MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Carsonella ruddii CE isolate Thao2000 chromosome

Total Repeats: 8051

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_018414	T	6	6	161794	161799	0 %	100 %	0 %	0 %	400403977
8002	NC_018414	ATATAA	2	12	161815	161826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403977
8003	NC_018414	A	6	6	161825	161830	100 %	0 %	0 %	0 %	400403977
8004	NC_018414	T	9	9	161831	161839	0 %	100 %	0 %	0 %	400403977
8005	NC_018414	TAA	2	6	161850	161855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403977
8006	NC_018414	TAT	2	6	161874	161879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403977
8007	NC_018414	A	6	6	161900	161905	100 %	0 %	0 %	0 %	400403977
8008	NC_018414	ATTT	2	8	161910	161917	25 %	75 %	0 %	0 %	400403977
8009	NC_018414	A	6	6	161919	161924	100 %	0 %	0 %	0 %	400403977
8010	NC_018414	TAATA	2	10	161946	161955	60 %	40 %	0 %	0 %	400403977
8011	NC_018414	ATTATA	2	12	161959	161970	50 %	50 %	0 %	0 %	400403977
8012	NC_018414	A	10	10	161980	161989	100 %	0 %	0 %	0 %	400403977
8013	NC_018414	T	6	6	162019	162024	0 %	100 %	0 %	0 %	400403977
8014	NC_018414	A	6	6	162035	162040	100 %	0 %	0 %	0 %	400403977
8015	NC_018414	A	6	6	162042	162047	100 %	0 %	0 %	0 %	400403977
8016	NC_018414	TCT	2	6	162050	162055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400403977
8017	NC_018414	T	17	17	162075	162091	0 %	100 %	0 %	0 %	400403977
8018	NC_018414	TAATTT	2	12	162093	162104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403977
8019	NC_018414	TAA	2	6	162105	162110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403977
8020	NC_018414	A	9	9	162137	162145	100 %	0 %	0 %	0 %	400403977
8021	NC_018414	T	6	6	162148	162153	0 %	100 %	0 %	0 %	400403977
8022	NC_018414	A	6	6	162154	162159	100 %	0 %	0 %	0 %	400403977
8023	NC_018414	ATTTT	2	10	162173	162182	20 %	80 %	0 %	0 %	400403977
8024	NC_018414	ATTTT	2	10	162195	162204	20 %	80 %	0 %	0 %	400403977
8025	NC_018414	A	11	11	162214	162224	100 %	0 %	0 %	0 %	400403977
8026	NC_018414	A	6	6	162233	162238	100 %	0 %	0 %	0 %	400403977
8027	NC_018414	TTTAA	2	10	162239	162248	40 %	60 %	0 %	0 %	400403977
8028	NC_018414	TTA	2	6	162249	162254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403977
8029	NC_018414	AAT	2	6	162265	162270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403977
8030	NC_018414	TA	3	6	162273	162278	50 %	50 %	0 %	0 %	400403977
8031	NC_018414	ATA	3	9	162276	162284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403977
8032	NC_018414	AT	3	6	162293	162298	50 %	50 %	0 %	0 %	400403977
8033	NC_018414	AAT	2	6	162305	162310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403977
8034	NC_018414	TTA	2	6	162330	162335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403977
8035	NC_018414	A	6	6	162337	162342	100 %	0 %	0 %	0 %	400403977
8036	NC_018414	T	9	9	162349	162357	0 %	100 %	0 %	0 %	400403977
8037	NC_018414	ATT	2	6	162359	162364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403977
8038	NC_018414	AT	3	6	162372	162377	50 %	50 %	0 %	0 %	400403977
8039	NC_018414	T	6	6	162377	162382	0 %	100 %	0 %	0 %	400403977
8040	NC_018414	ATT	2	6	162383	162388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403977
8041	NC_018414	A	7	7	162394	162400	100 %	0 %	0 %	0 %	400403977
8042	NC_018414	AATT	2	8	162415	162422	50 %	50 %	0 %	0 %	400403977
8043	NC_018414	ATT	2	6	162430	162435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403977
8044	NC_018414	ATT	2	6	162439	162444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403977
8045	NC_018414	T	9	9	162443	162451	0 %	100 %	0 %	0 %	400403977
8046	NC_018414	A	8	8	162452	162459	100 %	0 %	0 %	0 %	400403977
8047	NC_018414	T	6	6	162500	162505	0 %	100 %	0 %	0 %	400403977
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8050	NC_018414	A	6	6	162551	162556	100 %	0 %	0 %	0 %	400403977
8051	NC_018414	CAA	2	6	162573	162578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400403977

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.