MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/9301 chromosome

Total Repeats: 20333

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_017432	TC	3	6	512115	512120	0 %	50 %	0 %	50 %	385242740
10002	NC_017432	CTA	2	6	512192	512197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242740
10003	NC_017432	AGT	2	6	512260	512265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242740
10004	NC_017432	CAC	2	6	512271	512276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385242740
10005	NC_017432	AGA	2	6	512305	512310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242740
10006	NC_017432	AAC	2	6	512385	512390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242740
10007	NC_017432	TG	3	6	512591	512596	0 %	50 %	50 %	0 %	385242741
10008	NC_017432	GAA	2	6	512635	512640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242741
10009	NC_017432	CGAAT	2	10	512730	512739	40 %	20 %	20 %	20 %	385242741
10010	NC_017432	ACT	2	6	512740	512745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242741
10011	NC_017432	TCT	2	6	512836	512841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242741
10012	NC_017432	CTA	2	6	512912	512917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242741
10013	NC_017432	AGC	2	6	512931	512936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242741
10014	NC_017432	AAG	2	6	512969	512974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242741
10015	NC_017432	AGC	2	6	512993	512998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242741
10016	NC_017432	CAA	2	6	513005	513010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242741
10017	NC_017432	ATT	2	6	513012	513017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242741
10018	NC_017432	ACT	2	6	513100	513105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242741
10019	NC_017432	TTA	2	6	513106	513111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242741
10020	NC_017432	ACG	2	6	513172	513177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242741
10021	NC_017432	TACT	2	8	513266	513273	25 %	50 %	0 %	25 %	385242741
10022	NC_017432	GTT	2	6	513298	513303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242741
10023	NC_017432	TCC	2	6	513324	513329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242741
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10025	NC_017432	CAA	3	9	513488	513496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242741
10026	NC_017432	GCTGTT	2	12	513505	513516	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385242741
10027	NC_017432	ACT	2	6	513544	513549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242741
10028	NC_017432	CTT	2	6	513578	513583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242741
10029	NC_017432	AGC	2	6	513662	513667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242741
10030	NC_017432	CTT	2	6	513671	513676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242741
10031	NC_017432	CAG	2	6	513755	513760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242741
10032	NC_017432	ATAGG	2	10	513865	513874	40 %	20 %	40 %	0 %	385242741
10033	NC_017432	TG	3	6	513907	513912	0 %	50 %	50 %	0 %	385242741
10034	NC_017432	ATC	2	6	513927	513932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242741
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10036	NC_017432	T	6	6	514059	514064	0 %	100 %	0 %	0 %	385242741
10037	NC_017432	AGCTA	2	10	514101	514110	40 %	20 %	20 %	20 %	385242741
10038	NC_017432	AG	4	8	514122	514129	50 %	0 %	50 %	0 %	385242741
10039	NC_017432	TGA	2	6	514211	514216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242741
10040	NC_017432	ACC	2	6	514511	514516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385242742
10041	NC_017432	TCTT	2	8	514524	514531	0 %	75 %	0 %	25 %	385242742
10042	NC_017432	ACA	2	6	514598	514603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242742
10043	NC_017432	ACT	2	6	514604	514609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242742
10044	NC_017432	ACA	2	6	514617	514622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242742
10045	NC_017432	AGC	2	6	514631	514636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242742
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10048	NC_017432	CTG	2	6	515025	515030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242743
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10050	NC_017432	TC	3	6	515130	515135	0 %	50 %	0 %	50 %	385242743
10051	NC_017432	CTT	2	6	515161	515166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242743
10052	NC_017432	CAC	2	6	515175	515180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385242743
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10054	NC_017432	TGC	3	9	515273	515281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242744
10055	NC_017432	CTC	2	6	515295	515300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242744
10056	NC_017432	CTT	2	6	515428	515433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242744
10057	NC_017432	ATG	2	6	515434	515439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242744
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10060	NC_017432	ACA	2	6	515532	515537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242744
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10064	NC_017432	GAA	2	6	515670	515675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242744
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10066	NC_017432	CTT	2	6	515913	515918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242744
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10068	NC_017432	A	6	6	515943	515948	100 %	0 %	0 %	0 %	385242744
10069	NC_017432	TTCT	2	8	515960	515967	0 %	75 %	0 %	25 %	385242744
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10072	NC_017432	AGA	2	6	516050	516055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242744
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10083	NC_017432	CTTC	2	8	517102	517109	0 %	50 %	0 %	50 %	385242745
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10088	NC_017432	TCT	2	6	517494	517499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242745
10089	NC_017432	TGC	2	6	517500	517505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242745
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10091	NC_017432	TTG	2	6	517541	517546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242745
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10094	NC_017432	TC	3	6	518131	518136	0 %	50 %	0 %	50 %	385242746
10095	NC_017432	TAA	2	6	518173	518178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242746
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10099	NC_017432	ATCC	2	8	518293	518300	25 %	25 %	0 %	50 %	385242746
10100	NC_017432	CAT	2	6	518328	518333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242746
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10102	NC_017432	T	6	6	518368	518373	0 %	100 %	0 %	0 %	385242746
10103	NC_017432	TCT	2	6	518393	518398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242746
10104	NC_017432	A	6	6	518443	518448	100 %	0 %	0 %	0 %	385242746
10105	NC_017432	GAA	2	6	518463	518468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242746
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10109	NC_017432	CAG	2	6	518718	518723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242746
10110	NC_017432	TAATTC	2	12	518829	518840	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385242746
10111	NC_017432	CGA	2	6	518851	518856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242746
10112	NC_017432	T	6	6	518894	518899	0 %	100 %	0 %	0 %	385242746
10113	NC_017432	TC	3	6	518958	518963	0 %	50 %	0 %	50 %	385242746
10114	NC_017432	A	6	6	519011	519016	100 %	0 %	0 %	0 %	385242746
10115	NC_017432	AAG	2	6	519042	519047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242746
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10119	NC_017432	CTG	2	6	519252	519257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242746
10120	NC_017432	GCA	2	6	519300	519305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242746
10121	NC_017432	AAG	2	6	519318	519323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242746
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10123	NC_017432	TGT	2	6	519335	519340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242746
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10227	NC_017432	A	7	7	525768	525774	100 %	0 %	0 %	0 %	385242750
10228	NC_017432	CAA	2	6	525984	525989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242750
10229	NC_017432	TAAA	2	8	526007	526014	75 %	25 %	0 %	0 %	385242750
10230	NC_017432	GTC	2	6	526073	526078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242751
10231	NC_017432	TTC	2	6	526086	526091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242752
10232	NC_017432	TTC	2	6	526107	526112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242752
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10235	NC_017432	TTTC	2	8	526224	526231	0 %	75 %	0 %	25 %	385242752
10236	NC_017432	TTCT	2	8	526334	526341	0 %	75 %	0 %	25 %	385242752
10237	NC_017432	CTT	2	6	526342	526347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242752
10238	NC_017432	GTT	2	6	526417	526422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242752
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10474	NC_017432	TCTCT	2	10	537616	537625	0 %	60 %	0 %	40 %	385242762
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10476	NC_017432	TTGC	2	8	537736	537743	0 %	50 %	25 %	25 %	385242762
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