MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/9301 chromosome

Total Repeats: 20333

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_017432	CTG	2	6	663794	663799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242896
13002	NC_017432	A	7	7	663870	663876	100 %	0 %	0 %	0 %	385242896
13003	NC_017432	AAC	2	6	663920	663925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242896
13004	NC_017432	AAG	2	6	664055	664060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242896
13005	NC_017432	TATT	2	8	664096	664103	25 %	75 %	0 %	0 %	385242896
13006	NC_017432	CT	3	6	664130	664135	0 %	50 %	0 %	50 %	385242896
13007	NC_017432	TC	3	6	664152	664157	0 %	50 %	0 %	50 %	385242896
13008	NC_017432	CAT	2	6	664167	664172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242896
13009	NC_017432	GAT	2	6	664258	664263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242896
13010	NC_017432	C	6	6	664269	664274	0 %	0 %	0 %	100 %	385242896
13011	NC_017432	TAC	2	6	664283	664288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242896
13012	NC_017432	C	6	6	664290	664295	0 %	0 %	0 %	100 %	385242896
13013	NC_017432	AT	3	6	664368	664373	50 %	50 %	0 %	0 %	385242896
13014	NC_017432	CT	3	6	664377	664382	0 %	50 %	0 %	50 %	385242896
13015	NC_017432	GAA	2	6	664414	664419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242896
13016	NC_017432	CTT	2	6	664436	664441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242896
13017	NC_017432	CGA	2	6	664447	664452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242896
13018	NC_017432	TTG	2	6	664476	664481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242896
13019	NC_017432	T	6	6	664506	664511	0 %	100 %	0 %	0 %	385242896
13020	NC_017432	ATG	2	6	664558	664563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242896
13021	NC_017432	TCG	2	6	664569	664574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242896
13022	NC_017432	CCAT	2	8	664584	664591	25 %	25 %	0 %	50 %	385242896
13023	NC_017432	ATC	2	6	664622	664627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242896
13024	NC_017432	A	7	7	664685	664691	100 %	0 %	0 %	0 %	385242896
13025	NC_017432	GAA	2	6	664735	664740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242896
13026	NC_017432	CAA	2	6	664744	664749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242896
13027	NC_017432	AGG	2	6	664824	664829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242896
13028	NC_017432	TGCG	2	8	664917	664924	0 %	25 %	50 %	25 %	385242896
13029	NC_017432	TGAG	2	8	664964	664971	25 %	25 %	50 %	0 %	385242896
13030	NC_017432	CTC	2	6	664974	664979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242896
13031	NC_017432	AAG	2	6	664985	664990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242896
13032	NC_017432	CAA	2	6	664996	665001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242896
13033	NC_017432	GCT	2	6	665005	665010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242896
13034	NC_017432	CT	3	6	665009	665014	0 %	50 %	0 %	50 %	385242896
13035	NC_017432	ACAG	2	8	665022	665029	50 %	0 %	25 %	25 %	385242896
13036	NC_017432	TCC	2	6	665196	665201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242896
13037	NC_017432	AAGC	2	8	665270	665277	50 %	0 %	25 %	25 %	385242896
13038	NC_017432	GA	3	6	665288	665293	50 %	0 %	50 %	0 %	385242896
13039	NC_017432	GAA	2	6	665302	665307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242896
13040	NC_017432	GAA	2	6	665350	665355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242896
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13042	NC_017432	CTT	2	6	665618	665623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242897
13043	NC_017432	CTC	2	6	665646	665651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242897
13044	NC_017432	CTTT	3	12	665672	665683	0 %	75 %	0 %	25 %	385242897
13045	NC_017432	AAC	2	6	665701	665706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242897
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13047	NC_017432	T	6	6	665839	665844	0 %	100 %	0 %	0 %	385242897
13048	NC_017432	GAT	2	6	665863	665868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242897
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13050	NC_017432	TA	3	6	665960	665965	50 %	50 %	0 %	0 %	385242897
13051	NC_017432	AACA	2	8	666164	666171	75 %	0 %	0 %	25 %	385242897
13052	NC_017432	TCT	2	6	666184	666189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242897
13053	NC_017432	TC	4	8	666257	666264	0 %	50 %	0 %	50 %	385242897
13054	NC_017432	CT	4	8	666282	666289	0 %	50 %	0 %	50 %	385242897
