MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis Sweden2

Total Repeats: 20037

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2124	NC_017441	TG	3	6	112204	112209	0 %	50 %	50 %	0 %	386262452
2125	NC_017441	AAC	2	6	112220	112225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386262452
2126	NC_017441	TTC	2	6	112229	112234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386262452
2127	NC_017441	GCTT	2	8	112236	112243	0 %	50 %	25 %	25 %	386262452
2128	NC_017441	TCT	2	6	112278	112283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386262452
2129	NC_017441	AGA	2	6	112286	112291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262452
2130	NC_017441	TCA	2	6	112341	112346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386262452
2131	NC_017441	GATC	2	8	112356	112363	25 %	25 %	25 %	25 %	386262452
2132	NC_017441	TTA	2	6	112386	112391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386262452
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2147	NC_017441	CTTT	2	8	112702	112709	0 %	75 %	0 %	25 %	386262452
2148	NC_017441	TCT	2	6	112710	112715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386262452
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2152	NC_017441	GCA	2	6	112863	112868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386262452
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2155	NC_017441	AGA	2	6	113018	113023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262452
2156	NC_017441	CAG	2	6	113062	113067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386262452
2157	NC_017441	AGCT	2	8	113160	113167	25 %	25 %	25 %	25 %	386262453
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2161	NC_017441	CTGA	2	8	113400	113407	25 %	25 %	25 %	25 %	386262453
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2221	NC_017441	TATCG	2	10	116166	116175	20 %	40 %	20 %	20 %	386262454
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2224	NC_017441	T	7	7	116506	116512	0 %	100 %	0 %	0 %	386262455
2225	NC_017441	GCT	2	6	116632	116637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386262455
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2227	NC_017441	ACA	2	6	116719	116724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386262455
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2229	NC_017441	TATC	2	8	116939	116946	25 %	50 %	0 %	25 %	386262455
2230	NC_017441	TTTG	2	8	117036	117043	0 %	75 %	25 %	0 %	386262455
2231	NC_017441	AGG	3	9	117048	117056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386262455
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2233	NC_017441	GA	3	6	117123	117128	50 %	0 %	50 %	0 %	386262455
2234	NC_017441	A	6	6	117176	117181	100 %	0 %	0 %	0 %	386262455
2235	NC_017441	GTTC	2	8	117232	117239	0 %	50 %	25 %	25 %	386262455
2236	NC_017441	TAA	2	6	117252	117257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386262455
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2238	NC_017441	GCT	2	6	117286	117291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386262455
2239	NC_017441	AGG	2	6	117336	117341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386262455
2240	NC_017441	ATT	2	6	117370	117375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386262455
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2242	NC_017441	TGC	2	6	117417	117422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386262455
2243	NC_017441	CTG	2	6	117464	117469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386262455
2244	NC_017441	GCA	2	6	117669	117674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386262456
2245	NC_017441	TGC	2	6	117680	117685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386262456
2246	NC_017441	AAG	2	6	117688	117693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262456
2247	NC_017441	GAAA	2	8	117740	117747	75 %	0 %	25 %	0 %	386262456
2248	NC_017441	GTT	2	6	117783	117788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386262456
2249	NC_017441	TAT	2	6	117799	117804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386262456
2250	NC_017441	TCC	2	6	117826	117831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386262456
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2252	NC_017441	T	6	6	118509	118514	0 %	100 %	0 %	0 %	386262457
2253	NC_017441	AGA	3	9	118515	118523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262457
2254	NC_017441	CTTT	2	8	118552	118559	0 %	75 %	0 %	25 %	386262457
2255	NC_017441	GTAG	2	8	118597	118604	25 %	25 %	50 %	0 %	386262457
2256	NC_017441	G	6	6	118645	118650	0 %	0 %	100 %	0 %	386262457
2257	NC_017441	T	6	6	118668	118673	0 %	100 %	0 %	0 %	386262457
2258	NC_017441	GTT	2	6	118786	118791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386262457
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2262	NC_017441	A	8	8	118871	118878	100 %	0 %	0 %	0 %	386262457
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2264	NC_017441	AAAGA	2	10	118927	118936	80 %	0 %	20 %	0 %	386262457
2265	NC_017441	AAT	2	6	118937	118942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386262457
2266	NC_017441	TTA	2	6	118991	118996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386262458
