MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D-EC chromosome

Total Repeats: 20222

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_017434	GAA	2	6	611855	611860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243751
12003	NC_017434	AG	3	6	611894	611899	50 %	0 %	50 %	0 %	385243751
12004	NC_017434	CT	3	6	611900	611905	0 %	50 %	0 %	50 %	385243751
12005	NC_017434	TTAC	2	8	611922	611929	25 %	50 %	0 %	25 %	385243751
12006	NC_017434	TAA	2	6	611938	611943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243751
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12011	NC_017434	TTTG	2	8	612073	612080	0 %	75 %	25 %	0 %	385243751
12012	NC_017434	ATT	2	6	612091	612096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243751
12013	NC_017434	GGCT	2	8	612113	612120	0 %	25 %	50 %	25 %	385243751
12014	NC_017434	TCT	2	6	612165	612170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243751
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12021	NC_017434	AGC	2	6	612373	612378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243751
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12100	NC_017434	TTAT	2	8	616062	616069	25 %	75 %	0 %	0 %	385243752
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12102	NC_017434	TC	3	6	616153	616158	0 %	50 %	0 %	50 %	385243752
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12108	NC_017434	TGAAT	2	10	616728	616737	40 %	40 %	20 %	0 %	385243753
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12242	NC_017434	GGA	2	6	623198	623203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243761
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12487	NC_017434	CTC	2	6	635243	635248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243770
12488	NC_017434	TAT	2	6	635250	635255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243770
12489	NC_017434	TGG	2	6	635279	635284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385243770
12490	NC_017434	AGC	2	6	635295	635300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243770
12491	NC_017434	TTG	2	6	635342	635347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243770
12492	NC_017434	GGCT	2	8	635377	635384	0 %	25 %	50 %	25 %	385243770
12493	NC_017434	TGC	2	6	635406	635411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243770
12494	NC_017434	GGCTC	2	10	635480	635489	0 %	20 %	40 %	40 %	385243771
12495	NC_017434	TA	3	6	635503	635508	50 %	50 %	0 %	0 %	385243771
12496	NC_017434	AGCC	2	8	635516	635523	25 %	0 %	25 %	50 %	385243771
12497	NC_017434	TCTT	2	8	635540	635547	0 %	75 %	0 %	25 %	385243771
12498	NC_017434	ATC	2	6	635581	635586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243771
12499	NC_017434	CT	3	6	635638	635643	0 %	50 %	0 %	50 %	385243771
12500	NC_017434	TGC	2	6	635654	635659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243771

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