MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/11023 chromosome

Total Repeats: 20277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_017431	TGT	2	6	184009	184014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241523
3503	NC_017431	TCT	3	9	184078	184086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241523
3504	NC_017431	TTTC	2	8	184151	184158	0 %	75 %	0 %	25 %	385241523
3505	NC_017431	CTG	2	6	184199	184204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241523
3506	NC_017431	GGA	2	6	184226	184231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385241523
3507	NC_017431	TAG	2	6	184251	184256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241523
3508	NC_017431	AGT	2	6	184381	184386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241523
3509	NC_017431	ATCG	2	8	184408	184415	25 %	25 %	25 %	25 %	385241523
3510	NC_017431	TCA	2	6	184491	184496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241524
3511	NC_017431	GGA	2	6	184506	184511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385241524
3512	NC_017431	AGAGA	2	10	184599	184608	60 %	0 %	40 %	0 %	385241524
3513	NC_017431	GCA	2	6	184695	184700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241524
3514	NC_017431	TTA	2	6	184992	184997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241524
3515	NC_017431	GAA	2	6	185061	185066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241524
3516	NC_017431	ATA	2	6	185121	185126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241524
3517	NC_017431	TCTA	2	8	185162	185169	25 %	50 %	0 %	25 %	385241524
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3521	NC_017431	T	7	7	185855	185861	0 %	100 %	0 %	0 %	385241526
3522	NC_017431	TCT	2	6	185879	185884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241526
3523	NC_017431	TG	3	6	185889	185894	0 %	50 %	50 %	0 %	385241526
3524	NC_017431	GTC	2	6	185980	185985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241526
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3529	NC_017431	GAA	2	6	186153	186158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241526
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3532	NC_017431	CTT	2	6	186328	186333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241526
3533	NC_017431	TAG	2	6	186334	186339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241526
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3536	NC_017431	GCTT	2	8	186404	186411	0 %	50 %	25 %	25 %	385241526
3537	NC_017431	CAC	2	6	186436	186441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385241526
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3540	NC_017431	TGT	2	6	186599	186604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241526
3541	NC_017431	ACGAT	2	10	186671	186680	40 %	20 %	20 %	20 %	385241526
3542	NC_017431	TTTA	2	8	186689	186696	25 %	75 %	0 %	0 %	385241526
3543	NC_017431	AAG	2	6	186700	186705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241526
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3548	NC_017431	GCTT	2	8	186896	186903	0 %	50 %	25 %	25 %	385241526
3549	NC_017431	T	7	7	186902	186908	0 %	100 %	0 %	0 %	385241526
3550	NC_017431	A	6	6	186943	186948	100 %	0 %	0 %	0 %	385241526
3551	NC_017431	GCT	2	6	187032	187037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241526
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3553	NC_017431	GCTT	2	8	187337	187344	0 %	50 %	25 %	25 %	385241526
3554	NC_017431	TAG	2	6	187375	187380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241526
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3557	NC_017431	TTA	2	6	187448	187453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241526
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3560	NC_017431	CCT	2	6	188553	188558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385241527
3561	NC_017431	CGTA	2	8	188693	188700	25 %	25 %	25 %	25 %	385241528
3562	NC_017431	G	9	9	188712	188720	0 %	0 %	100 %	0 %	385241528
3563	NC_017431	TCC	2	6	188746	188751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385241528
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3582	NC_017431	GAC	2	6	189448	189453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241528
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3592	NC_017431	CAGAT	2	10	189876	189885	40 %	20 %	20 %	20 %	385241528
3593	NC_017431	GTAT	2	8	189888	189895	25 %	50 %	25 %	0 %	385241528
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3994	NC_017431	CAT	2	6	211424	211429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241552
3995	NC_017431	T	6	6	211452	211457	0 %	100 %	0 %	0 %	385241552
3996	NC_017431	ACA	2	6	211495	211500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241552
3997	NC_017431	CTT	2	6	211503	211508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241552
3998	NC_017431	GCA	2	6	211561	211566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241552
3999	NC_017431	TTCC	2	8	211586	211593	0 %	50 %	0 %	50 %	385241552
4000	NC_017431	TAA	2	6	211601	211606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241552

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