MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/9301 chromosome

Total Repeats: 20333

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017432	GGA	2	6	184591	184596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242445
3502	NC_017432	TAG	2	6	184616	184621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242445
3503	NC_017432	AGT	2	6	184746	184751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242445
3504	NC_017432	ATCG	2	8	184773	184780	25 %	25 %	25 %	25 %	385242445
3505	NC_017432	TCA	2	6	184856	184861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242446
3506	NC_017432	GGA	2	6	184871	184876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242446
3507	NC_017432	AGAGA	2	10	184964	184973	60 %	0 %	40 %	0 %	385242446
3508	NC_017432	GCA	2	6	185060	185065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242446
3509	NC_017432	TTA	2	6	185357	185362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242446
3510	NC_017432	GAA	2	6	185426	185431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242446
3511	NC_017432	ATA	2	6	185486	185491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242446
3512	NC_017432	TCTA	2	8	185527	185534	25 %	50 %	0 %	25 %	385242446
3513	NC_017432	TGC	2	6	185728	185733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242447
3514	NC_017432	CA	3	6	185749	185754	50 %	0 %	0 %	50 %	385242447
3515	NC_017432	AGA	2	6	185864	185869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242447
3516	NC_017432	T	7	7	186220	186226	0 %	100 %	0 %	0 %	385242448
3517	NC_017432	TCT	2	6	186244	186249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242448
3518	NC_017432	TG	3	6	186254	186259	0 %	50 %	50 %	0 %	385242448
3519	NC_017432	GTC	2	6	186345	186350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242448
3520	NC_017432	ATT	2	6	186415	186420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242448
3521	NC_017432	TCT	2	6	186434	186439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242448
3522	NC_017432	CTT	2	6	186450	186455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242448
3523	NC_017432	AAGC	2	8	186488	186495	50 %	0 %	25 %	25 %	385242448
3524	NC_017432	GAA	2	6	186518	186523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242448
3525	NC_017432	AAC	2	6	186595	186600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242448
3526	NC_017432	TA	3	6	186672	186677	50 %	50 %	0 %	0 %	385242448
3527	NC_017432	CTT	2	6	186693	186698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242448
3528	NC_017432	TAG	2	6	186699	186704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242448
3529	NC_017432	CAT	2	6	186743	186748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242448
3530	NC_017432	T	6	6	186750	186755	0 %	100 %	0 %	0 %	385242448
3531	NC_017432	GCTT	2	8	186769	186776	0 %	50 %	25 %	25 %	385242448
3532	NC_017432	CAC	2	6	186801	186806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385242448
3533	NC_017432	GAA	2	6	186836	186841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242448
3534	NC_017432	AAG	2	6	186942	186947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242448
3535	NC_017432	TGT	2	6	186964	186969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242448
3536	NC_017432	ACGAT	2	10	187036	187045	40 %	20 %	20 %	20 %	385242448
3537	NC_017432	TTTA	2	8	187054	187061	25 %	75 %	0 %	0 %	385242448
3538	NC_017432	AAG	2	6	187065	187070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242448
3539	NC_017432	AGA	2	6	187150	187155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242448
3540	NC_017432	CTT	2	6	187187	187192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242448
3541	NC_017432	A	6	6	187205	187210	100 %	0 %	0 %	0 %	385242448
3542	NC_017432	AGG	2	6	187233	187238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242448
3543	NC_017432	GCTT	2	8	187261	187268	0 %	50 %	25 %	25 %	385242448
3544	NC_017432	T	7	7	187267	187273	0 %	100 %	0 %	0 %	385242448
3545	NC_017432	A	6	6	187308	187313	100 %	0 %	0 %	0 %	385242448
3546	NC_017432	GCT	2	6	187397	187402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242448
3547	NC_017432	TTC	2	6	187576	187581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242448
3548	NC_017432	GCTT	2	8	187696	187703	0 %	50 %	25 %	25 %	385242448
3549	NC_017432	TAG	2	6	187734	187739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242448
3550	NC_017432	GAT	2	6	187772	187777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242448
3551	NC_017432	T	7	7	187777	187783	0 %	100 %	0 %	0 %	385242448
3552	NC_017432	TTA	2	6	187807	187812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242448
3553	NC_017432	GGT	2	6	188836	188841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385242449
3554	NC_017432	CCT	2	6	188897	188902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242449
3555	NC_017432	CCT	2	6	188912	188917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242449
3556	NC_017432	CTC	2	6	189005	189010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242449
3557	NC_017432	TTA	2	6	189029	189034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242449
3558	NC_017432	CGTA	2	8	189052	189059	25 %	25 %	25 %	25 %	385242449
3559	NC_017432	G	10	10	189071	189080	0 %	0 %	100 %	0 %	385242449
3560	NC_017432	TCC	2	6	189106	189111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242449
3561	NC_017432	CAG	2	6	189114	189119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242449
3562	NC_017432	A	6	6	189133	189138	100 %	0 %	0 %	0 %	385242449
3563	NC_017432	AGA	2	6	189148	189153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242449
3564	NC_017432	GAA	2	6	189154	189159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242449
