MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D-LC chromosome

Total Repeats: 20223

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_017436	CAG	2	6	509344	509349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244528
10002	NC_017436	CGA	2	6	509358	509363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244528
10003	NC_017436	CAT	2	6	509400	509405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244528
10004	NC_017436	TC	3	6	509422	509427	0 %	50 %	0 %	50 %	385244528
10005	NC_017436	TC	4	8	509435	509442	0 %	50 %	0 %	50 %	385244528
10006	NC_017436	GTTC	2	8	509460	509467	0 %	50 %	25 %	25 %	385244528
10007	NC_017436	TCT	2	6	509506	509511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244528
10008	NC_017436	AGA	2	6	509525	509530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244528
10009	NC_017436	AAG	2	6	509560	509565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244528
10010	NC_017436	TCT	2	6	509574	509579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244528
10011	NC_017436	CAA	2	6	509604	509609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385244528
10012	NC_017436	A	6	6	509697	509702	100 %	0 %	0 %	0 %	385244528
10013	NC_017436	CTT	2	6	509716	509721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244528
10014	NC_017436	GAA	2	6	509727	509732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244528
10015	NC_017436	TCT	3	9	509753	509761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244528
10016	NC_017436	ATCT	2	8	509771	509778	25 %	50 %	0 %	25 %	385244528
10017	NC_017436	AGA	2	6	509783	509788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244528
10018	NC_017436	GCA	2	6	509790	509795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244528
10019	NC_017436	A	6	6	509795	509800	100 %	0 %	0 %	0 %	385244528
10020	NC_017436	TAT	2	6	509939	509944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244528
10021	NC_017436	GAA	2	6	509994	509999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244528
10022	NC_017436	TG	3	6	510034	510039	0 %	50 %	50 %	0 %	385244528
10023	NC_017436	AGA	2	6	510059	510064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244528
10024	NC_017436	AAG	2	6	510085	510090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244528
10025	NC_017436	CTG	2	6	510106	510111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244528
10026	NC_017436	ATT	2	6	510141	510146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244528
10027	NC_017436	TCC	2	6	510222	510227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385244528
10028	NC_017436	AAT	2	6	510252	510257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385244528
10029	NC_017436	CGT	2	6	510276	510281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244528
10030	NC_017436	A	6	6	510283	510288	100 %	0 %	0 %	0 %	385244528
10031	NC_017436	GTC	2	6	510301	510306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244528
10032	NC_017436	A	7	7	510436	510442	100 %	0 %	0 %	0 %	385244528
10033	NC_017436	GA	3	6	510469	510474	50 %	0 %	50 %	0 %	385244528
10034	NC_017436	GGA	2	6	510480	510485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244528
10035	NC_017436	GGTTGT	2	12	510533	510544	0 %	50 %	50 %	0 %	385244528
10036	NC_017436	ATG	2	6	510604	510609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244528
10037	NC_017436	GCA	2	6	510648	510653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244528
10038	NC_017436	TTG	2	6	510658	510663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244528
10039	NC_017436	CAA	2	6	510708	510713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385244528
10040	NC_017436	AAG	2	6	510766	510771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244528
10041	NC_017436	CA	3	6	510821	510826	50 %	0 %	0 %	50 %	385244528
10042	NC_017436	AGA	2	6	510872	510877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244528
10043	NC_017436	GA	3	6	511028	511033	50 %	0 %	50 %	0 %	385244528
10044	NC_017436	A	7	7	511075	511081	100 %	0 %	0 %	0 %	385244528
10045	NC_017436	A	7	7	511113	511119	100 %	0 %	0 %	0 %	385244528
10046	NC_017436	CAAA	2	8	511120	511127	75 %	0 %	0 %	25 %	385244528
10047	NC_017436	GATC	2	8	511131	511138	25 %	25 %	25 %	25 %	385244528
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10050	NC_017436	TCT	2	6	511366	511371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244529
10051	NC_017436	TCA	2	6	511412	511417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244529
10052	NC_017436	GTT	2	6	511435	511440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244529
10053	NC_017436	CAT	2	6	511449	511454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244529
10054	NC_017436	GAT	2	6	511456	511461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244529
10055	NC_017436	TCT	2	6	511463	511468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244529
10056	NC_017436	CTT	2	6	511483	511488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244529
