MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/9301 chromosome

Total Repeats: 20333

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017432	TCAGA	2	10	54626	54635	40 %	20 %	20 %	20 %	385242337
1002	NC_017432	A	6	6	54725	54730	100 %	0 %	0 %	0 %	385242337
1003	NC_017432	G	6	6	54781	54786	0 %	0 %	100 %	0 %	385242337
1004	NC_017432	GGAA	2	8	54892	54899	50 %	0 %	50 %	0 %	385242337
1005	NC_017432	GATCTG	2	12	54915	54926	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385242337
1006	NC_017432	GTGTAA	2	12	54963	54974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242337
1007	NC_017432	GCA	2	6	54977	54982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242337
1008	NC_017432	TGG	2	6	55029	55034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385242337
1009	NC_017432	GGTTCA	2	12	55052	55063	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385242337
1010	NC_017432	TTATC	2	10	55153	55162	20 %	60 %	0 %	20 %	385242337
1011	NC_017432	TGAGT	2	10	55174	55183	20 %	40 %	40 %	0 %	385242337
1012	NC_017432	TCA	3	9	55187	55195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242337
1013	NC_017432	GTT	2	6	55202	55207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242337
1014	NC_017432	CTG	2	6	55248	55253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242337
1015	NC_017432	GAG	2	6	55254	55259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242337
1016	NC_017432	TGC	2	6	55288	55293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242337
1017	NC_017432	AT	3	6	55498	55503	50 %	50 %	0 %	0 %	385242337
1018	NC_017432	TTA	2	6	55513	55518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242337
1019	NC_017432	CTGG	3	12	55791	55802	0 %	25 %	50 %	25 %	385242338
1020	NC_017432	ATT	2	6	55806	55811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242338
1021	NC_017432	GAT	2	6	55819	55824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242338
1022	NC_017432	TCT	2	6	55837	55842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242338
1023	NC_017432	TCC	2	6	55872	55877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242338
1024	NC_017432	TTA	2	6	55885	55890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242338
1025	NC_017432	TTGC	2	8	55928	55935	0 %	50 %	25 %	25 %	385242338
1026	NC_017432	AGCG	2	8	55968	55975	25 %	0 %	50 %	25 %	385242338
1027	NC_017432	T	6	6	55980	55985	0 %	100 %	0 %	0 %	385242338
1028	NC_017432	GTA	2	6	56011	56016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242338
1029	NC_017432	GTT	2	6	56122	56127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242338
1030	NC_017432	TGG	2	6	56142	56147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385242338
1031	NC_017432	GTTGT	2	10	56221	56230	0 %	60 %	40 %	0 %	385242338
1032	NC_017432	T	6	6	56276	56281	0 %	100 %	0 %	0 %	385242338
1033	NC_017432	TGA	2	6	57916	57921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242339
1034	NC_017432	TGAAAA	2	12	59048	59059	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385242340
1035	NC_017432	AGA	2	6	59060	59065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242340
1036	NC_017432	TCT	2	6	59076	59081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242340
1037	NC_017432	T	6	6	59108	59113	0 %	100 %	0 %	0 %	385242340
1038	NC_017432	CGTT	2	8	59259	59266	0 %	50 %	25 %	25 %	385242340
1039	NC_017432	GGAG	2	8	59268	59275	25 %	0 %	75 %	0 %	385242340
1040	NC_017432	GTAA	2	8	59320	59327	50 %	25 %	25 %	0 %	385242340
1041	NC_017432	TCCTAA	2	12	59387	59398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242340
1042	NC_017432	AGT	2	6	59416	59421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242340
1043	NC_017432	T	6	6	59448	59453	0 %	100 %	0 %	0 %	385242340
1044	NC_017432	TAG	2	6	59495	59500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242340
1045	NC_017432	GCT	2	6	59508	59513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242340
1046	NC_017432	GTC	2	6	59534	59539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242340
1047	NC_017432	ATGG	2	8	59547	59554	25 %	25 %	50 %	0 %	385242340
1048	NC_017432	AGG	2	6	59581	59586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242340
1049	NC_017432	GA	3	6	59633	59638	50 %	0 %	50 %	0 %	385242340
1050	NC_017432	CAA	2	6	59656	59661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242340
1051	NC_017432	ATAA	2	8	59693	59700	75 %	25 %	0 %	0 %	385242340
1052	NC_017432	GAGCA	2	10	59733	59742	40 %	0 %	40 %	20 %	385242340
1053	NC_017432	GT	3	6	59771	59776	0 %	50 %	50 %	0 %	385242340
1054	NC_017432	TAG	2	6	59783	59788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242340
1055	NC_017432	AAG	2	6	59968	59973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242340
1056	NC_017432	CTC	2	6	59980	59985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242340
1057	NC_017432	AAC	2	6	60013	60018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242340
1058	NC_017432	T	7	7	60032	60038	0 %	100 %	0 %	0 %	385242340
1059	NC_017432	CTT	2	6	60082	60087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242340
1060	NC_017432	AAT	2	6	60112	60117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242340
1061	NC_017432	TTC	2	6	60123	60128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242340
1062	NC_017432	ATGT	2	8	60143	60150	25 %	50 %	25 %	0 %	385242340
1063	NC_017432	CATT	2	8	60172	60179	25 %	50 %	0 %	25 %	385242340
