %	402575003
45	NC_018507	A	7	7	1335	1341	100 %	0 %	0 %	0 %	402575003
46	NC_018507	AAAT	2	8	1350	1357	75 %	25 %	0 %	0 %	402575003
47	NC_018507	TTTGA	2	10	1369	1378	20 %	60 %	20 %	0 %	402575003
48	NC_018507	CTC	2	6	1394	1399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	402575003
49	NC_018507	TAA	2	6	1496	1501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402575003
50	NC_018507	GGT	2	6	1513	1518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	402575003
51	NC_018507	AGA	2	6	1524	1529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402575003
52	NC_018507	AAAT	2	8	1532	1539	75 %	25 %	0 %	0 %	402575003
53	NC_018507	GAT	2	6	1542	1547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402575003
54	NC_018507	AGA	3	9	1569	1577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402575003
55	NC_018507	A	6	6	1579	1584	100 %	0 %	0 %	0 %	402575003
56	NC_018507	GAA	2	6	1588	1593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402575003
57	NC_018507	A	6	6	1659	1664	100 %	0 %	0 %	0 %	402575003
58	NC_018507	A	7	7	1673	1679	100 %	0 %	0 %	0 %	402575003
59	NC_018507	TAAT	2	8	1694	1701	50 %	50 %	0 %	0 %	402575003
60	NC_018507	TGA	2	6	1725	1730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402575003
61	NC_018507	AGA	2	6	1746	1751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402575003
62	NC_018507	TAA	2	6	1755	1760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402575003
63	NC_018507	GAA	2	6	1768	1773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402575003
64	NC_018507	AT	3	6	1783	1788	50 %	50 %	0 %	0 %	402575003
65	NC_018507	A	6	6	1790	1795	100 %	0 %	0 %	0 %	402575003
66	NC_018507	A	8	8	1805	1812	100 %	0 %	0 %	0 %	402575003
67	NC_018507	A	7	7	1841	1847	100 %	0 %	0 %	0 %	402575003
68	NC_018507	TCT	2	6	1858	1863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402575003
69	NC_018507	A	6	6	1867	1872	100 %	0 %	0 %	0 %	402575003
70	NC_018507	TGT	2	6	1881	1886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402575003
71	NC_018507	GAA	2	6	1900	1905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402575003
72	NC_018507	TAA	3	9	1908	1916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402575003
73	NC_018507	ATT	2	6	1955	1960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402575004
74	NC_018507	TAA	2	6	1977	1982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402575004
75	NC_018507	CTG	2	6	1985	1990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402575004
76	NC_018507	A	7	7	2004	2010	100 %	0 %	0 %	0 %	402575004
77	NC_018507	ATC	2	6	2036	2041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402575004
78	NC_018507	TC	3	6	2109	2114	0 %	50 %	0 %	50 %	402575004
79	NC_018507	A	6	6	2123	2128	100 %	0 %	0 %	0 %	402575004
80	NC_018507	CA	3	6	2173	2178	50 %	0 %	0 %	50 %	402575004
81	NC_018507	AAT	2	6	2179	2184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402575004
82	NC_018507	TAA	2	6	2241	2246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402575004
83	NC_018507	CAA	4	12	2247	2258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402575004
84	NC_018507	T	8	8	2457	2464	0 %	100 %	0 %	0 %	402575004
85	NC_018507	ACA	2	6	2469	2474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402575004
86	NC_018507	TGC	2	6	2751	2756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402575004
87	NC_018507	AGG	2	6	2760	2765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	402575004
88	NC_018507	GTA	2	6	2876	2881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402575004
89	NC_018507	ATT	2	6	2952	2957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402575004
90	NC_018507	TTA	2	6	4390	4395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402575005
91	NC_018507	ATAA	2	8	4434	4441	75 %	25 %	0 %	0 %	402575005
92	NC_018507	AGATAA	2	12	4442	4453	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402575005
93	NC_018507	ATA	2	6	4460	4465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402575005
94	NC_018507	GTT	2	6	4492	4497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402575005
95	NC_018507	T	6	6	4496	4501	0 %	100 %	0 %	0 %	402575005
96	NC_018507	AT	3	6	4512	4517	50 %	50 %	0 %	0 %	402575005
97	NC_018507	ATT	2	6	4527	4532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402575005
98	NC_018507	ATA	3	9	4538	4546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402575005
99	NC_018507	CCTATA	2	12	4563	4574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402575005
100	NC_018507	AT	3	6	4618	4623	50 %	50 %	0 %	0 %	402575005
101	NC_018507	CTG	2	6	4642	4647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402575005
102	NC_018507	AAC	2	6	4671	4676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402575005
103	NC_018507	ATT	2	6	4745	4750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402575005
104	NC_018507	GTT	2	6	4782	4787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402575005
105	NC_018507	TAA	2	6	4799	4804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402575005
106	NC_018507	TGCATT	2	12	4842	4853	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	402575005
107	NC_018507	ATT	2	6	4857	4862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402575005
108	NC_018507	GTAA	2	8	4866	4873	50 %	25 %	25 %	0 %	402575005
109	NC_018507	ATT	2	6	4919	4924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402575005
110	NC_018507	AGTA	2	8	4976	4983	50 %	25 %	25 %	0 %	402575005
111	NC_018507	ATT	2	6	4985	4990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402575005
112	NC_018507	A	6	6	4992	4997	100 %	0 %	0 %	0 %	402575005
113	NC_018507	TAT	2	6	5180	5185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402575005
114	NC_018507	AGT	2	6	5195	5200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402575005
115	NC_018507	ATC	2	6	5204	5209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402575005
116	NC_018507	ATA	2	6	5219	5224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402575005
117	NC_018507	ATA	2	6	5246	5251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402575005
118	NC_018507	ATA	2	6	5257	5262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402575005
119	NC_018507	A	6	6	5280	5285	100 %	0 %	0 %	0 %	402575005
120	NC_018507	AGA	2	6	5297	5302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402575005
121	NC_018507	AT	3	6	5310	5315	50 %	50 %	0 %	0 %	402575005
122	NC_018507	TAAA	2	8	5363	5370	75 %	25 %	0 %	0 %	402575005
123	NC_018507	TTA	2	6	5371	5376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402575005
124	NC_018507	AAAG	2	8	5414	5421	75 %	0 %	25 %	0 %	402575005
125	NC_018507	TAA	2	6	5444	5449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402575005
126	NC_018507	ATT	2	6	5472	5477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402575005
127	NC_018507	CTT	2	6	5488	5493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402575005
128	NC_018507	TTTA	2	8	5498	5505	25 %	75 %	0 %	0 %	402575005
129	NC_018507	A	6	6	5518	5523	100 %	0 %	0 %	0 %	402575005
130	NC_018507	ATTAAA	2	12	5544	5555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402575005
131	NC_018507	AAT	2	6	5572	5577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402575005
132	NC_018507	TATC	2	8	5578	5585	25 %	50 %	0 %	25 %	402575005
133	NC_018507	ATT	2	6	5586	5591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402575005
134	NC_018507	ATAAA	2	10	5597	5606	80 %	20 %	0 %	0 %	402575005
135	NC_018507	ATA	2	6	5629	5634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402575005
136	NC_018507	TAA	2	6	5642	5647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402575005
137	NC_018507	TAT	2	6	5651	5656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402575005
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