MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis Cp162 chromosome

Total Repeats: 35774

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34501	NC_018019	GCA	2	6	2204033	2204038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401507
34502	NC_018019	AAAT	2	8	2204219	2204226	75 %	25 %	0 %	0 %	392401508
34503	NC_018019	GGC	2	6	2204565	2204570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392401509
34504	NC_018019	GAC	2	6	2204571	2204576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401509
34505	NC_018019	TGC	2	6	2204592	2204597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401509
34506	NC_018019	CGG	2	6	2204726	2204731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392401509
34507	NC_018019	GGC	2	6	2205121	2205126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392401510
34508	NC_018019	CCG	2	6	2205139	2205144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392401510
34509	NC_018019	CTG	2	6	2205152	2205157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401510
34510	NC_018019	GCT	2	6	2205165	2205170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401510
34511	NC_018019	CTG	2	6	2205207	2205212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401510
34512	NC_018019	CCG	2	6	2205217	2205222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392401510
34513	NC_018019	CCG	2	6	2205238	2205243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392401510
34514	NC_018019	CCA	2	6	2205247	2205252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392401510
34515	NC_018019	CCA	2	6	2205286	2205291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392401510
34516	NC_018019	CCG	2	6	2205298	2205303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392401510
34517	NC_018019	CTG	2	6	2205488	2205493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401510
34518	NC_018019	CCG	2	6	2205599	2205604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392401510
34519	NC_018019	GAA	2	6	2205856	2205861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392401511
34520	NC_018019	GTTGAG	2	12	2205917	2205928	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	392401511
34521	NC_018019	CTTC	2	8	2205946	2205953	0 %	50 %	0 %	50 %	392401511
34522	NC_018019	GTTT	2	8	2206401	2206408	0 %	75 %	25 %	0 %	392401512
34523	NC_018019	ACG	2	6	2206433	2206438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401512
34524	NC_018019	TGA	2	6	2206449	2206454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392401512
34525	NC_018019	TGG	2	6	2206563	2206568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392401512
34526	NC_018019	ATG	2	6	2206574	2206579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392401512
34527	NC_018019	TTA	2	6	2206618	2206623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392401513
34528	NC_018019	TGATCC	2	12	2206641	2206652	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	392401513
34529	NC_018019	AAT	3	9	2206761	2206769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392401513
34530	NC_018019	GGC	2	6	2206869	2206874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392401513
34531	NC_018019	ACCA	2	8	2206936	2206943	50 %	0 %	0 %	50 %	392401513
34532	NC_018019	TTA	2	6	2206969	2206974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392401513
34533	NC_018019	ACGC	2	8	2207031	2207038	25 %	0 %	25 %	50 %	392401513
34534	NC_018019	CACG	2	8	2207061	2207068	25 %	0 %	25 %	50 %	392401513
34535	NC_018019	CAG	2	6	2207079	2207084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401513
34536	NC_018019	CCAGA	2	10	2207129	2207138	40 %	0 %	20 %	40 %	392401513
34537	NC_018019	TGG	2	6	2207171	2207176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392401513
34538	NC_018019	CCCA	2	8	2207183	2207190	25 %	0 %	0 %	75 %	392401513
34539	NC_018019	GCC	3	9	2207272	2207280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392401513
34540	NC_018019	T	6	6	2207310	2207315	0 %	100 %	0 %	0 %	392401513
34541	NC_018019	TGG	2	6	2207413	2207418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392401513
34542	NC_018019	GGC	2	6	2207445	2207450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392401513
34543	NC_018019	GCA	2	6	2207506	2207511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401513
34544	NC_018019	CA	3	6	2207527	2207532	50 %	0 %	0 %	50 %	392401513
34545	NC_018019	CCA	2	6	2207561	2207566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392401513
34546	NC_018019	GCC	2	6	2207569	2207574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392401513
34547	NC_018019	AGAA	2	8	2207612	2207619	75 %	0 %	25 %	0 %	392401513
34548	NC_018019	GGTC	2	8	2207773	2207780	0 %	25 %	50 %	25 %	392401513
34549	NC_018019	ATA	2	6	2207806	2207811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392401513
34550	NC_018019	CCA	2	6	2207964	2207969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392401513
34551	NC_018019	ACC	2	6	2208350	2208355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392401514
34552	NC_018019	AGC	2	6	2208357	2208362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401514
34553	NC_018019	GAA	2	6	2208364	2208369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392401514
34554	NC_018019	CTG	2	6	2208433	2208438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401514
34555	NC_018019	CTT	2	6	2208472	2208477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392401514
34556	NC_018019	GCG	2	6	2208494	2208499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392401514
34557	NC_018019	GTA	2	6	2208501	2208506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392401514
34558	NC_018019	AGG	2	6	2208512	2208517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392401514
