MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D-EC chromosome

Total Repeats: 20222

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_017434	CGA	2	6	509360	509365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243648
10002	NC_017434	CAT	2	6	509402	509407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243648
10003	NC_017434	TC	3	6	509424	509429	0 %	50 %	0 %	50 %	385243648
10004	NC_017434	TC	4	8	509437	509444	0 %	50 %	0 %	50 %	385243648
10005	NC_017434	GTTC	2	8	509462	509469	0 %	50 %	25 %	25 %	385243648
10006	NC_017434	TCT	2	6	509508	509513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243648
10007	NC_017434	AGA	2	6	509527	509532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243648
10008	NC_017434	AAG	2	6	509562	509567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243648
10009	NC_017434	TCT	2	6	509576	509581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243648
10010	NC_017434	CAA	2	6	509606	509611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243648
10011	NC_017434	A	6	6	509699	509704	100 %	0 %	0 %	0 %	385243648
10012	NC_017434	CTT	2	6	509718	509723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243648
10013	NC_017434	GAA	2	6	509729	509734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243648
10014	NC_017434	TCT	3	9	509755	509763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243648
10015	NC_017434	ATCT	2	8	509773	509780	25 %	50 %	0 %	25 %	385243648
10016	NC_017434	AGA	2	6	509785	509790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243648
10017	NC_017434	GCA	2	6	509792	509797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243648
10018	NC_017434	A	6	6	509797	509802	100 %	0 %	0 %	0 %	385243648
10019	NC_017434	TAT	2	6	509941	509946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243648
10020	NC_017434	GAA	2	6	509996	510001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243648
10021	NC_017434	TG	3	6	510036	510041	0 %	50 %	50 %	0 %	385243648
10022	NC_017434	AGA	2	6	510061	510066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243648
10023	NC_017434	AAG	2	6	510087	510092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243648
10024	NC_017434	CTG	2	6	510108	510113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243648
10025	NC_017434	ATT	2	6	510143	510148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243648
10026	NC_017434	TCC	2	6	510224	510229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243648
10027	NC_017434	AAT	2	6	510254	510259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243648
10028	NC_017434	CGT	2	6	510278	510283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243648
10029	NC_017434	A	6	6	510285	510290	100 %	0 %	0 %	0 %	385243648
10030	NC_017434	GTC	2	6	510303	510308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243648
10031	NC_017434	A	7	7	510438	510444	100 %	0 %	0 %	0 %	385243648
10032	NC_017434	GA	3	6	510471	510476	50 %	0 %	50 %	0 %	385243648
10033	NC_017434	GGA	2	6	510482	510487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243648
10034	NC_017434	GGTTGT	2	12	510535	510546	0 %	50 %	50 %	0 %	385243648
10035	NC_017434	ATG	2	6	510606	510611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243648
10036	NC_017434	GCA	2	6	510650	510655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243648
10037	NC_017434	TTG	2	6	510660	510665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243648
10038	NC_017434	CAA	2	6	510710	510715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243648
10039	NC_017434	AAG	2	6	510768	510773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243648
10040	NC_017434	CA	3	6	510823	510828	50 %	0 %	0 %	50 %	385243648
10041	NC_017434	AGA	2	6	510874	510879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243648
10042	NC_017434	GA	3	6	511030	511035	50 %	0 %	50 %	0 %	385243648
10043	NC_017434	A	7	7	511077	511083	100 %	0 %	0 %	0 %	385243648
10044	NC_017434	A	7	7	511115	511121	100 %	0 %	0 %	0 %	385243648
10045	NC_017434	CAAA	2	8	511122	511129	75 %	0 %	0 %	25 %	385243648
10046	NC_017434	GATC	2	8	511133	511140	25 %	25 %	25 %	25 %	385243648
10047	NC_017434	GAA	2	6	511166	511171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243648
10048	NC_017434	CCA	2	6	511355	511360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385243649
10049	NC_017434	TCT	2	6	511368	511373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243649
10050	NC_017434	TCA	2	6	511414	511419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243649
10051	NC_017434	GTT	2	6	511437	511442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243649
10052	NC_017434	CAT	2	6	511451	511456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243649
10053	NC_017434	GAT	2	6	511458	511463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243649
10054	NC_017434	TCT	2	6	511465	511470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243649
10055	NC_017434	CTT	2	6	511485	511490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243649
10056	NC_017434	TC	3	6	511503	511508	0 %	50 %	0 %	50 %	385243649
10057	NC_017434	CTA	2	6	511580	511585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243649
10058	NC_017434	AGT	2	6	511648	511653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243649
10059	NC_017434	CAC	2	6	511659	511664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385243649
10060	NC_017434	AGA	2	6	511693	511698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243649
10061	NC_017434	AAC	2	6	511773	511778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243649
10062	NC_017434	TG	3	6	511980	511985	0 %	50 %	50 %	0 %	385243650
10063	NC_017434	GAA	2	6	512024	512029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243650
10064	NC_017434	CGAAT	2	10	512119	512128	40 %	20 %	20 %	20 %	385243650
