MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/9301 chromosome

Total Repeats: 20333

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_017432	CAG	2	6	924939	924944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243113
18003	NC_017432	ATA	2	6	925024	925029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243113
18004	NC_017432	AGA	2	6	925042	925047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243113
18005	NC_017432	AGT	2	6	925103	925108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243113
18006	NC_017432	GA	3	6	925144	925149	50 %	0 %	50 %	0 %	385243113
18007	NC_017432	TTTCA	2	10	925417	925426	20 %	60 %	0 %	20 %	385243113
18008	NC_017432	T	9	9	925558	925566	0 %	100 %	0 %	0 %	385243113
18009	NC_017432	T	6	6	925687	925692	0 %	100 %	0 %	0 %	385243113
18010	NC_017432	GTT	2	6	925699	925704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243113
18011	NC_017432	ACA	2	6	925736	925741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243113
18012	NC_017432	T	7	7	925761	925767	0 %	100 %	0 %	0 %	385243113
18013	NC_017432	A	6	6	925772	925777	100 %	0 %	0 %	0 %	385243113
18014	NC_017432	CTTT	2	8	925800	925807	0 %	75 %	0 %	25 %	385243113
18015	NC_017432	GAA	2	6	925817	925822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243113
18016	NC_017432	TAGA	2	8	925885	925892	50 %	25 %	25 %	0 %	385243113
18017	NC_017432	GAA	3	9	925901	925909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243113
18018	NC_017432	GTT	2	6	925980	925985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243114
18019	NC_017432	CTG	2	6	926038	926043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243114
18020	NC_017432	T	7	7	926103	926109	0 %	100 %	0 %	0 %	385243114
18021	NC_017432	T	6	6	926251	926256	0 %	100 %	0 %	0 %	385243114
18022	NC_017432	CTA	2	6	926280	926285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243114
18023	NC_017432	CAT	2	6	926307	926312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243114
18024	NC_017432	TCA	2	6	926336	926341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243114
18025	NC_017432	ATCT	2	8	926355	926362	25 %	50 %	0 %	25 %	385243114
18026	NC_017432	CTA	2	6	926466	926471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243114
18027	NC_017432	GAG	2	6	926581	926586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243114
18028	NC_017432	TAG	2	6	926647	926652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243114
18029	NC_017432	GCG	2	6	926716	926721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385243114
18030	NC_017432	TTG	2	6	926899	926904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243114
18031	NC_017432	AGA	2	6	927122	927127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243114
18032	NC_017432	GAT	2	6	927132	927137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243114
18033	NC_017432	GA	3	6	927214	927219	50 %	0 %	50 %	0 %	385243114
18034	NC_017432	TG	3	6	927294	927299	0 %	50 %	50 %	0 %	385243114
18035	NC_017432	AG	3	6	927304	927309	50 %	0 %	50 %	0 %	385243114
18036	NC_017432	TAG	2	6	927366	927371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243114
18037	NC_017432	TGCT	2	8	927430	927437	0 %	50 %	25 %	25 %	385243114
18038	NC_017432	CTGTC	2	10	927455	927464	0 %	40 %	20 %	40 %	385243114
18039	NC_017432	GATT	2	8	927495	927502	25 %	50 %	25 %	0 %	385243114
18040	NC_017432	TAA	2	6	927514	927519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243114
18041	NC_017432	GTTC	2	8	927542	927549	0 %	50 %	25 %	25 %	385243114
18042	NC_017432	AGT	2	6	927599	927604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243114
18043	NC_017432	TTTG	2	8	927611	927618	0 %	75 %	25 %	0 %	385243114
18044	NC_017432	TGT	2	6	927647	927652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243114
18045	NC_017432	AG	3	6	927670	927675	50 %	0 %	50 %	0 %	385243114
18046	NC_017432	GAA	3	9	927687	927695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243114
18047	NC_017432	TA	3	6	927795	927800	50 %	50 %	0 %	0 %	385243114
18048	NC_017432	TTG	2	6	927807	927812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243114
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18050	NC_017432	TAA	2	6	927882	927887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243114
18051	NC_017432	T	7	7	927896	927902	0 %	100 %	0 %	0 %	385243114
18052	NC_017432	AGCC	2	8	927937	927944	25 %	0 %	25 %	50 %	385243114
18053	NC_017432	TAT	2	6	927972	927977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243114
18054	NC_017432	CAA	2	6	927987	927992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243114
18055	NC_017432	GA	3	6	928022	928027	50 %	0 %	50 %	0 %	385243114
18056	NC_017432	AG	3	6	928032	928037	50 %	0 %	50 %	0 %	385243114
18057	NC_017432	TTGA	2	8	928045	928052	25 %	50 %	25 %	0 %	385243114
18058	NC_017432	AGA	2	6	928090	928095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243114
18059	NC_017432	TAT	2	6	928164	928169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243114
18060	NC_017432	ATCC	2	8	928224	928231	25 %	25 %	0 %	50 %	385243114
18061	NC_017432	A	6	6	928321	928326	100 %	0 %	0 %	0 %	385243114
18062	NC_017432	TGC	2	6	928397	928402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243114
18063	NC_017432	TG	3	6	928419	928424	0 %	50 %	50 %	0 %	385243114
18064	NC_017432	AGA	2	6	928772	928777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243115
18065	NC_017432	ATG	2	6	928882	928887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243115
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18070	NC_017432	TTA	2	6	929136	929141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243115
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18072	NC_017432	CGATA	2	10	929198	929207	40 %	20 %	20 %	20 %	385243115
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18085	NC_017432	TTAT	2	8	929651	929658	25 %	75 %	0 %	0 %	385243115
18086	NC_017432	TGC	2	6	929672	929677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243115
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18089	NC_017432	AGAGG	2	10	929820	929829	40 %	0 %	60 %	0 %	385243115
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18096	NC_017432	CTG	3	9	930034	930042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243115
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18106	NC_017432	GA	4	8	930517	930524	50 %	0 %	50 %	0 %	385243115
18107	NC_017432	AGC	2	6	930695	930700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243116
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18111	NC_017432	CTA	2	6	930789	930794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243116
18112	NC_017432	TGGGG	2	10	930824	930833	0 %	20 %	80 %	0 %	385243116
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18358	NC_017432	AT	3	6	943071	943076	50 %	50 %	0 %	0 %	385243130
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