34559	NC_018019	GA	3	6	2208593	2208598	50 %	0 %	50 %	0 %	392401514
34560	NC_018019	GCC	2	6	2208653	2208658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392401514
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34562	NC_018019	CCAT	2	8	2208733	2208740	25 %	25 %	0 %	50 %	392401514
34563	NC_018019	TTG	2	6	2208747	2208752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392401514
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34566	NC_018019	TCAG	2	8	2209074	2209081	25 %	25 %	25 %	25 %	392401514
34567	NC_018019	T	6	6	2209084	2209089	0 %	100 %	0 %	0 %	392401514
34568	NC_018019	AGCG	2	8	2209101	2209108	25 %	0 %	50 %	25 %	392401514
34569	NC_018019	GAA	2	6	2209177	2209182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392401514
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34572	NC_018019	TCT	2	6	2209401	2209406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392401514
34573	NC_018019	GTA	2	6	2209412	2209417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392401514
34574	NC_018019	GCAC	2	8	2209419	2209426	25 %	0 %	25 %	50 %	392401514
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34577	NC_018019	CTG	2	6	2209517	2209522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401514
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34584	NC_018019	AAT	2	6	2210017	2210022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392401514
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34587	NC_018019	CTG	2	6	2210051	2210056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401514
34588	NC_018019	ATA	2	6	2210106	2210111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392401514
34589	NC_018019	GC	3	6	2210112	2210117	0 %	0 %	50 %	50 %	392401514
34590	NC_018019	TCT	2	6	2210163	2210168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392401514
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34597	NC_018019	TTCCT	2	10	2210923	2210932	0 %	60 %	0 %	40 %	392401515
34598	NC_018019	GCA	2	6	2210936	2210941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401515
34599	NC_018019	GCA	2	6	2211080	2211085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401515
34600	NC_018019	GAAG	2	8	2211093	2211100	50 %	0 %	50 %	0 %	392401515
34601	NC_018019	CGA	2	6	2211161	2211166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401515
34602	NC_018019	TCCG	2	8	2211472	2211479	0 %	25 %	25 %	50 %	392401516
34603	NC_018019	TCTGA	2	10	2211525	2211534	20 %	40 %	20 %	20 %	392401516
34604	NC_018019	CAT	2	6	2211551	2211556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392401516
34605	NC_018019	TCA	2	6	2211644	2211649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392401516
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34612	NC_018019	TAA	2	6	2212186	2212191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392401517
34613	NC_018019	CTGC	2	8	2212233	2212240	0 %	25 %	25 %	50 %	392401517
34614	NC_018019	GAA	2	6	2212241	2212246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392401517
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34616	NC_018019	GCA	2	6	2212397	2212402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392401517
34617	NC_018019	CCG	2	6	2212434	2212439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392401517
34618	NC_018019	TGC	2	6	2212446	2212451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401517
34619	NC_018019	TTC	2	6	2212453	2212458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392401517
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34643	NC_018019	AATGC	2	10	2214307	2214316	40 %	20 %	20 %	20 %	392401521
34644	NC_018019	ATGC	2	8	2214403	2214410	25 %	25 %	25 %	25 %	392401521
34645	NC_018019	CGT	2	6	2214447	2214452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401521
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34720	NC_018019	GTA	2	6	2218456	2218461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392401525
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34728	NC_018019	ATC	2	6	2219089	2219094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392401526
34729	NC_018019	CACC	2	8	2219114	2219121	25 %	0 %	0 %	75 %	392401526
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34731	NC_018019	CAT	2	6	2219213	2219218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392401526
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34733	NC_018019	AGA	2	6	2219341	2219346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392401526
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34849	NC_018019	CAT	2	6	2227439	2227444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392401532
34850	NC_018019	GCAA	2	8	2227558	2227565	50 %	0 %	25 %	25 %	392401532
34851	NC_018019	GAAC	2	8	2227573	2227580	50 %	0 %	25 %	25 %	392401532
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34964	NC_018019	TCA	2	6	2236479	2236484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392401536
34965	NC_018019	GCCC	2	8	2236523	2236530	0 %	0 %	25 %	75 %	392401536
34966	NC_018019	CCGT	2	8	2236542	2236549	0 %	25 %	25 %	50 %	392401536
34967	NC_018019	GTA	2	6	2236574	2236579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392401536
34968	NC_018019	GCT	2	6	2236706	2236711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392401536
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34971	NC_018019	AAG	2	6	2237601	2237606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392401537
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34975	NC_018019	TC	3	6	2237845	2237850	0 %	50 %	0 %	50 %	392401537
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34992	NC_018019	CG	3	6	2238759	2238764	0 %	0 %	50 %	50 %	392401538
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