MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D-EC chromosome

Total Repeats: 20222

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_017434	GATCA	2	10	456443	456452	40 %	20 %	20 %	20 %	385243605
9002	NC_017434	GCT	2	6	456473	456478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243605
9003	NC_017434	A	8	8	456481	456488	100 %	0 %	0 %	0 %	385243605
9004	NC_017434	TAA	2	6	456529	456534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243605
9005	NC_017434	AAGC	2	8	456578	456585	50 %	0 %	25 %	25 %	385243605
9006	NC_017434	TCT	2	6	456598	456603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243605
9007	NC_017434	TC	3	6	456606	456611	0 %	50 %	0 %	50 %	385243605
9008	NC_017434	GAAA	2	8	456613	456620	75 %	0 %	25 %	0 %	385243605
9009	NC_017434	TC	3	6	456622	456627	0 %	50 %	0 %	50 %	385243605
9010	NC_017434	TAG	2	6	456640	456645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243605
9011	NC_017434	GAA	3	9	456656	456664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243605
9012	NC_017434	GA	3	6	456669	456674	50 %	0 %	50 %	0 %	385243605
9013	NC_017434	GAA	2	6	456692	456697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243605
9014	NC_017434	GAAA	2	8	456730	456737	75 %	0 %	25 %	0 %	385243605
9015	NC_017434	ATT	2	6	456751	456756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243605
9016	NC_017434	CAA	3	9	456778	456786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243605
9017	NC_017434	GTT	2	6	456797	456802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243605
9018	NC_017434	ATC	2	6	456882	456887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243605
9019	NC_017434	CAG	2	6	456945	456950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243605
9020	NC_017434	CGT	5	15	456968	456982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243605
9021	NC_017434	TAA	2	6	457420	457425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243606
9022	NC_017434	GCAT	2	8	457442	457449	25 %	25 %	25 %	25 %	385243606
9023	NC_017434	GTA	2	6	457452	457457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243606
9024	NC_017434	CAA	2	6	457461	457466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243606
9025	NC_017434	GTT	3	9	457473	457481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243606
9026	NC_017434	CAT	2	6	457525	457530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243606
9027	NC_017434	TGT	2	6	457592	457597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243606
9028	NC_017434	TCC	2	6	457618	457623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243606
9029	NC_017434	TAA	2	6	457669	457674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243606
9030	NC_017434	TAC	2	6	457690	457695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243606
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9032	NC_017434	GAA	2	6	457718	457723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243606
9033	NC_017434	AGT	2	6	457747	457752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243606
9034	NC_017434	AAT	2	6	457791	457796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243606
9035	NC_017434	AGA	2	6	457898	457903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243606
9036	NC_017434	A	6	6	457908	457913	100 %	0 %	0 %	0 %	385243606
9037	NC_017434	GCA	2	6	458024	458029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243606
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9039	NC_017434	TTC	2	6	458057	458062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243606
9040	NC_017434	TC	3	6	458085	458090	0 %	50 %	0 %	50 %	385243606
9041	NC_017434	CAC	2	6	458097	458102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385243606
9042	NC_017434	AAC	2	6	458137	458142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243606
9043	NC_017434	TCG	2	6	458205	458210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243606
9044	NC_017434	A	7	7	458253	458259	100 %	0 %	0 %	0 %	385243606
9045	NC_017434	TGA	2	6	458270	458275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243606
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9047	NC_017434	TGA	2	6	458297	458302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243606
9048	NC_017434	GTAC	2	8	458394	458401	25 %	25 %	25 %	25 %	385243606
9049	NC_017434	TCCA	2	8	458498	458505	25 %	25 %	0 %	50 %	385243607
9050	NC_017434	AC	3	6	458532	458537	50 %	0 %	0 %	50 %	385243607
9051	NC_017434	TCA	3	9	458562	458570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243607
9052	NC_017434	TTA	2	6	458715	458720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243607
9053	NC_017434	GAA	2	6	458733	458738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243607
9054	NC_017434	AAC	2	6	458801	458806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243607
9055	NC_017434	CTT	2	6	458812	458817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243607
9056	NC_017434	CTT	2	6	458852	458857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243607
9057	NC_017434	AGC	2	6	458966	458971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243607
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9059	NC_017434	CAA	2	6	459028	459033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243607
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9062	NC_017434	C	6	6	459198	459203	0 %	0 %	0 %	100 %	385243607
9063	NC_017434	CT	3	6	459293	459298	0 %	50 %	0 %	50 %	385243607
9064	NC_017434	TTCTC	2	10	459312	459321	0 %	60 %	0 %	40 %	385243607
9065	NC_017434	GCA	2	6	459363	459368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243607
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9067	NC_017434	TATCT	2	10	459473	459482	20 %	60 %	0 %	20 %	385243607
9068	NC_017434	TCAA	2	8	459492	459499	50 %	25 %	0 %	25 %	385243607
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9071	NC_017434	AGA	2	6	459886	459891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243608
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9075	NC_017434	CGAT	2	8	459980	459987	25 %	25 %	25 %	25 %	385243608
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9102	NC_017434	GATT	2	8	461455	461462	25 %	50 %	25 %	0 %	385243609
9103	NC_017434	TCT	2	6	461501	461506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243609
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9105	NC_017434	CCT	2	6	461632	461637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243609
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