MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis Cp162 chromosome

Total Repeats: 35774

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_018019	GAA	2	6	923315	923320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400430
15002	NC_018019	GAA	2	6	923465	923470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400430
15003	NC_018019	AAC	2	6	923570	923575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392400430
15004	NC_018019	TGA	2	6	923759	923764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400431
15005	NC_018019	CGT	2	6	923794	923799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400431
15006	NC_018019	GCA	2	6	923889	923894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400431
15007	NC_018019	CTC	2	6	924058	924063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392400431
15008	NC_018019	TGC	2	6	924065	924070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400431
15009	NC_018019	AGC	2	6	924077	924082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400431
15010	NC_018019	GAA	2	6	924126	924131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400431
15011	NC_018019	AGA	2	6	924251	924256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400431
15012	NC_018019	GCT	2	6	924276	924281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400431
15013	NC_018019	TCT	2	6	924312	924317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400431
15014	NC_018019	GAA	2	6	924336	924341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400431
15015	NC_018019	CG	3	6	924438	924443	0 %	0 %	50 %	50 %	392400431
15016	NC_018019	CCG	2	6	924469	924474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392400431
15017	NC_018019	TCA	2	6	924489	924494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400431
15018	NC_018019	ACT	2	6	924528	924533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400431
15019	NC_018019	TCC	2	6	924566	924571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392400431
15020	NC_018019	TGCCGC	2	12	924620	924631	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	392400431
15021	NC_018019	GTTT	2	8	924655	924662	0 %	75 %	25 %	0 %	392400431
15022	NC_018019	TGC	2	6	924664	924669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400431
15023	NC_018019	GGA	2	6	924735	924740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392400431
15024	NC_018019	GCA	2	6	924819	924824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400431
15025	NC_018019	TGC	3	9	924860	924868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400431
15026	NC_018019	TCCT	2	8	924888	924895	0 %	50 %	0 %	50 %	392400431
15027	NC_018019	CAC	2	6	924974	924979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392400431
15028	NC_018019	TGC	2	6	924991	924996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400431
15029	NC_018019	TGG	2	6	925110	925115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392400431
15030	NC_018019	CG	3	6	925261	925266	0 %	0 %	50 %	50 %	392400432
15031	NC_018019	ACG	2	6	925336	925341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400432
15032	NC_018019	CCT	2	6	925487	925492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392400432
15033	NC_018019	AAG	2	6	925551	925556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400432
15034	NC_018019	TCC	2	6	925585	925590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392400432
15035	NC_018019	ACC	2	6	925613	925618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392400432
15036	NC_018019	TTTA	2	8	925639	925646	25 %	75 %	0 %	0 %	392400432
15037	NC_018019	GAT	2	6	925648	925653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400432
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15039	NC_018019	TCC	2	6	925780	925785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392400432
15040	NC_018019	ATGC	2	8	925797	925804	25 %	25 %	25 %	25 %	392400432
15041	NC_018019	CAT	2	6	925809	925814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400432
15042	NC_018019	TGG	2	6	925878	925883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392400432
15043	NC_018019	CTT	2	6	925923	925928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400432
15044	NC_018019	CCG	2	6	926054	926059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392400432
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15046	NC_018019	TG	3	6	926124	926129	0 %	50 %	50 %	0 %	392400432
15047	NC_018019	TCA	2	6	926135	926140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400432
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15049	NC_018019	GT	3	6	926189	926194	0 %	50 %	50 %	0 %	392400432
15050	NC_018019	ACCC	2	8	926211	926218	25 %	0 %	0 %	75 %	392400432
15051	NC_018019	CTT	2	6	926253	926258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400432
15052	NC_018019	TCT	2	6	926291	926296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400432
15053	NC_018019	GTA	2	6	926302	926307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400432
15054	NC_018019	TTC	2	6	926485	926490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400432
15055	NC_018019	TTGT	2	8	926493	926500	0 %	75 %	25 %	0 %	392400432
15056	NC_018019	TCG	2	6	926507	926512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400432
15057	NC_018019	CAA	2	6	926580	926585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392400432
15058	NC_018019	CGG	2	6	926709	926714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392400432
15059	NC_018019	CTG	2	6	926759	926764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400432
15060	NC_018019	CAT	2	6	926805	926810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400432
15061	NC_018019	CAA	2	6	926868	926873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392400432
15062	NC_018019	T	6	6	927285	927290	0 %	100 %	0 %	0 %	392400433
15063	NC_018019	CGC	2	6	927300	927305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392400433
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15065	NC_018019	CTT	2	6	927377	927382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400433
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15067	NC_018019	ATA	2	6	927618	927623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392400433
15068	NC_018019	TGC	2	6	927665	927670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400433
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15070	NC_018019	TGCG	2	8	927720	927727	0 %	25 %	50 %	25 %	392400433
15071	NC_018019	A	6	6	927736	927741	100 %	0 %	0 %	0 %	392400433
15072	NC_018019	G	6	6	927767	927772	0 %	0 %	100 %	0 %	392400433
