MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/9301 chromosome

Total Repeats: 20333

< Previous12...29303132333435363738394041Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16502	NC_017432	ATT	2	6	835662	835667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243042
16503	NC_017432	TGAA	2	8	835669	835676	50 %	25 %	25 %	0 %	385243042
16504	NC_017432	A	6	6	835680	835685	100 %	0 %	0 %	0 %	385243042
16505	NC_017432	TCG	2	6	835846	835851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243042
16506	NC_017432	TTAGA	2	10	835853	835862	40 %	40 %	20 %	0 %	385243042
16507	NC_017432	T	6	6	835979	835984	0 %	100 %	0 %	0 %	385243043
16508	NC_017432	AGG	2	6	836007	836012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243043
16509	NC_017432	A	8	8	836094	836101	100 %	0 %	0 %	0 %	385243043
16510	NC_017432	AGA	2	6	836154	836159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243043
16511	NC_017432	T	6	6	836257	836262	0 %	100 %	0 %	0 %	385243043
16512	NC_017432	GAA	2	6	836335	836340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243043
16513	NC_017432	GAAA	2	8	836528	836535	75 %	0 %	25 %	0 %	385243044
16514	NC_017432	TAT	2	6	836538	836543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243044
16515	NC_017432	CTTT	2	8	836589	836596	0 %	75 %	0 %	25 %	385243044
16516	NC_017432	CGG	2	6	836641	836646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385243044
16517	NC_017432	AAT	2	6	836724	836729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243044
16518	NC_017432	AAG	2	6	836800	836805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243044
16519	NC_017432	ACG	2	6	836824	836829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243044
16520	NC_017432	A	6	6	836844	836849	100 %	0 %	0 %	0 %	385243044
16521	NC_017432	TG	3	6	836863	836868	0 %	50 %	50 %	0 %	385243044
16522	NC_017432	GT	3	6	836894	836899	0 %	50 %	50 %	0 %	385243044
16523	NC_017432	ATT	2	6	836901	836906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243044
16524	NC_017432	TGA	2	6	836936	836941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243044
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16526	NC_017432	GAA	2	6	837006	837011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243044
16527	NC_017432	GAAA	2	8	837029	837036	75 %	0 %	25 %	0 %	385243044
16528	NC_017432	TAGT	2	8	837084	837091	25 %	50 %	25 %	0 %	385243045
16529	NC_017432	AAG	2	6	837134	837139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243045
16530	NC_017432	TAG	2	6	837143	837148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243045
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16533	NC_017432	CTC	2	6	837263	837268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243045
16534	NC_017432	ATC	2	6	837288	837293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243045
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16537	NC_017432	AGCC	2	8	837424	837431	25 %	0 %	25 %	50 %	385243045
16538	NC_017432	CCT	2	6	837475	837480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243045
16539	NC_017432	AG	3	6	837496	837501	50 %	0 %	50 %	0 %	385243045
16540	NC_017432	AGA	2	6	837602	837607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243045
16541	NC_017432	TAG	2	6	837609	837614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243045
16542	NC_017432	AG	3	6	837613	837618	50 %	0 %	50 %	0 %	385243045
16543	NC_017432	GGA	2	6	837664	837669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243045
16544	NC_017432	A	6	6	837686	837691	100 %	0 %	0 %	0 %	385243045
16545	NC_017432	AAT	2	6	837771	837776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243045
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16548	NC_017432	TACA	2	8	838017	838024	50 %	25 %	0 %	25 %	385243045
16549	NC_017432	T	6	6	838071	838076	0 %	100 %	0 %	0 %	385243045
16550	NC_017432	AGA	2	6	838119	838124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243045
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16553	NC_017432	T	7	7	838217	838223	0 %	100 %	0 %	0 %	385243045
16554	NC_017432	T	6	6	838325	838330	0 %	100 %	0 %	0 %	385243046
16555	NC_017432	AAAT	2	8	838428	838435	75 %	25 %	0 %	0 %	385243046
16556	NC_017432	AAT	2	6	838438	838443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243046
16557	NC_017432	CGA	2	6	838478	838483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243046
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16559	NC_017432	CAC	2	6	838540	838545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385243046
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16561	NC_017432	CATA	2	8	838780	838787	50 %	25 %	0 %	25 %	385243046
16562	NC_017432	GCA	2	6	838826	838831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243046
16563	NC_017432	CGTGG	2	10	838833	838842	0 %	20 %	60 %	20 %	385243046
16564	NC_017432	AAGC	2	8	838880	838887	50 %	0 %	25 %	25 %	385243046
16565	NC_017432	TTC	2	6	838951	838956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243046
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16593	NC_017432	CTTG	2	8	840548	840555	0 %	50 %	25 %	25 %	385243047
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16602	NC_017432	CAAT	2	8	840922	840929	50 %	25 %	0 %	25 %	385243047
16603	NC_017432	T	7	7	840960	840966	0 %	100 %	0 %	0 %	385243047
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16620	NC_017432	AG	3	6	841634	841639	50 %	0 %	50 %	0 %	385243048
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16987	NC_017432	CTT	3	9	866654	866662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243064
16988	NC_017432	AGA	2	6	866683	866688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243064
16989	NC_017432	GA	3	6	866687	866692	50 %	0 %	50 %	0 %	385243064
16990	NC_017432	TAA	2	6	866748	866753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243064
16991	NC_017432	G	7	7	866797	866803	0 %	0 %	100 %	0 %	385243064
16992	NC_017432	ATGC	2	8	866804	866811	25 %	25 %	25 %	25 %	385243064
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