MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/9301 chromosome

Total Repeats: 20333

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_017432	TAA	2	6	563301	563306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242790
11003	NC_017432	TCT	2	6	563378	563383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242790
11004	NC_017432	ATC	2	6	563385	563390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242790
11005	NC_017432	CCTT	2	8	563443	563450	0 %	50 %	0 %	50 %	385242790
11006	NC_017432	TTG	2	6	563514	563519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242790
11007	NC_017432	CGA	2	6	563543	563548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242790
11008	NC_017432	TC	3	6	563561	563566	0 %	50 %	0 %	50 %	385242790
11009	NC_017432	GAAA	2	8	563761	563768	75 %	0 %	25 %	0 %	385242791
11010	NC_017432	C	6	6	563772	563777	0 %	0 %	0 %	100 %	385242791
11011	NC_017432	TGT	2	6	563875	563880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242791
11012	NC_017432	GAA	2	6	563903	563908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242791
11013	NC_017432	AGG	2	6	563928	563933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242791
11014	NC_017432	TA	3	6	563937	563942	50 %	50 %	0 %	0 %	385242791
11015	NC_017432	GAAC	2	8	563989	563996	50 %	0 %	25 %	25 %	385242791
11016	NC_017432	CTA	2	6	564109	564114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242791
11017	NC_017432	AGATCC	2	12	564132	564143	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385242791
11018	NC_017432	CAAA	2	8	564146	564153	75 %	0 %	0 %	25 %	385242791
11019	NC_017432	CCT	2	6	564203	564208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242791
11020	NC_017432	CAC	2	6	564210	564215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385242791
11021	NC_017432	AGAA	2	8	564279	564286	75 %	0 %	25 %	0 %	385242791
11022	NC_017432	CAAA	2	8	564403	564410	75 %	0 %	0 %	25 %	385242792
11023	NC_017432	GA	3	6	564415	564420	50 %	0 %	50 %	0 %	385242792
11024	NC_017432	CCAT	2	8	564426	564433	25 %	25 %	0 %	50 %	385242792
11025	NC_017432	GGA	2	6	564480	564485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242792
11026	NC_017432	TCT	2	6	564507	564512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242792
11027	NC_017432	GCTC	2	8	564537	564544	0 %	25 %	25 %	50 %	385242792
11028	NC_017432	ATC	2	6	564575	564580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242792
11029	NC_017432	CT	3	6	564595	564600	0 %	50 %	0 %	50 %	385242792
11030	NC_017432	CAT	2	6	564607	564612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242792
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11032	NC_017432	CAA	2	6	564664	564669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242792
11033	NC_017432	TGA	2	6	564675	564680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242792
11034	NC_017432	AGA	2	6	564749	564754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242792
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11036	NC_017432	A	6	6	564816	564821	100 %	0 %	0 %	0 %	385242792
11037	NC_017432	CTT	2	6	564838	564843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242792
11038	NC_017432	ATC	2	6	564887	564892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242792
11039	NC_017432	TC	3	6	564906	564911	0 %	50 %	0 %	50 %	385242792
11040	NC_017432	T	6	6	564925	564930	0 %	100 %	0 %	0 %	385242792
11041	NC_017432	CCCA	2	8	564939	564946	25 %	0 %	0 %	75 %	385242792
11042	NC_017432	CT	3	6	565109	565114	0 %	50 %	0 %	50 %	385242793
11043	NC_017432	GAT	2	6	565155	565160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242793
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11047	NC_017432	CAT	2	6	565338	565343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242793
11048	NC_017432	CA	3	6	565436	565441	50 %	0 %	0 %	50 %	385242793
11049	NC_017432	AAT	2	6	565470	565475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242793
11050	NC_017432	GAT	2	6	565487	565492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242793
11051	NC_017432	C	6	6	565512	565517	0 %	0 %	0 %	100 %	385242793
11052	NC_017432	TCA	2	6	565519	565524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242793
11053	NC_017432	TAA	2	6	565585	565590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242793
11054	NC_017432	CGT	2	6	565622	565627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242793
11055	NC_017432	ATC	2	6	565686	565691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242793
11056	NC_017432	TCT	2	6	565699	565704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242793
11057	NC_017432	T	6	6	565791	565796	0 %	100 %	0 %	0 %	385242793
11058	NC_017432	ATCA	2	8	565860	565867	50 %	25 %	0 %	25 %	385242793
11059	NC_017432	CTA	2	6	565973	565978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242793
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11062	NC_017432	AGGTA	2	10	566198	566207	40 %	20 %	40 %	0 %	385242793
11063	NC_017432	CAA	2	6	566314	566319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242793
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11065	NC_017432	CTT	2	6	566414	566419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242793
11066	NC_017432	CGTC	2	8	566421	566428	0 %	25 %	25 %	50 %	385242793
11067	NC_017432	TTG	2	6	566647	566652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242794
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11070	NC_017432	CTA	2	6	566796	566801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242794
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11084	NC_017432	ACG	2	6	567876	567881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242795
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11087	NC_017432	TCA	2	6	568000	568005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242795
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11089	NC_017432	TCT	2	6	568171	568176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242795
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11091	NC_017432	CT	3	6	568273	568278	0 %	50 %	0 %	50 %	385242795
11092	NC_017432	CGA	2	6	568326	568331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242796
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11097	NC_017432	T	7	7	568444	568450	0 %	100 %	0 %	0 %	385242796
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11100	NC_017432	AC	3	6	568610	568615	50 %	0 %	0 %	50 %	385242796
11101	NC_017432	TCT	2	6	568632	568637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242796
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11103	NC_017432	T	6	6	568901	568906	0 %	100 %	0 %	0 %	385242797
11104	NC_017432	ACAG	2	8	568934	568941	50 %	0 %	25 %	25 %	385242797
11105	NC_017432	TTC	2	6	568993	568998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242797
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11107	NC_017432	TAA	3	9	569035	569043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242797
11108	NC_017432	TTAA	2	8	569099	569106	50 %	50 %	0 %	0 %	385242797
11109	NC_017432	GCA	2	6	569111	569116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242797
11110	NC_017432	CT	3	6	569200	569205	0 %	50 %	0 %	50 %	385242797
11111	NC_017432	TAA	2	6	569259	569264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242797
11112	NC_017432	CTG	2	6	569268	569273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242797
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11115	NC_017432	CT	3	6	569490	569495	0 %	50 %	0 %	50 %	385242797
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11117	NC_017432	A	6	6	569561	569566	100 %	0 %	0 %	0 %	385242797
11118	NC_017432	T	6	6	569578	569583	0 %	100 %	0 %	0 %	385242797
11119	NC_017432	ACA	2	6	569757	569762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242797
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11489	NC_017432	ATG	2	6	586739	586744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242815
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