10065	NC_017434	ACT	2	6	512129	512134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243650
10066	NC_017434	TCT	2	6	512225	512230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243650
10067	NC_017434	CTA	2	6	512301	512306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243650
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10069	NC_017434	AAG	2	6	512358	512363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243650
10070	NC_017434	AGC	2	6	512382	512387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243650
10071	NC_017434	CAA	2	6	512394	512399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243650
10072	NC_017434	ATT	2	6	512401	512406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243650
10073	NC_017434	ACT	2	6	512489	512494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243650
10074	NC_017434	TTA	2	6	512495	512500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243650
10075	NC_017434	ACG	2	6	512561	512566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243650
10076	NC_017434	TACT	2	8	512655	512662	25 %	50 %	0 %	25 %	385243650
10077	NC_017434	GTT	2	6	512687	512692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243650
10078	NC_017434	TCC	2	6	512713	512718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243650
10079	NC_017434	AGA	2	6	512842	512847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243650
10080	NC_017434	CAA	3	9	512877	512885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243650
10081	NC_017434	GCTGTT	2	12	512894	512905	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385243650
10082	NC_017434	ACT	2	6	512933	512938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243650
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10084	NC_017434	AGC	2	6	513051	513056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243650
10085	NC_017434	CTT	2	6	513060	513065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243650
10086	NC_017434	CAG	2	6	513144	513149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243650
10087	NC_017434	ATAGG	2	10	513254	513263	40 %	20 %	40 %	0 %	385243650
10088	NC_017434	TG	3	6	513296	513301	0 %	50 %	50 %	0 %	385243650
10089	NC_017434	ATC	2	6	513316	513321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243650
10090	NC_017434	T	6	6	513437	513442	0 %	100 %	0 %	0 %	385243650
10091	NC_017434	T	6	6	513448	513453	0 %	100 %	0 %	0 %	385243650
10092	NC_017434	AGCTA	2	10	513490	513499	40 %	20 %	20 %	20 %	385243650
10093	NC_017434	AG	4	8	513511	513518	50 %	0 %	50 %	0 %	385243650
10094	NC_017434	TGA	2	6	513600	513605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243650
10095	NC_017434	ACC	2	6	513900	513905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385243651
10096	NC_017434	TCTT	2	8	513913	513920	0 %	75 %	0 %	25 %	385243651
10097	NC_017434	ACA	2	6	513987	513992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243651
10098	NC_017434	ACT	2	6	513993	513998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243651
10099	NC_017434	ACA	2	6	514006	514011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243651
10100	NC_017434	AGC	2	6	514020	514025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243651
10101	NC_017434	T	7	7	514037	514043	0 %	100 %	0 %	0 %	385243651
10102	NC_017434	A	6	6	514378	514383	100 %	0 %	0 %	0 %	385243652
10103	NC_017434	CTG	2	6	514414	514419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243652
10104	NC_017434	CCT	2	6	514421	514426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243652
10105	NC_017434	TC	3	6	514519	514524	0 %	50 %	0 %	50 %	385243652
10106	NC_017434	CTT	2	6	514550	514555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243652
10107	NC_017434	CAC	2	6	514564	514569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385243652
10108	NC_017434	GAA	2	6	514587	514592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243652
10109	NC_017434	TGC	3	9	514662	514670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243653
10110	NC_017434	CTC	2	6	514684	514689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243653
10111	NC_017434	CTT	2	6	514817	514822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243653
10112	NC_017434	ATG	2	6	514823	514828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243653
10113	NC_017434	AGA	2	6	514867	514872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243653
10114	NC_017434	CTT	2	6	514892	514897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243653
10115	NC_017434	ACA	2	6	514921	514926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243653
10116	NC_017434	CTC	2	6	514967	514972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243653
10117	NC_017434	AAG	2	6	515001	515006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243653
10118	NC_017434	AG	3	6	515053	515058	50 %	0 %	50 %	0 %	385243653
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10120	NC_017434	CT	3	6	515118	515123	0 %	50 %	0 %	50 %	385243653
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10362	NC_017434	ATGA	2	8	529573	529580	50 %	25 %	25 %	0 %	385243663
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10481	NC_017434	CTT	2	6	534445	534450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243665
10482	NC_017434	TTC	2	6	534456	534461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243665
10483	NC_017434	AGA	2	6	534470	534475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243665
10484	NC_017434	CTTT	2	8	534478	534485	0 %	75 %	0 %	25 %	385243665
10485	NC_017434	C	7	7	534575	534581	0 %	0 %	0 %	100 %	385243665
10486	NC_017434	A	6	6	534619	534624	100 %	0 %	0 %	0 %	385243665
10487	NC_017434	CT	3	6	534887	534892	0 %	50 %	0 %	50 %	385243666
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