MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis Cp162 chromosome

Total Repeats: 35774

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_018019	GCG	2	6	618841	618846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392400151
10002	NC_018019	CAA	2	6	618883	618888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392400151
10003	NC_018019	CAT	3	9	618938	618946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400151
10004	NC_018019	TAG	2	6	619171	619176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400151
10005	NC_018019	ATC	2	6	619191	619196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400151
10006	NC_018019	CGC	2	6	619259	619264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392400151
10007	NC_018019	CGC	2	6	619326	619331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392400151
10008	NC_018019	GGTTG	2	10	619361	619370	0 %	40 %	60 %	0 %	392400151
10009	NC_018019	CTG	2	6	619422	619427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400151
10010	NC_018019	GTG	2	6	619459	619464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392400151
10011	NC_018019	GAT	2	6	619577	619582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400151
10012	NC_018019	TGG	2	6	619595	619600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392400151
10013	NC_018019	TC	3	6	619614	619619	0 %	50 %	0 %	50 %	392400151
10014	NC_018019	GCT	2	6	619668	619673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400151
10015	NC_018019	TGC	2	6	619678	619683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400151
10016	NC_018019	CTT	2	6	619706	619711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400151
10017	NC_018019	ACG	2	6	619762	619767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400151
10018	NC_018019	GAA	2	6	619787	619792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400151
10019	NC_018019	GTT	2	6	619800	619805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392400151
10020	NC_018019	CGG	3	9	619826	619834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392400151
10021	NC_018019	TCC	2	6	619845	619850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392400151
10022	NC_018019	CTG	3	9	619870	619878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400151
10023	NC_018019	AGC	2	6	619982	619987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400151
10024	NC_018019	TTG	2	6	619999	620004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392400151
10025	NC_018019	GAT	3	9	620015	620023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400151
10026	NC_018019	CCTT	2	8	620074	620081	0 %	50 %	0 %	50 %	392400151
10027	NC_018019	TCA	2	6	620089	620094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400151
10028	NC_018019	TGA	2	6	620152	620157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400151
10029	NC_018019	CT	3	6	620158	620163	0 %	50 %	0 %	50 %	392400151
10030	NC_018019	TGGT	2	8	620199	620206	0 %	50 %	50 %	0 %	392400151
10031	NC_018019	GTT	2	6	620213	620218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392400151
10032	NC_018019	GTG	2	6	620220	620225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392400151
10033	NC_018019	AAC	2	6	620358	620363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392400152
10034	NC_018019	GAT	2	6	620420	620425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400152
10035	NC_018019	GGC	2	6	620468	620473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392400152
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10037	NC_018019	TGGC	2	8	620655	620662	0 %	25 %	50 %	25 %	392400152
10038	NC_018019	GCG	2	6	620687	620692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392400152
10039	NC_018019	GAA	2	6	620720	620725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400152
10040	NC_018019	TGC	2	6	620803	620808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400152
10041	NC_018019	CT	3	6	620856	620861	0 %	50 %	0 %	50 %	392400152
10042	NC_018019	CCG	2	6	620863	620868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392400152
10043	NC_018019	GTA	2	6	620870	620875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400152
10044	NC_018019	CGG	2	6	620920	620925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392400152
10045	NC_018019	GGCT	2	8	620968	620975	0 %	25 %	50 %	25 %	392400152
10046	NC_018019	CGC	2	6	620994	620999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392400152
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10048	NC_018019	CGGT	2	8	621231	621238	0 %	25 %	50 %	25 %	392400153
10049	NC_018019	AGCT	2	8	621254	621261	25 %	25 %	25 %	25 %	392400153
10050	NC_018019	T	6	6	621282	621287	0 %	100 %	0 %	0 %	392400153
10051	NC_018019	GTC	2	6	621386	621391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400153
10052	NC_018019	GAT	2	6	621475	621480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400153
10053	NC_018019	GCC	2	6	621519	621524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392400153
10054	NC_018019	CAATT	2	10	621587	621596	40 %	40 %	0 %	20 %	392400153
10055	NC_018019	TCC	2	6	621617	621622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392400153
10056	NC_018019	GCGG	2	8	621704	621711	0 %	0 %	75 %	25 %	392400153
10057	NC_018019	GAT	2	6	621869	621874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400153
10058	NC_018019	GCT	2	6	622021	622026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400153
10059	NC_018019	CGT	2	6	622081	622086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400153
10060	NC_018019	GCG	2	6	622260	622265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392400154