3565	NC_017432	GGA	2	6	189160	189165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242449
3566	NC_017432	CTT	2	6	189168	189173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242449
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3569	NC_017432	CAA	2	6	189362	189367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242450
3570	NC_017432	AGA	2	6	189390	189395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242450
3571	NC_017432	CAT	2	6	189405	189410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242450
3572	NC_017432	GAA	2	6	189455	189460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242450
3573	NC_017432	GAC	2	6	189469	189474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242450
3574	NC_017432	ATC	2	6	189542	189547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242450
3575	NC_017432	ACTTCT	2	12	189630	189641	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385242450
3576	NC_017432	GCA	2	6	189662	189667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242450
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3578	NC_017432	AAAG	2	8	189793	189800	75 %	0 %	25 %	0 %	385242450
3579	NC_017432	GAC	2	6	189808	189813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242450
3580	NC_017432	TGA	2	6	189883	189888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242450
3581	NC_017432	TTG	2	6	189930	189935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242450
3582	NC_017432	TGCT	2	8	189959	189966	0 %	50 %	25 %	25 %	385242450
3583	NC_017432	AGAA	2	8	190014	190021	75 %	0 %	25 %	0 %	385242450
3584	NC_017432	GAG	2	6	190037	190042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242450
3585	NC_017432	AGA	2	6	190080	190085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242450
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3587	NC_017432	GGATC	2	10	190121	190130	20 %	20 %	40 %	20 %	385242450
3588	NC_017432	AAGC	2	8	190169	190176	50 %	0 %	25 %	25 %	385242450
3589	NC_017432	CAGAT	2	10	190236	190245	40 %	20 %	20 %	20 %	385242450
3590	NC_017432	GTAT	2	8	190248	190255	25 %	50 %	25 %	0 %	385242450
3591	NC_017432	GGA	2	6	190261	190266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242450
3592	NC_017432	ATG	2	6	190295	190300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242450
3593	NC_017432	ACA	2	6	190427	190432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242450
3594	NC_017432	AGA	2	6	190480	190485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242450
3595	NC_017432	ATC	2	6	190656	190661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242450
3596	NC_017432	TC	3	6	190710	190715	0 %	50 %	0 %	50 %	385242450
3597	NC_017432	CTG	2	6	190737	190742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242450
3598	NC_017432	AGC	2	6	190777	190782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242450
3599	NC_017432	ATC	2	6	190866	190871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242450
3600	NC_017432	TCG	2	6	190872	190877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242450
3601	NC_017432	ATT	2	6	190881	190886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242450
3602	NC_017432	T	6	6	190901	190906	0 %	100 %	0 %	0 %	385242450
3603	NC_017432	CAA	2	6	191149	191154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242451
3604	NC_017432	ACGAT	2	10	191155	191164	40 %	20 %	20 %	20 %	385242451
3605	NC_017432	ACT	2	6	191307	191312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242451
3606	NC_017432	AAG	2	6	191494	191499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242451
3607	NC_017432	A	6	6	191517	191522	100 %	0 %	0 %	0 %	385242451
3608	NC_017432	TTC	2	6	191565	191570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242451
3609	NC_017432	AT	3	6	191600	191605	50 %	50 %	0 %	0 %	385242451
3610	NC_017432	TGT	2	6	191699	191704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242451
3611	NC_017432	GAA	2	6	191730	191735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242451
3612	NC_017432	TTG	2	6	191754	191759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242451
3613	NC_017432	TGA	2	6	191773	191778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242451
3614	NC_017432	TTA	2	6	191816	191821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242451
3615	NC_017432	TA	3	6	191848	191853	50 %	50 %	0 %	0 %	385242451
3616	NC_017432	TTA	2	6	191895	191900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242451
3617	NC_017432	GTGC	2	8	191958	191965	0 %	25 %	50 %	25 %	385242451
3618	NC_017432	CTT	2	6	192050	192055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242451
3619	NC_017432	AG	4	8	192083	192090	50 %	0 %	50 %	0 %	385242451
3620	NC_017432	TCA	2	6	192093	192098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242451
3621	NC_017432	TTGTA	2	10	192133	192142	20 %	60 %	20 %	0 %	385242451
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3623	NC_017432	ATTTGC	2	12	192323	192334	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385242451
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3995	NC_017432	TAA	2	6	211652	211657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242475
3996	NC_017432	GCC	2	6	211694	211699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385242475
3997	NC_017432	AGTA	2	8	211741	211748	50 %	25 %	25 %	0 %	385242475
3998	NC_017432	TTC	2	6	211795	211800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242475
3999	NC_017432	ATC	2	6	211875	211880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242475
4000	NC_017432	TGA	2	6	211892	211897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242475

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