10057	NC_017436	TC	3	6	511501	511506	0 %	50 %	0 %	50 %	385244529
10058	NC_017436	CTA	2	6	511578	511583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244529
10059	NC_017436	AGT	2	6	511646	511651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244529
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10064	NC_017436	GAA	2	6	512022	512027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244530
10065	NC_017436	CGAAT	2	10	512117	512126	40 %	20 %	20 %	20 %	385244530
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10071	NC_017436	AGC	2	6	512380	512385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244530
10072	NC_017436	CAA	2	6	512392	512397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385244530
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10074	NC_017436	ACT	2	6	512487	512492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244530
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10077	NC_017436	TACT	2	8	512653	512660	25 %	50 %	0 %	25 %	385244530
10078	NC_017436	GTT	2	6	512685	512690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244530
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10086	NC_017436	CTT	2	6	513058	513063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244530
10087	NC_017436	CAG	2	6	513142	513147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244530
10088	NC_017436	ATAGG	2	10	513252	513261	40 %	20 %	40 %	0 %	385244530
10089	NC_017436	TG	3	6	513294	513299	0 %	50 %	50 %	0 %	385244530
10090	NC_017436	ATC	2	6	513314	513319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244530
10091	NC_017436	T	6	6	513435	513440	0 %	100 %	0 %	0 %	385244530
10092	NC_017436	T	6	6	513446	513451	0 %	100 %	0 %	0 %	385244530
10093	NC_017436	AGCTA	2	10	513488	513497	40 %	20 %	20 %	20 %	385244530
10094	NC_017436	AG	4	8	513509	513516	50 %	0 %	50 %	0 %	385244530
10095	NC_017436	TGA	2	6	513598	513603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244530
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10097	NC_017436	TCTT	2	8	513911	513918	0 %	75 %	0 %	25 %	385244531
10098	NC_017436	ACA	2	6	513985	513990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385244531
10099	NC_017436	ACT	2	6	513991	513996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244531
10100	NC_017436	ACA	2	6	514004	514009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385244531
10101	NC_017436	AGC	2	6	514018	514023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244531
10102	NC_017436	T	7	7	514035	514041	0 %	100 %	0 %	0 %	385244531
10103	NC_017436	A	6	6	514376	514381	100 %	0 %	0 %	0 %	385244532
10104	NC_017436	CTG	2	6	514412	514417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244532
10105	NC_017436	CCT	2	6	514419	514424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385244532
10106	NC_017436	TC	3	6	514517	514522	0 %	50 %	0 %	50 %	385244532
10107	NC_017436	CTT	2	6	514548	514553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244532
10108	NC_017436	CAC	2	6	514562	514567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385244532
10109	NC_017436	GAA	2	6	514585	514590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244532
10110	NC_017436	TGC	3	9	514660	514668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244533
10111	NC_017436	CTC	2	6	514682	514687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385244533
10112	NC_017436	CTT	2	6	514815	514820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244533
10113	NC_017436	ATG	2	6	514821	514826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244533
10114	NC_017436	AGA	2	6	514865	514870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244533
10115	NC_017436	CTT	2	6	514890	514895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244533
10116	NC_017436	ACA	2	6	514919	514924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385244533
10117	NC_017436	CTC	2	6	514965	514970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385244533
10118	NC_017436	AAG	2	6	514999	515004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244533
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10120	NC_017436	GAA	2	6	515057	515062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244533
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10363	NC_017436	ATGA	2	8	529571	529578	50 %	25 %	25 %	0 %	385244543
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10479	NC_017436	TA	3	6	534299	534304	50 %	50 %	0 %	0 %	385244545
10480	NC_017436	CAA	2	6	534398	534403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385244545
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10482	NC_017436	CTT	2	6	534443	534448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244545
10483	NC_017436	TTC	2	6	534454	534459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244545
10484	NC_017436	AGA	2	6	534468	534473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244545
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