MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D-EC chromosome

Total Repeats: 20222

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_017434	TCG	2	6	585712	585717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243714
11502	NC_017434	AGA	2	6	585784	585789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243715
11503	NC_017434	CAG	2	6	585804	585809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243715
11504	NC_017434	CTT	2	6	585849	585854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243715
11505	NC_017434	AGC	2	6	585871	585876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243715
11506	NC_017434	AGC	2	6	585880	585885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243715
11507	NC_017434	GCA	2	6	585905	585910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243715
11508	NC_017434	CAG	2	6	585951	585956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243715
11509	NC_017434	CAG	2	6	585978	585983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243715
11510	NC_017434	TAT	2	6	586005	586010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243715
11511	NC_017434	T	6	6	586049	586054	0 %	100 %	0 %	0 %	385243715
11512	NC_017434	T	8	8	586075	586082	0 %	100 %	0 %	0 %	385243715
11513	NC_017434	ATT	3	9	586119	586127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243716
11514	NC_017434	TCT	2	6	586128	586133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243716
11515	NC_017434	TTTGTT	2	12	586175	586186	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385243716
11516	NC_017434	AAAG	2	8	586205	586212	75 %	0 %	25 %	0 %	385243716
11517	NC_017434	ACG	2	6	586273	586278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243716
11518	NC_017434	CAA	2	6	586293	586298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243716
11519	NC_017434	AT	3	6	586427	586432	50 %	50 %	0 %	0 %	385243716
11520	NC_017434	ATG	2	6	586478	586483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243716
11521	NC_017434	TCTT	2	8	586569	586576	0 %	75 %	0 %	25 %	385243717
11522	NC_017434	ACA	2	6	586737	586742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243717
11523	NC_017434	GGTT	2	8	586802	586809	0 %	50 %	50 %	0 %	385243717
11524	NC_017434	TTC	2	6	586845	586850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243717
11525	NC_017434	ATA	2	6	586911	586916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243717
11526	NC_017434	A	6	6	586927	586932	100 %	0 %	0 %	0 %	385243717
11527	NC_017434	AAG	2	6	586984	586989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243717
11528	NC_017434	GAAA	2	8	586998	587005	75 %	0 %	25 %	0 %	385243717
11529	NC_017434	CCT	2	6	587100	587105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243717
11530	NC_017434	CT	3	6	587111	587116	0 %	50 %	0 %	50 %	385243717
11531	NC_017434	AAT	2	6	587123	587128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243717
11532	NC_017434	AAT	2	6	587168	587173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243717
11533	NC_017434	GGAA	2	8	587294	587301	50 %	0 %	50 %	0 %	385243717
11534	NC_017434	AAATA	2	10	587424	587433	80 %	20 %	0 %	0 %	385243717
11535	NC_017434	ACA	2	6	587461	587466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243717
11536	NC_017434	AAC	2	6	587489	587494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243717
11537	NC_017434	ATTC	2	8	587498	587505	25 %	50 %	0 %	25 %	385243717
11538	NC_017434	GAC	2	6	587639	587644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243717
11539	NC_017434	AAG	2	6	587645	587650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243717
11540	NC_017434	AAC	2	6	587681	587686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243717
11541	NC_017434	A	6	6	587728	587733	100 %	0 %	0 %	0 %	385243717
11542	NC_017434	GCAA	2	8	587847	587854	50 %	0 %	25 %	25 %	385243717
11543	NC_017434	T	6	6	587872	587877	0 %	100 %	0 %	0 %	385243717
11544	NC_017434	GCA	2	6	587989	587994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243718
11545	NC_017434	TC	3	6	588053	588058	0 %	50 %	0 %	50 %	385243718
11546	NC_017434	TCTT	2	8	588072	588079	0 %	75 %	0 %	25 %	385243718
11547	NC_017434	GTTGT	2	10	588131	588140	0 %	60 %	40 %	0 %	385243718
11548	NC_017434	TTC	2	6	588144	588149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243718
11549	NC_017434	AGA	2	6	588300	588305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243718
11550	NC_017434	TTC	2	6	588329	588334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243718
11551	NC_017434	ATA	2	6	588398	588403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243719
11552	NC_017434	AG	3	6	588415	588420	50 %	0 %	50 %	0 %	385243719
11553	NC_017434	AGG	2	6	588425	588430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243719
11554	NC_017434	ATT	2	6	588463	588468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243719
11555	NC_017434	CAT	2	6	588588	588593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243719
11556	NC_017434	TCC	2	6	588622	588627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243719
11557	NC_017434	T	6	6	588653	588658	0 %	100 %	0 %	0 %	385243719
11558	NC_017434	AGC	2	6	588661	588666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243719
11559	NC_017434	AAACT	2	10	588764	588773	60 %	20 %	0 %	20 %	385243719