13055	NC_017432	CTT	2	6	666300	666305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242897
13056	NC_017432	ATT	2	6	666328	666333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242897
13057	NC_017432	GATGG	2	10	666514	666523	20 %	20 %	60 %	0 %	385242897
13058	NC_017432	CT	3	6	666527	666532	0 %	50 %	0 %	50 %	385242897
13059	NC_017432	TACTT	2	10	666673	666682	20 %	60 %	0 %	20 %	385242897
13060	NC_017432	CTG	2	6	666686	666691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242897
13061	NC_017432	AT	3	6	666718	666723	50 %	50 %	0 %	0 %	385242897
13062	NC_017432	TTA	2	6	666734	666739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242897
13063	NC_017432	TC	3	6	666757	666762	0 %	50 %	0 %	50 %	385242897
13064	NC_017432	AGG	2	6	666808	666813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242897
13065	NC_017432	ATT	2	6	666828	666833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242897
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13070	NC_017432	TGA	2	6	667036	667041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242897
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13087	NC_017432	TCT	2	6	667808	667813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242898
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13093	NC_017432	GAAA	2	8	667989	667996	75 %	0 %	25 %	0 %	385242898
13094	NC_017432	GA	3	6	668033	668038	50 %	0 %	50 %	0 %	385242898
13095	NC_017432	TCA	2	6	668039	668044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242898
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13099	NC_017432	A	6	6	668147	668152	100 %	0 %	0 %	0 %	385242898
13100	NC_017432	CA	3	6	668171	668176	50 %	0 %	0 %	50 %	385242898
13101	NC_017432	TC	3	6	668177	668182	0 %	50 %	0 %	50 %	385242898
13102	NC_017432	GCT	3	9	668267	668275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242898
13103	NC_017432	A	6	6	668344	668349	100 %	0 %	0 %	0 %	385242898
13104	NC_017432	TGC	2	6	668350	668355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242898
13105	NC_017432	AAT	2	6	668415	668420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242898
13106	NC_017432	CTA	2	6	668424	668429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242898
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13108	NC_017432	CCT	2	6	668550	668555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242898
13109	NC_017432	A	6	6	668665	668670	100 %	0 %	0 %	0 %	385242898
13110	NC_017432	TTC	2	6	668692	668697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242898
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13112	NC_017432	ATA	2	6	668748	668753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242898
13113	NC_017432	CT	3	6	668794	668799	0 %	50 %	0 %	50 %	385242898
13114	NC_017432	T	7	7	668883	668889	0 %	100 %	0 %	0 %	385242898
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13240	NC_017432	AGC	2	6	675098	675103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242904
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13242	NC_017432	AGCT	2	8	675209	675216	25 %	25 %	25 %	25 %	385242904
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13367	NC_017432	CCT	2	6	680912	680917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242910
13368	NC_017432	TCA	2	6	680931	680936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242910
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13371	NC_017432	CAA	2	6	681139	681144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242910
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13474	NC_017432	AG	3	6	686383	686388	50 %	0 %	50 %	0 %	385242915
13475	NC_017432	CT	3	6	686400	686405	0 %	50 %	0 %	50 %	385242916
13476	NC_017432	TCTGC	2	10	686440	686449	0 %	40 %	20 %	40 %	385242916
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13480	NC_017432	GCAA	2	8	686710	686717	50 %	0 %	25 %	25 %	385242917
13481	NC_017432	GCA	2	6	686768	686773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242917
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13483	NC_017432	GA	3	6	686865	686870	50 %	0 %	50 %	0 %	385242917
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13485	NC_017432	TGCC	2	8	687013	687020	0 %	25 %	25 %	50 %	385242917
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13487	NC_017432	A	6	6	687182	687187	100 %	0 %	0 %	0 %	385242917
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13490	NC_017432	GCA	2	6	687384	687389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242918
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