MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/9301 chromosome

Total Repeats: 20333

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_017432	TTG	2	6	950030	950035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243135
18503	NC_017432	AGA	2	6	950206	950211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243135
18504	NC_017432	T	6	6	950275	950280	0 %	100 %	0 %	0 %	385243135
18505	NC_017432	CGG	2	6	950367	950372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385243135
18506	NC_017432	TAT	2	6	950464	950469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243135
18507	NC_017432	GGA	2	6	950531	950536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243135
18508	NC_017432	GATT	2	8	950548	950555	25 %	50 %	25 %	0 %	385243135
18509	NC_017432	GTA	2	6	950886	950891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243136
18510	NC_017432	GGA	2	6	950946	950951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243136
18511	NC_017432	AGC	2	6	951225	951230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243136
18512	NC_017432	T	6	6	951260	951265	0 %	100 %	0 %	0 %	385243136
18513	NC_017432	TTG	2	6	951277	951282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243136
18514	NC_017432	TAG	2	6	951287	951292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243136
18515	NC_017432	CTT	2	6	951325	951330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243136
18516	NC_017432	AGA	2	6	951356	951361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243136
18517	NC_017432	CAT	2	6	951400	951405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243136
18518	NC_017432	TTC	2	6	951407	951412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243136
18519	NC_017432	G	6	6	951422	951427	0 %	0 %	100 %	0 %	385243136
18520	NC_017432	TAC	2	6	951488	951493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243136
18521	NC_017432	ATC	2	6	951526	951531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243136
18522	NC_017432	GGA	2	6	951540	951545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243136
18523	NC_017432	CTTT	2	8	951550	951557	0 %	75 %	0 %	25 %	385243136
18524	NC_017432	GA	3	6	951577	951582	50 %	0 %	50 %	0 %	385243136
18525	NC_017432	GGA	2	6	951672	951677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243136
18526	NC_017432	TGC	2	6	951683	951688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243136
18527	NC_017432	CTT	2	6	951727	951732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243136
18528	NC_017432	GGA	2	6	951756	951761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243136
18529	NC_017432	TCT	2	6	951873	951878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243136
18530	NC_017432	AGG	2	6	951944	951949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243136
18531	NC_017432	GCTT	2	8	952017	952024	0 %	50 %	25 %	25 %	385243136
18532	NC_017432	AGG	3	9	952025	952033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243136
18533	NC_017432	GAGG	2	8	952092	952099	25 %	0 %	75 %	0 %	385243136
18534	NC_017432	GGA	2	6	952113	952118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243136
18535	NC_017432	TTC	2	6	952139	952144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243136
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18538	NC_017432	TC	3	6	952207	952212	0 %	50 %	0 %	50 %	385243136
18539	NC_017432	GAG	3	9	952258	952266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243136
18540	NC_017432	ACA	2	6	952324	952329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243136
18541	NC_017432	GAG	3	9	952366	952374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243136
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18543	NC_017432	A	6	6	952491	952496	100 %	0 %	0 %	0 %	385243136
18544	NC_017432	CT	3	6	952509	952514	0 %	50 %	0 %	50 %	385243136
18545	NC_017432	GAG	2	6	952531	952536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243136
18546	NC_017432	AGT	2	6	952577	952582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243136
18547	NC_017432	TGCAG	2	10	952600	952609	20 %	20 %	40 %	20 %	385243136
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18552	NC_017432	GGAT	2	8	952660	952667	25 %	25 %	50 %	0 %	385243136
18553	NC_017432	TTG	2	6	952678	952683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243136
18554	NC_017432	TAA	2	6	952706	952711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243136
18555	NC_017432	AGG	2	6	952736	952741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243136
18556	NC_017432	GAG	3	9	952816	952824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243136
18557	NC_017432	GAGG	2	8	952891	952898	25 %	0 %	75 %	0 %	385243136
18558	NC_017432	ACA	2	6	952975	952980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243136
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18561	NC_017432	CTTT	2	8	953064	953071	0 %	75 %	0 %	25 %	385243136
18562	NC_017432	TTA	2	6	953095	953100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243136
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