11560	NC_017434	CCT	2	6	588779	588784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243719
11561	NC_017434	AAC	2	6	588787	588792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243719
11562	NC_017434	ACA	2	6	588796	588801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243719
11563	NC_017434	GAC	2	6	588808	588813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243719
11564	NC_017434	CT	3	6	588900	588905	0 %	50 %	0 %	50 %	385243720
11565	NC_017434	CTA	2	6	588926	588931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243720
11566	NC_017434	CTC	2	6	588950	588955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243720
11567	NC_017434	AAC	2	6	588963	588968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243720
11568	NC_017434	T	6	6	589036	589041	0 %	100 %	0 %	0 %	385243720
11569	NC_017434	CAT	2	6	589109	589114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243720
11570	NC_017434	TA	3	6	589235	589240	50 %	50 %	0 %	0 %	385243720
11571	NC_017434	T	6	6	589278	589283	0 %	100 %	0 %	0 %	385243721
11572	NC_017434	GCT	2	6	589294	589299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243721
11573	NC_017434	ACG	2	6	589311	589316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243721
11574	NC_017434	AACT	2	8	589401	589408	50 %	25 %	0 %	25 %	385243721
11575	NC_017434	TCTA	2	8	589644	589651	25 %	50 %	0 %	25 %	385243721
11576	NC_017434	AACA	2	8	589671	589678	75 %	0 %	0 %	25 %	385243721
11577	NC_017434	CTT	2	6	589706	589711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243721
11578	NC_017434	TCA	2	6	589759	589764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243721
11579	NC_017434	ACCAA	2	10	589856	589865	60 %	0 %	0 %	40 %	385243722
11580	NC_017434	CGC	2	6	589877	589882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385243722
11581	NC_017434	GAG	2	6	589925	589930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243722
11582	NC_017434	TGC	2	6	589977	589982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243722
11583	NC_017434	CCT	2	6	589995	590000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243722
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11585	NC_017434	TCT	2	6	590047	590052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243722
11586	NC_017434	TCT	2	6	590092	590097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243722
11587	NC_017434	TGC	2	6	590125	590130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243722
11588	NC_017434	CTT	2	6	590282	590287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243723
11589	NC_017434	ATTC	2	8	590360	590367	25 %	50 %	0 %	25 %	385243723
11590	NC_017434	ATC	2	6	590417	590422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243723
11591	NC_017434	CATA	2	8	590524	590531	50 %	25 %	0 %	25 %	385243723
11592	NC_017434	TTA	2	6	590707	590712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243723
11593	NC_017434	TCT	2	6	590716	590721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243723
11594	NC_017434	TCTT	2	8	590773	590780	0 %	75 %	0 %	25 %	385243723
11595	NC_017434	TA	3	6	590791	590796	50 %	50 %	0 %	0 %	385243723
11596	NC_017434	T	7	7	590798	590804	0 %	100 %	0 %	0 %	385243723
11597	NC_017434	TC	4	8	590826	590833	0 %	50 %	0 %	50 %	385243724
11598	NC_017434	GAA	2	6	590851	590856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243724
11599	NC_017434	TC	3	6	590894	590899	0 %	50 %	0 %	50 %	385243724
11600	NC_017434	ACGT	2	8	590943	590950	25 %	25 %	25 %	25 %	385243724
11601	NC_017434	GAG	2	6	590963	590968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243724
11602	NC_017434	T	6	6	591019	591024	0 %	100 %	0 %	0 %	385243724
11603	NC_017434	AAC	2	6	591065	591070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243724
11604	NC_017434	AGCA	2	8	591105	591112	50 %	0 %	25 %	25 %	385243724
11605	NC_017434	ATC	2	6	591267	591272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243725
11606	NC_017434	GAT	2	6	591273	591278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243725
11607	NC_017434	AAC	2	6	591360	591365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243725
11608	NC_017434	CTT	2	6	591372	591377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243725
11609	NC_017434	ATCAC	2	10	591418	591427	40 %	20 %	0 %	40 %	385243725
11610	NC_017434	CGA	2	6	591445	591450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243725
11611	NC_017434	TAT	2	6	591494	591499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243725
11612	NC_017434	ACT	2	6	591546	591551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243726
11613	NC_017434	CTT	2	6	591627	591632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243726
11614	NC_017434	ATA	2	6	591655	591660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243726
11615	NC_017434	ACC	2	6	591677	591682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385243726
11616	NC_017434	AAC	3	9	591721	591729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243726
11617	NC_017434	T	6	6	591732	591737	0 %	100 %	0 %	0 %	385243726
11618	NC_017434	TGA	2	6	591745	591750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243726
11619	NC_017434	ACT	2	6	591752	591757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243726
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