MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/9301 chromosome

Total Repeats: 20333

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_017432	A	6	6	687797	687802	100 %	0 %	0 %	0 %	385242918
13502	NC_017432	TGC	2	6	687890	687895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242918
13503	NC_017432	GAT	2	6	687912	687917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242918
13504	NC_017432	TTG	2	6	687990	687995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242918
13505	NC_017432	ACCA	2	8	688014	688021	50 %	0 %	0 %	50 %	385242918
13506	NC_017432	TGC	2	6	688049	688054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242918
13507	NC_017432	TA	3	6	688097	688102	50 %	50 %	0 %	0 %	385242918
13508	NC_017432	ATT	2	6	688150	688155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242918
13509	NC_017432	GTT	2	6	688167	688172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242918
13510	NC_017432	AGA	2	6	688178	688183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242918
13511	NC_017432	AAT	2	6	688236	688241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242918
13512	NC_017432	A	6	6	688255	688260	100 %	0 %	0 %	0 %	385242918
13513	NC_017432	CT	4	8	688381	688388	0 %	50 %	0 %	50 %	385242918
13514	NC_017432	CGAA	2	8	688407	688414	50 %	0 %	25 %	25 %	385242918
13515	NC_017432	CTT	2	6	688443	688448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242918
13516	NC_017432	TAA	2	6	688541	688546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242918
13517	NC_017432	A	6	6	688584	688589	100 %	0 %	0 %	0 %	385242918
13518	NC_017432	ACA	2	6	688638	688643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242918
13519	NC_017432	ACCT	2	8	688645	688652	25 %	25 %	0 %	50 %	385242918
13520	NC_017432	TTG	2	6	688664	688669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242918
13521	NC_017432	A	6	6	688683	688688	100 %	0 %	0 %	0 %	385242918
13522	NC_017432	A	6	6	688704	688709	100 %	0 %	0 %	0 %	385242918
13523	NC_017432	AGC	2	6	688756	688761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242918
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13526	NC_017432	A	6	6	688862	688867	100 %	0 %	0 %	0 %	385242918
13527	NC_017432	ATT	2	6	688880	688885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242918
13528	NC_017432	AGA	2	6	688937	688942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242918
13529	NC_017432	GAA	2	6	689058	689063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242918
13530	NC_017432	CTT	2	6	689067	689072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242918
13531	NC_017432	GAACG	2	10	689197	689206	40 %	0 %	40 %	20 %	385242918
13532	NC_017432	CAG	2	6	689219	689224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242918
13533	NC_017432	TTA	2	6	689227	689232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242918
13534	NC_017432	GCATCA	2	12	689276	689287	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385242919
13535	NC_017432	TCC	2	6	689429	689434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242919
13536	NC_017432	CTT	2	6	689499	689504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242919
13537	NC_017432	CAA	2	6	689667	689672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242919
13538	NC_017432	CTA	2	6	689724	689729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242919
13539	NC_017432	AGG	2	6	689746	689751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242919
13540	NC_017432	TAT	2	6	689759	689764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242919
13541	NC_017432	ACT	2	6	689802	689807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242919
13542	NC_017432	ATGC	2	8	689820	689827	25 %	25 %	25 %	25 %	385242919
13543	NC_017432	CAG	3	9	689887	689895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242919
13544	NC_017432	C	6	6	689915	689920	0 %	0 %	0 %	100 %	385242919
13545	NC_017432	CTT	2	6	689965	689970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242919
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13552	NC_017432	GAA	2	6	690123	690128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242919
13553	NC_017432	AAG	2	6	690166	690171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242919
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13555	NC_017432	A	6	6	690183	690188	100 %	0 %	0 %	0 %	385242919
13556	NC_017432	CT	4	8	690234	690241	0 %	50 %	0 %	50 %	385242919
13557	NC_017432	ATA	2	6	690271	690276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242919
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13560	NC_017432	ACG	2	6	690464	690469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242919
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13580	NC_017432	CAT	2	6	691379	691384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242920
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13583	NC_017432	ACAA	2	8	691555	691562	75 %	0 %	0 %	25 %	385242921
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13591	NC_017432	T	6	6	691876	691881	0 %	100 %	0 %	0 %	385242921
13592	NC_017432	AT	3	6	691888	691893	50 %	50 %	0 %	0 %	385242921
13593	NC_017432	ACAAA	2	10	691906	691915	80 %	0 %	0 %	20 %	385242921
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13600	NC_017432	TG	3	6	692217	692222	0 %	50 %	50 %	0 %	385242922
13601	NC_017432	A	6	6	692253	692258	100 %	0 %	0 %	0 %	385242922
13602	NC_017432	GCTCC	2	10	692269	692278	0 %	20 %	20 %	60 %	385242922
13603	NC_017432	GAT	2	6	692293	692298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242922
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13605	NC_017432	TGG	2	6	692348	692353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385242922
13606	NC_017432	ATG	2	6	692436	692441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242922
13607	NC_017432	GAT	2	6	692443	692448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242922
13608	NC_017432	A	7	7	692465	692471	100 %	0 %	0 %	0 %	385242922
13609	NC_017432	CTC	2	6	692521	692526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242922
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13612	NC_017432	TCCA	2	8	692785	692792	25 %	25 %	0 %	50 %	385242923
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13617	NC_017432	TCG	2	6	693085	693090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242923
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13619	NC_017432	GATA	2	8	693115	693122	50 %	25 %	25 %	0 %	385242923
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