MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis Cp162 chromosome

Total Repeats: 35774

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_018019	ATGC	2	8	1147370	1147377	25 %	25 %	25 %	25 %	392400611
18502	NC_018019	AAAT	2	8	1148059	1148066	75 %	25 %	0 %	0 %	392400612
18503	NC_018019	CAAC	2	8	1148149	1148156	50 %	0 %	0 %	50 %	392400612
18504	NC_018019	A	7	7	1148188	1148194	100 %	0 %	0 %	0 %	392400612
18505	NC_018019	TGC	2	6	1148199	1148204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400612
18506	NC_018019	GAG	2	6	1148309	1148314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392400612
18507	NC_018019	CCG	2	6	1148338	1148343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392400612
18508	NC_018019	CAC	2	6	1148446	1148451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392400612
18509	NC_018019	GCA	2	6	1148497	1148502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400612
18510	NC_018019	CAA	2	6	1148947	1148952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392400613
18511	NC_018019	GAA	2	6	1148992	1148997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400613
18512	NC_018019	CT	3	6	1149007	1149012	0 %	50 %	0 %	50 %	392400613
18513	NC_018019	TCT	2	6	1149031	1149036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400613
18514	NC_018019	CAC	2	6	1149061	1149066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392400613
18515	NC_018019	ATTCA	2	10	1149122	1149131	40 %	40 %	0 %	20 %	392400613
18516	NC_018019	TGT	2	6	1149175	1149180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392400613
18517	NC_018019	GAT	2	6	1149230	1149235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400613
18518	NC_018019	CTG	2	6	1149252	1149257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400613
18519	NC_018019	ACG	2	6	1149303	1149308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400613
18520	NC_018019	GTT	2	6	1149458	1149463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392400613
18521	NC_018019	ATG	2	6	1149471	1149476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400613
18522	NC_018019	CA	3	6	1149513	1149518	50 %	0 %	0 %	50 %	392400613
18523	NC_018019	CGG	2	6	1149559	1149564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392400613
18524	NC_018019	TGT	2	6	1149619	1149624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392400613
18525	NC_018019	CCGG	2	8	1149650	1149657	0 %	0 %	50 %	50 %	392400613
18526	NC_018019	TGT	2	6	1149673	1149678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392400613
18527	NC_018019	CGA	2	6	1149832	1149837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400613
18528	NC_018019	AAG	3	9	1150143	1150151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400613
18529	NC_018019	CTG	2	6	1150200	1150205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400613
18530	NC_018019	CCT	2	6	1150308	1150313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392400613
18531	NC_018019	TGA	2	6	1150338	1150343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400613
18532	NC_018019	CG	3	6	1150360	1150365	0 %	0 %	50 %	50 %	392400613
18533	NC_018019	TAC	2	6	1150445	1150450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400613
18534	NC_018019	TC	3	6	1150495	1150500	0 %	50 %	0 %	50 %	392400613
18535	NC_018019	CAC	2	6	1150513	1150518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392400613
18536	NC_018019	GAA	2	6	1150547	1150552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400613
18537	NC_018019	TCT	2	6	1150755	1150760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400613
18538	NC_018019	GAA	2	6	1150784	1150789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400613
18539	NC_018019	CGA	2	6	1150861	1150866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400613
18540	NC_018019	TCT	2	6	1150919	1150924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400613
18541	NC_018019	CAT	2	6	1151052	1151057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400613
18542	NC_018019	CTG	2	6	1151076	1151081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400613
18543	NC_018019	CCG	2	6	1151137	1151142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392400613
18544	NC_018019	ATG	2	6	1151159	1151164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400613
18545	NC_018019	CTC	2	6	1151250	1151255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392400613
18546	NC_018019	ACT	2	6	1151549	1151554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400613
18547	NC_018019	TCGT	2	8	1151616	1151623	0 %	50 %	25 %	25 %	392400613
18548	NC_018019	ACT	2	6	1151646	1151651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400613
18549	NC_018019	CGG	2	6	1151659	1151664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392400613
18550	NC_018019	GAT	2	6	1151689	1151694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400613
18551	NC_018019	GAA	2	6	1151911	1151916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400614
18552	NC_018019	GCG	2	6	1151933	1151938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392400614
18553	NC_018019	AGA	2	6	1151991	1151996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400614
18554	NC_018019	CGCGG	2	10	1151997	1152006	0 %	0 %	60 %	40 %	392400614
18555	NC_018019	GTT	2	6	1152016	1152021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392400614
18556	NC_018019	ACC	2	6	1152062	1152067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392400614
18557	NC_018019	AGT	2	6	1152177	1152182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400614
18558	NC_018019	TGA	2	6	1152222	1152227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400614
18559	NC_018019	TTC	2	6	1152242	1152247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400614
18560	NC_018019	AGA	2	6	1152309	1152314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400614
18561	NC_018019	AGA	2	6	1152339	1152344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400614
18562	NC_018019	GC	4	8	1152502	1152509	0 %	0 %	50 %	50 %	392400615
18563	NC_018019	TTC	2	6	1152524	1152529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400615
18564	NC_018019	CTCA	2	8	1152556	1152563	25 %	25 %	0 %	50 %	392400615
18565	NC_018019	TCG	2	6	1152623	1152628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400615
18566	NC_018019	TTCA	2	8	1152683	1152690	25 %	50 %	0 %	25 %	392400615
18567	NC_018019	T	6	6	1152727	1152732	0 %	100 %	0 %	0 %	392400615
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18569	NC_018019	CGT	2	6	1152813	1152818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400615