1064	NC_017432	ATG	2	6	60193	60198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242341
1065	NC_017432	CCT	2	6	60199	60204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242341
1066	NC_017432	TCT	2	6	60277	60282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242341
1067	NC_017432	TCA	2	6	60289	60294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242341
1068	NC_017432	TTC	2	6	60410	60415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242341
1069	NC_017432	CTTT	2	8	60445	60452	0 %	75 %	0 %	25 %	385242341
1070	NC_017432	TTCT	2	8	60468	60475	0 %	75 %	0 %	25 %	385242341
1071	NC_017432	TTC	2	6	60507	60512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242341
1072	NC_017432	TC	3	6	60519	60524	0 %	50 %	0 %	50 %	385242341
1073	NC_017432	T	6	6	60531	60536	0 %	100 %	0 %	0 %	385242341
1074	NC_017432	T	7	7	60591	60597	0 %	100 %	0 %	0 %	385242341
1075	NC_017432	TCA	2	6	60976	60981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242342
1076	NC_017432	TTC	2	6	61038	61043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242342
1077	NC_017432	TCT	2	6	61102	61107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242342
1078	NC_017432	A	6	6	61138	61143	100 %	0 %	0 %	0 %	385242342
1079	NC_017432	CA	3	6	61145	61150	50 %	0 %	0 %	50 %	385242342
1080	NC_017432	TGA	2	6	61157	61162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242342
1081	NC_017432	TTA	2	6	61170	61175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242342
1082	NC_017432	TCA	2	6	61210	61215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242342
1083	NC_017432	GAA	2	6	61216	61221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242342
1084	NC_017432	TCT	2	6	61222	61227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242342
1085	NC_017432	AAG	2	6	61262	61267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242342
1086	NC_017432	CTT	2	6	61274	61279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242342
1087	NC_017432	ATT	2	6	61284	61289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242342
1088	NC_017432	AT	3	6	61395	61400	50 %	50 %	0 %	0 %	385242342
1089	NC_017432	GA	3	6	61418	61423	50 %	0 %	50 %	0 %	385242342
1090	NC_017432	TTC	2	6	61445	61450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242342
1091	NC_017432	GAA	2	6	61489	61494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242342
1092	NC_017432	GA	3	6	61544	61549	50 %	0 %	50 %	0 %	385242342
1093	NC_017432	ATG	2	6	61786	61791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242342
1094	NC_017432	TGT	2	6	61833	61838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242342
1095	NC_017432	AGC	2	6	61851	61856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242342
1096	NC_017432	AAT	2	6	62014	62019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242342
1097	NC_017432	ATG	2	6	62086	62091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242342
1098	NC_017432	TGTGA	2	10	62182	62191	20 %	40 %	40 %	0 %	385242342
1099	NC_017432	TGT	2	6	62203	62208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242342
1100	NC_017432	A	6	6	62284	62289	100 %	0 %	0 %	0 %	385242342
1101	NC_017432	ATT	2	6	62301	62306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242342
1102	NC_017432	CGA	2	6	62349	62354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242342
1103	NC_017432	GA	3	6	62359	62364	50 %	0 %	50 %	0 %	385242342
1104	NC_017432	A	6	6	62440	62445	100 %	0 %	0 %	0 %	385242342
1105	NC_017432	CTT	2	6	62482	62487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242342
1106	NC_017432	AAG	2	6	62516	62521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242342
1107	NC_017432	TTA	2	6	62593	62598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242342
1108	NC_017432	CTT	2	6	62669	62674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242342
1109	NC_017432	AAG	2	6	62681	62686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242342
1110	NC_017432	TC	3	6	62780	62785	0 %	50 %	0 %	50 %	385242342
1111	NC_017432	CAA	2	6	62881	62886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242342
1112	NC_017432	AT	3	6	62961	62966	50 %	50 %	0 %	0 %	385242342
1113	NC_017432	TTC	2	6	62967	62972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242342
1114	NC_017432	GTT	2	6	63106	63111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242342
1115	NC_017432	CTTC	2	8	63112	63119	0 %	50 %	0 %	50 %	385242342
1116	NC_017432	AG	3	6	63161	63166	50 %	0 %	50 %	0 %	385242342
1117	NC_017432	CT	4	8	63169	63176	0 %	50 %	0 %	50 %	385242342
1118	NC_017432	T	6	6	63188	63193	0 %	100 %	0 %	0 %	385242342
1119	NC_017432	GTTCTT	2	12	63307	63318	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385242342
1120	NC_017432	TTA	2	6	63333	63338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242342
1121	NC_017432	AG	3	6	63396	63401	50 %	0 %	50 %	0 %	385242342
1122	NC_017432	AGA	2	6	63420	63425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242342
1123	NC_017432	TATG	2	8	63466	63473	25 %	50 %	25 %	0 %	385242342
1124	NC_017432	AAG	2	6	63479	63484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242342
1125	NC_017432	AGT	2	6	63574	63579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242342
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1127	NC_017432	AGTGA	2	10	63709	63718	40 %	20 %	40 %	0 %	385242343
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