2267	NC_017441	T	6	6	119096	119101	0 %	100 %	0 %	0 %	386262458
2268	NC_017441	TTC	2	6	119182	119187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386262458
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2270	NC_017441	TTTA	2	8	119213	119220	25 %	75 %	0 %	0 %	386262458
2271	NC_017441	CTG	2	6	119411	119416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386262458
2272	NC_017441	AGA	2	6	119440	119445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262458
2273	NC_017441	TTGCCA	2	12	119463	119474	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386262458
2274	NC_017441	GA	4	8	119486	119493	50 %	0 %	50 %	0 %	386262458
2275	NC_017441	GAA	2	6	119500	119505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262458
2276	NC_017441	TTC	2	6	119539	119544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386262458
2277	NC_017441	TACT	2	8	119601	119608	25 %	50 %	0 %	25 %	386262458
2278	NC_017441	GTT	2	6	119645	119650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386262458
2279	NC_017441	TAT	2	6	119680	119685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386262458
2280	NC_017441	GAT	2	6	119696	119701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386262458
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2283	NC_017441	AG	3	6	119921	119926	50 %	0 %	50 %	0 %	386262459
2284	NC_017441	GCTA	2	8	119943	119950	25 %	25 %	25 %	25 %	386262459
2285	NC_017441	GA	3	6	119954	119959	50 %	0 %	50 %	0 %	386262459
2286	NC_017441	AAG	2	6	119962	119967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262459
2287	NC_017441	GCT	3	9	119968	119976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386262459
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2291	NC_017441	GCTA	2	8	120075	120082	25 %	25 %	25 %	25 %	386262459
2292	NC_017441	CGGC	2	8	120124	120131	0 %	0 %	50 %	50 %	386262459
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2340	NC_017441	GCTTC	2	10	122917	122926	0 %	40 %	20 %	40 %	386262460
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2342	NC_017441	ACT	2	6	123119	123124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386262461
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2345	NC_017441	T	6	6	123231	123236	0 %	100 %	0 %	0 %	386262461
2346	NC_017441	AGCT	2	8	123264	123271	25 %	25 %	25 %	25 %	386262461
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2350	NC_017441	ATA	2	6	123489	123494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386262461
2351	NC_017441	TAA	2	6	123618	123623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386262461
2352	NC_017441	TGA	2	6	123707	123712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386262461
2353	NC_017441	TCC	2	6	123767	123772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386262461
2354	NC_017441	GAT	2	6	123799	123804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386262461
2355	NC_017441	T	7	7	123906	123912	0 %	100 %	0 %	0 %	386262461
2356	NC_017441	AGA	2	6	123943	123948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262461
2357	NC_017441	T	6	6	124051	124056	0 %	100 %	0 %	0 %	386262462
2358	NC_017441	GA	3	6	124129	124134	50 %	0 %	50 %	0 %	386262462
2359	NC_017441	GGGTTT	2	12	124152	124163	0 %	50 %	50 %	0 %	386262462
2360	NC_017441	CAA	2	6	124178	124183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386262462
2361	NC_017441	GTG	2	6	124196	124201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386262462
2362	NC_017441	T	6	6	124210	124215	0 %	100 %	0 %	0 %	386262462
2363	NC_017441	TGGA	2	8	124220	124227	25 %	25 %	50 %	0 %	386262462
2364	NC_017441	GCAA	2	8	124255	124262	50 %	0 %	25 %	25 %	386262462
2365	NC_017441	TTA	2	6	124300	124305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386262462
2366	NC_017441	TTA	2	6	124341	124346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386262462
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2368	NC_017441	CTT	2	6	124385	124390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386262462
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2489	NC_017441	TGC	2	6	130062	130067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386262467
2490	NC_017441	GA	3	6	130143	130148	50 %	0 %	50 %	0 %	386262467
2491	NC_017441	AGA	2	6	130350	130355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262467
2492	NC_017441	T	6	6	130364	130369	0 %	100 %	0 %	0 %	386262467
2493	NC_017441	TG	4	8	130386	130393	0 %	50 %	50 %	0 %	386262467
2494	NC_017441	T	6	6	130410	130415	0 %	100 %	0 %	0 %	386262467
2495	NC_017441	GAGG	2	8	130475	130482	25 %	0 %	75 %	0 %	386262467
2496	NC_017441	ATG	2	6	130523	130528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386262467
2497	NC_017441	AAG	2	6	130534	130539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386262467
2498	NC_017441	CTT	2	6	130565	130570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386262467
2499	NC_017441	TCA	2	6	130585	130590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386262467
2500	NC_017441	AGC	2	6	130654	130659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386262467

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