18570	NC_018019	AC	3	6	1152891	1152896	50 %	0 %	0 %	50 %	392400615
18571	NC_018019	GTT	2	6	1152925	1152930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392400615
18572	NC_018019	AAT	2	6	1152976	1152981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392400615
18573	NC_018019	TGC	3	9	1153017	1153025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400615
18574	NC_018019	TCG	2	6	1153091	1153096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400615
18575	NC_018019	TCC	2	6	1153100	1153105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392400615
18576	NC_018019	ATT	2	6	1153236	1153241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392400616
18577	NC_018019	ATT	2	6	1153269	1153274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392400616
18578	NC_018019	CTA	2	6	1153285	1153290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400616
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18581	NC_018019	TGA	2	6	1153376	1153381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400616
18582	NC_018019	GACA	2	8	1153388	1153395	50 %	0 %	25 %	25 %	392400616
18583	NC_018019	CGATG	2	10	1153475	1153484	20 %	20 %	40 %	20 %	392400616
18584	NC_018019	TTCA	2	8	1153528	1153535	25 %	50 %	0 %	25 %	392400617
18585	NC_018019	AGC	2	6	1153536	1153541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400617
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18587	NC_018019	TCT	2	6	1153613	1153618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400617
18588	NC_018019	GCA	3	9	1153779	1153787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400617
18589	NC_018019	TGG	2	6	1153859	1153864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392400617
18590	NC_018019	TGT	2	6	1153949	1153954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392400617
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18592	NC_018019	TTA	2	6	1154026	1154031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392400617
18593	NC_018019	AAG	2	6	1154032	1154037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400617
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18596	NC_018019	GTA	2	6	1154160	1154165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400617
18597	NC_018019	AGCC	2	8	1154222	1154229	25 %	0 %	25 %	50 %	392400617
18598	NC_018019	GCT	2	6	1154259	1154264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400617
18599	NC_018019	TGG	2	6	1154290	1154295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392400617
18600	NC_018019	CA	3	6	1154383	1154388	50 %	0 %	0 %	50 %	392400617
18601	NC_018019	AAC	2	6	1154429	1154434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392400617
18602	NC_018019	GCT	2	6	1154436	1154441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400617
18603	NC_018019	GCT	2	6	1154447	1154452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400617
18604	NC_018019	ATG	2	6	1154455	1154460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400617
18605	NC_018019	ATG	2	6	1154478	1154483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400617
18606	NC_018019	TGAT	2	8	1154545	1154552	25 %	50 %	25 %	0 %	392400617
18607	NC_018019	CAG	2	6	1154650	1154655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400617
18608	NC_018019	AGC	2	6	1154684	1154689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400617
18609	NC_018019	TGA	2	6	1154698	1154703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400617
18610	NC_018019	TCCCAG	2	12	1154731	1154742	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	392400617
18611	NC_018019	GGT	2	6	1154841	1154846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392400617
18612	NC_018019	ACT	2	6	1154942	1154947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400618
18613	NC_018019	T	6	6	1154947	1154952	0 %	100 %	0 %	0 %	392400618
18614	NC_018019	A	6	6	1154965	1154970	100 %	0 %	0 %	0 %	392400618
18615	NC_018019	CTC	2	6	1154984	1154989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392400618
18616	NC_018019	CAGCCA	2	12	1155006	1155017	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	392400618
18617	NC_018019	GGT	2	6	1155047	1155052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392400618
18618	NC_018019	TTG	2	6	1155351	1155356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392400619
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18623	NC_018019	CAC	2	6	1155545	1155550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392400619
18624	NC_018019	A	6	6	1155584	1155589	100 %	0 %	0 %	0 %	392400619
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18630	NC_018019	CGTA	2	8	1155823	1155830	25 %	25 %	25 %	25 %	392400619
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18646	NC_018019	GC	3	6	1159292	1159297	0 %	0 %	50 %	50 %	392400620
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18712	NC_018019	GC	3	6	1162412	1162417	0 %	0 %	50 %	50 %	392400623
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18716	NC_018019	GC	3	6	1162584	1162589	0 %	0 %	50 %	50 %	392400623
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18720	NC_018019	GC	3	6	1162879	1162884	0 %	0 %	50 %	50 %	392400623
18721	NC_018019	GA	3	6	1163034	1163039	50 %	0 %	50 %	0 %	392400624
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18724	NC_018019	ATC	2	6	1163169	1163174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400624
18725	NC_018019	TCT	2	6	1163320	1163325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400624
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18727	NC_018019	AAG	2	6	1163466	1163471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400624
18728	NC_018019	GC	3	6	1163535	1163540	0 %	0 %	50 %	50 %	392400624
18729	NC_018019	AAG	2	6	1163576	1163581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400624
18730	NC_018019	TCA	2	6	1163736	1163741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400624
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18732	NC_018019	GCT	2	6	1163905	1163910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400625
18733	NC_018019	TCG	2	6	1163925	1163930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400625
18734	NC_018019	TTC	2	6	1163939	1163944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400625
18735	NC_018019	TTC	2	6	1163974	1163979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400625
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18739	NC_018019	TCG	2	6	1164066	1164071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400625
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