10061	NC_018019	GGA	2	6	622304	622309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392400154
10062	NC_018019	TTC	2	6	622311	622316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400154
10063	NC_018019	ATC	2	6	622389	622394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400154
10064	NC_018019	T	6	6	622400	622405	0 %	100 %	0 %	0 %	392400154
10065	NC_018019	TTGG	2	8	622432	622439	0 %	50 %	50 %	0 %	392400154
10066	NC_018019	GCA	2	6	622540	622545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400154
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10068	NC_018019	GAT	2	6	622589	622594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400154
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10070	NC_018019	TGCG	2	8	622802	622809	0 %	25 %	50 %	25 %	392400154
10071	NC_018019	TAA	2	6	622815	622820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392400154
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10073	NC_018019	GAG	2	6	623128	623133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392400154
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10075	NC_018019	GTC	2	6	623172	623177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400154
10076	NC_018019	GCG	2	6	623212	623217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392400154
10077	NC_018019	GCT	3	9	623444	623452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400155
10078	NC_018019	GAGT	2	8	623466	623473	25 %	25 %	50 %	0 %	392400155
10079	NC_018019	ATC	2	6	623640	623645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400155
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10084	NC_018019	ACC	2	6	623778	623783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392400155
10085	NC_018019	CTG	2	6	623805	623810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400155
10086	NC_018019	TCGG	2	8	623910	623917	0 %	25 %	50 %	25 %	392400155
10087	NC_018019	GCC	2	6	623976	623981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392400155
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10090	NC_018019	ACT	2	6	624076	624081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400155
10091	NC_018019	ATA	2	6	624214	624219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392400155
10092	NC_018019	GCT	2	6	624247	624252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400155
10093	NC_018019	TGGAT	2	10	624302	624311	20 %	40 %	40 %	0 %	392400155
10094	NC_018019	GA	3	6	624354	624359	50 %	0 %	50 %	0 %	392400155
10095	NC_018019	GAT	2	6	624363	624368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400155
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10097	NC_018019	ACG	2	6	624424	624429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400155
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10101	NC_018019	TA	3	6	624937	624942	50 %	50 %	0 %	0 %	392400156
10102	NC_018019	GTT	2	6	624947	624952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392400156
10103	NC_018019	TGA	2	6	624956	624961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400156
10104	NC_018019	ACA	2	6	625263	625268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392400157
10105	NC_018019	GCG	2	6	625296	625301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392400157
10106	NC_018019	ACG	2	6	625338	625343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400157
10107	NC_018019	CT	3	6	625364	625369	0 %	50 %	0 %	50 %	392400157
10108	NC_018019	CCA	2	6	625588	625593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392400157
10109	NC_018019	TGA	2	6	625603	625608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400157
10110	NC_018019	CCCA	2	8	625647	625654	25 %	0 %	0 %	75 %	392400157
10111	NC_018019	TCG	2	6	625670	625675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400157
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10113	NC_018019	TAT	2	6	625694	625699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392400157
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10115	NC_018019	ATG	2	6	625862	625867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400157
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10117	NC_018019	CT	3	6	626039	626044	0 %	50 %	0 %	50 %	392400157
10118	NC_018019	CGG	2	6	626110	626115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392400157
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10120	NC_018019	GAA	2	6	626143	626148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400157
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10122	NC_018019	GGC	2	6	626258	626263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392400157
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10354	NC_018019	TTG	2	6	641673	641678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392400172
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10356	NC_018019	AG	3	6	641741	641746	50 %	0 %	50 %	0 %	392400172
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10360	NC_018019	GCA	2	6	641834	641839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400172
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10477	NC_018019	GCT	2	6	647772	647777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400178
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10479	NC_018019	CGG	2	6	647963	647968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392400178
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10482	NC_018019	CT	3	6	648000	648005	0 %	50 %	0 %	50 %	392400178
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