MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/9301 chromosome

Total Repeats: 20333

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_017432	TCT	2	6	361848	361853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242607
7002	NC_017432	TTC	2	6	361943	361948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242607
7003	NC_017432	GAT	2	6	361975	361980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242607
7004	NC_017432	CTG	2	6	361981	361986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242607
7005	NC_017432	CTT	2	6	362010	362015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242607
7006	NC_017432	TCT	2	6	362021	362026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242607
7007	NC_017432	T	6	6	362033	362038	0 %	100 %	0 %	0 %	385242607
7008	NC_017432	CTTT	2	8	362040	362047	0 %	75 %	0 %	25 %	385242607
7009	NC_017432	GAC	2	6	362068	362073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242607
7010	NC_017432	CA	3	6	362155	362160	50 %	0 %	0 %	50 %	385242608
7011	NC_017432	TCA	2	6	362190	362195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242608
7012	NC_017432	TCT	2	6	362244	362249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242608
7013	NC_017432	TTC	2	6	362254	362259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242608
7014	NC_017432	GCT	2	6	362279	362284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242608
7015	NC_017432	T	7	7	362287	362293	0 %	100 %	0 %	0 %	385242608
7016	NC_017432	TTC	2	6	362319	362324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242608
7017	NC_017432	ACC	2	6	362525	362530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385242609
7018	NC_017432	CTT	2	6	362554	362559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242609
7019	NC_017432	TGT	2	6	362660	362665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242609
7020	NC_017432	GAA	3	9	362669	362677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242609
7021	NC_017432	GAA	2	6	362696	362701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242609
7022	NC_017432	GTC	2	6	362710	362715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242609
7023	NC_017432	CTT	3	9	362719	362727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242609
7024	NC_017432	GCAA	2	8	362782	362789	50 %	0 %	25 %	25 %	385242609
7025	NC_017432	GAG	2	6	362831	362836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242609
7026	NC_017432	TC	3	6	362848	362853	0 %	50 %	0 %	50 %	385242609
7027	NC_017432	GACC	2	8	362926	362933	25 %	0 %	25 %	50 %	385242609
7028	NC_017432	TAC	2	6	362984	362989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242609
7029	NC_017432	ATC	2	6	363074	363079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242609
7030	NC_017432	TATG	2	8	363110	363117	25 %	50 %	25 %	0 %	385242609
7031	NC_017432	TGA	2	6	363154	363159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242609
7032	NC_017432	AAG	2	6	363188	363193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242609
7033	NC_017432	CAAC	2	8	363196	363203	50 %	0 %	0 %	50 %	385242609
7034	NC_017432	TCT	2	6	363234	363239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242609
7035	NC_017432	AAC	2	6	363269	363274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242609
7036	NC_017432	ACT	2	6	363351	363356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242609
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7038	NC_017432	ACGC	2	8	363562	363569	25 %	0 %	25 %	50 %	385242609
7039	NC_017432	AGC	2	6	363575	363580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242609
7040	NC_017432	TTA	2	6	363639	363644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242609
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7042	NC_017432	ATGC	2	8	364171	364178	25 %	25 %	25 %	25 %	385242610
7043	NC_017432	CAA	2	6	364183	364188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242610
7044	NC_017432	TCT	2	6	364220	364225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242610
7045	NC_017432	T	7	7	364225	364231	0 %	100 %	0 %	0 %	385242610
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7047	NC_017432	GC	3	6	364688	364693	0 %	0 %	50 %	50 %	385242611
7048	NC_017432	TTC	2	6	364704	364709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242611
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7050	NC_017432	TAT	2	6	364983	364988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242611
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7052	NC_017432	TTAT	2	8	365132	365139	25 %	75 %	0 %	0 %	385242611
7053	NC_017432	CTC	2	6	365144	365149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242611
7054	NC_017432	TAT	2	6	365163	365168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242611
7055	NC_017432	T	6	6	365175	365180	0 %	100 %	0 %	0 %	385242611
7056	NC_017432	AT	3	6	365238	365243	50 %	50 %	0 %	0 %	385242611
7057	NC_017432	CAT	2	6	365292	365297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242611
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7059	NC_017432	GAA	2	6	365428	365433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242611
7060	NC_017432	AGT	2	6	365466	365471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242611
7061	NC_017432	GCTCA	2	10	365497	365506	20 %	20 %	20 %	40 %	385242611
7062	NC_017432	CTCTT	2	10	365617	365626	0 %	60 %	0 %	40 %	385242612
7063	NC_017432	ACAA	2	8	365656	365663	75 %	0 %	0 %	25 %	385242612
7064	NC_017432	T	8	8	365784	365791	0 %	100 %	0 %	0 %	385242612
7065	NC_017432	T	6	6	365892	365897	0 %	100 %	0 %	0 %	385242612
7066	NC_017432	GGA	2	6	365937	365942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242612
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7070	NC_017432	TGT	2	6	366165	366170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242613
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7081	NC_017432	CAA	2	6	366563	366568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242613
7082	NC_017432	AGGC	2	8	366581	366588	25 %	0 %	50 %	25 %	385242613
7083	NC_017432	TCCA	2	8	366637	366644	25 %	25 %	0 %	50 %	385242613
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7092	NC_017432	AGGGA	2	10	366993	367002	40 %	0 %	60 %	0 %	385242613
7093	NC_017432	GCT	2	6	367006	367011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242613
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7099	NC_017432	TGAG	2	8	367236	367243	25 %	25 %	50 %	0 %	385242613
7100	NC_017432	AC	3	6	367264	367269	50 %	0 %	0 %	50 %	385242613
7101	NC_017432	A	6	6	367365	367370	100 %	0 %	0 %	0 %	385242613
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7106	NC_017432	TGA	2	6	367546	367551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242613
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7108	NC_017432	TGA	2	6	367642	367647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242613
7109	NC_017432	CT	3	6	367669	367674	0 %	50 %	0 %	50 %	385242613
7110	NC_017432	CA	3	6	367678	367683	50 %	0 %	0 %	50 %	385242613
7111	NC_017432	CAA	2	6	367724	367729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242613
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7491	NC_017432	CAT	2	6	386953	386958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242629
7492	NC_017432	CTA	2	6	386961	386966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242629
7493	NC_017432	TCA	2	6	387041	387046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242629
7494	NC_017432	TTC	2	6	387091	387096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242629
7495	NC_017432	TTCT	2	8	387134	387141	0 %	75 %	0 %	25 %	385242629
7496	NC_017432	TCA	2	6	387142	387147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242629
7497	NC_017432	CT	3	6	387218	387223	0 %	50 %	0 %	50 %	385242629
7498	NC_017432	T	6	6	387267	387272	0 %	100 %	0 %	0 %	385242629
7499	NC_017432	CTT	3	9	387310	387318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242629
7500	NC_017432	TTA	2	6	387320	387325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242629

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