MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/9301 chromosome

Total Repeats: 20333

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_017432	AATC	2	8	413279	413286	50 %	25 %	0 %	25 %	385242653
8002	NC_017432	AAAC	2	8	413357	413364	75 %	0 %	0 %	25 %	385242653
8003	NC_017432	TAC	2	6	413414	413419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242653
8004	NC_017432	AAATA	2	10	413421	413430	80 %	20 %	0 %	0 %	385242653
8005	NC_017432	CGAA	2	8	413454	413461	50 %	0 %	25 %	25 %	385242653
8006	NC_017432	CT	3	6	413467	413472	0 %	50 %	0 %	50 %	385242653
8007	NC_017432	AGC	2	6	413475	413480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242653
8008	NC_017432	CAA	2	6	413568	413573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242654
8009	NC_017432	TTA	2	6	413599	413604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242654
8010	NC_017432	AATTA	2	10	413607	413616	60 %	40 %	0 %	0 %	385242654
8011	NC_017432	AGCT	2	8	413694	413701	25 %	25 %	25 %	25 %	385242654
8012	NC_017432	CTT	2	6	414005	414010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242654
8013	NC_017432	CT	3	6	414213	414218	0 %	50 %	0 %	50 %	385242654
8014	NC_017432	AG	3	6	414241	414246	50 %	0 %	50 %	0 %	385242654
8015	NC_017432	C	6	6	414261	414266	0 %	0 %	0 %	100 %	385242654
8016	NC_017432	TCT	2	6	414334	414339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242654
8017	NC_017432	CCGC	2	8	414389	414396	0 %	0 %	25 %	75 %	385242654
8018	NC_017432	CAG	2	6	414463	414468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242654
8019	NC_017432	A	6	6	414533	414538	100 %	0 %	0 %	0 %	385242654
8020	NC_017432	CT	3	6	414656	414661	0 %	50 %	0 %	50 %	385242654
8021	NC_017432	AAC	3	9	414720	414728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242654
8022	NC_017432	TCTT	2	8	414738	414745	0 %	75 %	0 %	25 %	385242654
8023	NC_017432	TCG	2	6	414765	414770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242654
8024	NC_017432	AC	3	6	414810	414815	50 %	0 %	0 %	50 %	385242654
8025	NC_017432	CT	3	6	414851	414856	0 %	50 %	0 %	50 %	385242655
8026	NC_017432	TGA	2	6	414857	414862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242655
8027	NC_017432	TCC	2	6	414868	414873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242655
8028	NC_017432	CTC	2	6	414918	414923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242655
8029	NC_017432	CCG	2	6	414971	414976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385242655
8030	NC_017432	ATC	2	6	415006	415011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242655
8031	NC_017432	AAG	2	6	415089	415094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242655
8032	NC_017432	TCT	2	6	415100	415105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242655
8033	NC_017432	TC	3	6	415233	415238	0 %	50 %	0 %	50 %	385242655
8034	NC_017432	TCT	2	6	415245	415250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242655
8035	NC_017432	ACATGC	2	12	415346	415357	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385242655
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8037	NC_017432	ACA	2	6	415408	415413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242655
8038	NC_017432	TAA	2	6	415425	415430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242655
8039	NC_017432	A	6	6	415439	415444	100 %	0 %	0 %	0 %	385242655
8040	NC_017432	TTC	2	6	415450	415455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242655
8041	NC_017432	AGT	2	6	415564	415569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242655
8042	NC_017432	CTG	2	6	415572	415577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242655
8043	NC_017432	GAAG	2	8	415592	415599	50 %	0 %	50 %	0 %	385242655
8044	NC_017432	ACA	2	6	415607	415612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242655
8045	NC_017432	AACGC	2	10	415710	415719	40 %	0 %	20 %	40 %	385242655
8046	NC_017432	AGA	2	6	415729	415734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242655
8047	NC_017432	CAA	2	6	415797	415802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242655
8048	NC_017432	AAAC	2	8	415870	415877	75 %	0 %	0 %	25 %	385242656
8049	NC_017432	TCT	2	6	415932	415937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242656
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8051	NC_017432	A	6	6	415962	415967	100 %	0 %	0 %	0 %	385242656
8052	NC_017432	GGCTCT	2	12	416081	416092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242656
8053	NC_017432	CT	3	6	416102	416107	0 %	50 %	0 %	50 %	385242656
8054	NC_017432	CAT	2	6	416199	416204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242656
8055	NC_017432	AAG	2	6	416205	416210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242656
8056	NC_017432	GCA	2	6	416225	416230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242656
8057	NC_017432	GCT	2	6	416234	416239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242656
8058	NC_017432	ACA	3	9	416282	416290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242656
8059	NC_017432	AAT	2	6	416359	416364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242656
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8062	NC_017432	AAC	2	6	416452	416457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242656
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8065	NC_017432	GAC	2	6	416514	416519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242656
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8075	NC_017432	AACT	2	8	417183	417190	50 %	25 %	0 %	25 %	385242657
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8080	NC_017432	CTTCT	2	10	417290	417299	0 %	60 %	0 %	40 %	385242657
8081	NC_017432	TGA	2	6	417334	417339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242657
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8091	NC_017432	CT	3	6	417582	417587	0 %	50 %	0 %	50 %	385242657
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8107	NC_017432	ACT	2	6	418488	418493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242657
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8110	NC_017432	CG	3	6	418771	418776	0 %	0 %	50 %	50 %	385242658
8111	NC_017432	CCT	2	6	418787	418792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242658
8112	NC_017432	TCTCT	2	10	418824	418833	0 %	60 %	0 %	40 %	385242658
8113	NC_017432	AGA	2	6	418885	418890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242658
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8115	NC_017432	CA	3	6	419038	419043	50 %	0 %	0 %	50 %	385242658
8116	NC_017432	ACG	2	6	419049	419054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242658
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8118	NC_017432	TCT	3	9	419116	419124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242658
8119	NC_017432	CCAT	2	8	419135	419142	25 %	25 %	0 %	50 %	385242658
8120	NC_017432	CTTT	2	8	419236	419243	0 %	75 %	0 %	25 %	385242658
8121	NC_017432	TCTT	2	8	419314	419321	0 %	75 %	0 %	25 %	385242658
8122	NC_017432	GGA	2	6	419350	419355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242658
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8124	NC_017432	T	6	6	419409	419414	0 %	100 %	0 %	0 %	385242658
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8493	NC_017432	GCA	2	6	436299	436304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242674
8494	NC_017432	CTG	2	6	436435	436440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242674
8495	NC_017432	AAT	2	6	436482	436487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242674
8496	NC_017432	GTTC	2	8	436556	436563	0 %	50 %	25 %	25 %	385242674
8497	NC_017432	AAT	2	6	436667	436672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242674
8498	NC_017432	T	7	7	436763	436769	0 %	100 %	0 %	0 %	385242674
8499	NC_017432	CGT	2	6	436962	436967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242675
8500	NC_017432	TCA	2	6	436990	436995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242675

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