MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D-EC chromosome

Total Repeats: 20222

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14003	NC_017434	TAA	2	6	708968	708973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243829
14004	NC_017434	AGA	2	6	708996	709001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243829
14005	NC_017434	GAA	2	6	709140	709145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243830
14006	NC_017434	AGC	2	6	709214	709219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243830
14007	NC_017434	GAAA	2	8	709229	709236	75 %	0 %	25 %	0 %	385243830
14008	NC_017434	TAGT	2	8	709281	709288	25 %	50 %	25 %	0 %	385243830
14009	NC_017434	TCG	2	6	709445	709450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243830
14010	NC_017434	AG	3	6	709461	709466	50 %	0 %	50 %	0 %	385243830
14011	NC_017434	GTT	2	6	709521	709526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243830
14012	NC_017434	T	6	6	709593	709598	0 %	100 %	0 %	0 %	385243830
14013	NC_017434	CAAC	2	8	709636	709643	50 %	0 %	0 %	50 %	385243830
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14015	NC_017434	CTG	2	6	709705	709710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243830
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14017	NC_017434	ACC	2	6	709844	709849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385243830
14018	NC_017434	AAG	2	6	710028	710033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243830
14019	NC_017434	CTG	2	6	710053	710058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243830
14020	NC_017434	AGA	2	6	710060	710065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243830
14021	NC_017434	AGC	2	6	710117	710122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243830
14022	NC_017434	GGTA	2	8	710165	710172	25 %	25 %	50 %	0 %	385243830
14023	NC_017434	TAA	2	6	710387	710392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243830
14024	NC_017434	GC	3	6	710395	710400	0 %	0 %	50 %	50 %	385243830
14025	NC_017434	T	6	6	710423	710428	0 %	100 %	0 %	0 %	385243830
14026	NC_017434	GAAA	2	8	710713	710720	75 %	0 %	25 %	0 %	385243831
14027	NC_017434	TCT	2	6	710735	710740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243831
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14029	NC_017434	A	6	6	710819	710824	100 %	0 %	0 %	0 %	385243831
14030	NC_017434	TTG	2	6	710838	710843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243831
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14032	NC_017434	TAA	2	6	710907	710912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243831
14033	NC_017434	GCT	2	6	710915	710920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243831
14034	NC_017434	CT	3	6	710948	710953	0 %	50 %	0 %	50 %	385243831
14035	NC_017434	AAG	2	6	711042	711047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243831
14036	NC_017434	GCA	2	6	711119	711124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243831
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14038	NC_017434	ATAGA	2	10	711166	711175	60 %	20 %	20 %	0 %	385243831
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14041	NC_017434	GCAAA	2	10	711300	711309	60 %	0 %	20 %	20 %	385243831
14042	NC_017434	ACC	2	6	711332	711337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385243831
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14044	NC_017434	TCTTGA	2	12	711395	711406	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385243831
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14053	NC_017434	A	8	8	712115	712122	100 %	0 %	0 %	0 %	385243831
14054	NC_017434	AGCC	2	8	712135	712142	25 %	0 %	25 %	50 %	385243831
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14057	NC_017434	A	6	6	712219	712224	100 %	0 %	0 %	0 %	385243831
14058	NC_017434	TCA	2	6	712268	712273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243831
14059	NC_017434	TCA	2	6	712281	712286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243831
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14061	NC_017434	GCT	2	6	712508	712513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243832
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14067	NC_017434	CAT	2	6	712669	712674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243832
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14069	NC_017434	GT	3	6	712739	712744	0 %	50 %	50 %	0 %	385243832
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14104	NC_017434	TGGA	2	8	715037	715044	25 %	25 %	50 %	0 %	385243834
14105	NC_017434	CT	3	6	715170	715175	0 %	50 %	0 %	50 %	385243834
14106	NC_017434	CTA	2	6	715197	715202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243834
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14111	NC_017434	AG	4	8	715323	715330	50 %	0 %	50 %	0 %	385243834
14112	NC_017434	AAAC	2	8	715332	715339	75 %	0 %	0 %	25 %	385243834
14113	NC_017434	CAA	2	6	715364	715369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243834
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14115	NC_017434	A	7	7	715415	715421	100 %	0 %	0 %	0 %	385243834
14116	NC_017434	TATT	2	8	715485	715492	25 %	75 %	0 %	0 %	385243835
14117	NC_017434	TCCA	2	8	715493	715500	25 %	25 %	0 %	50 %	385243835
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14121	NC_017434	ATC	2	6	715689	715694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243835
14122	NC_017434	CTA	2	6	715736	715741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243835
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14230	NC_017434	GCTA	2	8	721247	721254	25 %	25 %	25 %	25 %	385243840
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14234	NC_017434	GCGTA	2	10	721343	721352	20 %	20 %	40 %	20 %	385243841
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14239	NC_017434	CATG	2	8	721566	721573	25 %	25 %	25 %	25 %	385243841
14240	NC_017434	TATCCA	2	12	721578	721589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243841
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