15073	NC_018019	TAC	2	6	927866	927871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400434
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15087	NC_018019	TTGG	2	8	928362	928369	0 %	50 %	50 %	0 %	392400434
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15100	NC_018019	ACT	2	6	929001	929006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400434
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15102	NC_018019	GAT	2	6	929060	929065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400434
15103	NC_018019	TCGC	2	8	929098	929105	0 %	25 %	25 %	50 %	392400434
15104	NC_018019	TGG	2	6	929137	929142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392400434
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15106	NC_018019	GAT	2	6	929222	929227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400434
15107	NC_018019	TTG	2	6	929303	929308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392400434
15108	NC_018019	ACAAAG	2	12	929313	929324	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	392400434
15109	NC_018019	ATC	2	6	929358	929363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400434
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15113	NC_018019	TG	3	6	929601	929606	0 %	50 %	50 %	0 %	392400434
15114	NC_018019	G	7	7	929634	929640	0 %	0 %	100 %	0 %	392400434
15115	NC_018019	CGTG	2	8	929674	929681	0 %	25 %	50 %	25 %	392400434
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15119	NC_018019	AGT	2	6	932232	932237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400435
15120	NC_018019	GGC	2	6	932241	932246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392400435
15121	NC_018019	GGT	2	6	932289	932294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392400435
15122	NC_018019	CAT	3	9	932530	932538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400436
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15125	NC_018019	GGA	2	6	932710	932715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392400436
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15148	NC_018019	CT	3	6	933947	933952	0 %	50 %	0 %	50 %	392400437
15149	NC_018019	GCT	2	6	933980	933985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400437
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15239	NC_018019	TTGGA	2	10	938631	938640	20 %	40 %	40 %	0 %	392400440
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15321	NC_018019	GAG	2	6	944104	944109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392400444
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15339	NC_018019	GC	4	8	945270	945277	0 %	0 %	50 %	50 %	392400446
15340	NC_018019	CTGCAT	2	12	945315	945326	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	392400446
15341	NC_018019	GCC	3	9	945343	945351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392400446
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15343	NC_018019	ACC	2	6	945438	945443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392400446
15344	NC_018019	GCG	2	6	945463	945468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392400446
15345	NC_018019	CTT	2	6	945492	945497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400446
15346	NC_018019	GGGGT	2	10	945530	945539	0 %	20 %	80 %	0 %	392400446
15347	NC_018019	ACG	2	6	945593	945598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400446
15348	NC_018019	GAT	2	6	945693	945698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400446
15349	NC_018019	CAA	2	6	945699	945704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392400446
15350	NC_018019	GCG	2	6	945736	945741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392400446
15351	NC_018019	CG	5	10	945754	945763	0 %	0 %	50 %	50 %	392400446
15352	NC_018019	T	6	6	945832	945837	0 %	100 %	0 %	0 %	392400446
15353	NC_018019	CAG	2	6	945891	945896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400446
15354	NC_018019	G	6	6	945973	945978	0 %	0 %	100 %	0 %	392400446
15355	NC_018019	GAC	2	6	946009	946014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400446
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15473	NC_018019	A	6	6	954868	954873	100 %	0 %	0 %	0 %	392400453
15474	NC_018019	ATCTT	2	10	954919	954928	20 %	60 %	0 %	20 %	392400453
15475	NC_018019	TCACC	2	10	954955	954964	20 %	20 %	0 %	60 %	392400453
15476	NC_018019	CA	3	6	955103	955108	50 %	0 %	0 %	50 %	392400453
15477	NC_018019	GCA	2	6	955172	955177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400453
15478	NC_018019	CCA	2	6	955187	955192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392400453
15479	NC_018019	ATC	2	6	955422	955427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400453
15480	NC_018019	CGGG	2	8	955441	955448	0 %	0 %	75 %	25 %	392400453
15481	NC_018019	GC	3	6	955543	955548	0 %	0 %	50 %	50 %	392400453
15482	NC_018019	GATCA	2	10	955569	955578	40 %	20 %	20 %	20 %	392400453
15483	NC_018019	GTG	2	6	955689	955694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392400453
15484	NC_018019	CCAGG	2	10	955743	955752	20 %	0 %	40 %	40 %	392400453
15485	NC_018019	TTG	2	6	955792	955797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392400453
15486	NC_018019	GC	3	6	955911	955916	0 %	0 %	50 %	50 %	392400453
15487	NC_018019	TTCC	2	8	955990	955997	0 %	50 %	0 %	50 %	392400453
15488	NC_018019	CAA	2	6	956013	956018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392400453
15489	NC_018019	TGC	2	6	956051	956056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400453
15490	NC_018019	CCTCTA	2	12	956137	956148	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	392400453
15491	NC_018019	GAA	2	6	956182	956187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400453
15492	NC_018019	GCA	2	6	956214	956219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400453
15493	NC_018019	GAG	2	6	956262	956267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392400453
15494	NC_018019	CACG	2	8	956378	956385	25 %	0 %	25 %	50 %	392400454
15495	NC_018019	GAC	2	6	956392	956397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400454
15496	NC_018019	TCG	2	6	956474	956479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400454
15497	NC_018019	CTC	2	6	956502	956507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392400454
15498	NC_018019	GTG	2	6	956551	956556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392400454
15499	NC_018019	TCT	2	6	956560	956565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400454
15500	NC_018019	GCG	2	6	956614	956619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392400454

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