MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D-EC chromosome

Total Repeats: 20222

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_017434	A	7	7	661057	661063	100 %	0 %	0 %	0 %	385243793
13002	NC_017434	TGC	2	6	661105	661110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243793
13003	NC_017434	CAG	2	6	661137	661142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243793
13004	NC_017434	ATTG	2	8	661189	661196	25 %	50 %	25 %	0 %	385243793
13005	NC_017434	TCT	2	6	661204	661209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243793
13006	NC_017434	AAG	2	6	661266	661271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243793
13007	NC_017434	GTA	2	6	661281	661286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243793
13008	NC_017434	CT	3	6	661291	661296	0 %	50 %	0 %	50 %	385243793
13009	NC_017434	ACG	2	6	661399	661404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243793
13010	NC_017434	CAA	2	6	661430	661435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243793
13011	NC_017434	TAT	2	6	661456	661461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243793
13012	NC_017434	AAG	2	6	661491	661496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243793
13013	NC_017434	AAG	2	6	661503	661508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243793
13014	NC_017434	AGC	2	6	661582	661587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243793
13015	NC_017434	TGA	2	6	661629	661634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243793
13016	NC_017434	GCA	2	6	661637	661642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243793
13017	NC_017434	A	7	7	661642	661648	100 %	0 %	0 %	0 %	385243793
13018	NC_017434	CTC	2	6	661652	661657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243793
13019	NC_017434	GAA	3	9	661670	661678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243793
13020	NC_017434	GTC	2	6	661861	661866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243794
13021	NC_017434	GA	3	6	661884	661889	50 %	0 %	50 %	0 %	385243794
13022	NC_017434	TCA	2	6	661931	661936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243794
13023	NC_017434	GCGT	2	8	661960	661967	0 %	25 %	50 %	25 %	385243794
13024	NC_017434	TGAT	2	8	662138	662145	25 %	50 %	25 %	0 %	385243794
13025	NC_017434	GCT	2	6	662218	662223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243794
13026	NC_017434	TGG	2	6	662259	662264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385243794
13027	NC_017434	ATG	2	6	662293	662298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243794
13028	NC_017434	ATGC	2	8	662317	662324	25 %	25 %	25 %	25 %	385243794
13029	NC_017434	A	8	8	662424	662431	100 %	0 %	0 %	0 %	385243794
13030	NC_017434	TGA	2	6	662466	662471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243794
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13032	NC_017434	GCT	2	6	662587	662592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243794
13033	NC_017434	TCT	2	6	662593	662598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243794
13034	NC_017434	ATG	2	6	662624	662629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243794
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13036	NC_017434	GAC	2	6	662779	662784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243794
13037	NC_017434	ATTG	2	8	662805	662812	25 %	50 %	25 %	0 %	385243794
13038	NC_017434	TCA	2	6	662849	662854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243794
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13040	NC_017434	GCTAC	2	10	662918	662927	20 %	20 %	20 %	40 %	385243794
13041	NC_017434	AGA	2	6	662955	662960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243794
13042	NC_017434	TAC	2	6	662961	662966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243794
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13044	NC_017434	AATA	2	8	663274	663281	75 %	25 %	0 %	0 %	385243795
13045	NC_017434	CACG	2	8	663299	663306	25 %	0 %	25 %	50 %	385243795
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13047	NC_017434	TAT	2	6	663342	663347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243795
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13049	NC_017434	TTTA	2	8	663438	663445	25 %	75 %	0 %	0 %	385243795
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13052	NC_017434	CTG	2	6	663533	663538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243795
13053	NC_017434	A	7	7	663609	663615	100 %	0 %	0 %	0 %	385243795
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13056	NC_017434	TATT	2	8	663835	663842	25 %	75 %	0 %	0 %	385243795
13057	NC_017434	CT	3	6	663869	663874	0 %	50 %	0 %	50 %	385243795
13058	NC_017434	TC	3	6	663891	663896	0 %	50 %	0 %	50 %	385243795
13059	NC_017434	CAT	2	6	663906	663911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243795
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13062	NC_017434	TAC	2	6	664022	664027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243795
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13065	NC_017434	CT	3	6	664116	664121	0 %	50 %	0 %	50 %	385243795
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13101	NC_017434	TA	3	6	665699	665704	50 %	50 %	0 %	0 %	385243796
13102	NC_017434	AACA	2	8	665903	665910	75 %	0 %	0 %	25 %	385243796
13103	NC_017434	TCT	2	6	665923	665928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243796
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13105	NC_017434	CT	4	8	666021	666028	0 %	50 %	0 %	50 %	385243796
13106	NC_017434	CTT	2	6	666039	666044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243796
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13110	NC_017434	TACTT	2	10	666412	666421	20 %	60 %	0 %	20 %	385243796
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