MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/11222 chromosome

Total Repeats: 20254

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_017430	TCAT	2	8	638754	638761	25 %	50 %	0 %	25 %	385241023
12502	NC_017430	AAG	2	6	638768	638773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241023
12503	NC_017430	TCT	2	6	638775	638780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241023
12504	NC_017430	AAG	2	6	638795	638800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241023
12505	NC_017430	TTTC	2	8	638801	638808	0 %	75 %	0 %	25 %	385241023
12506	NC_017430	CAC	2	6	638817	638822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385241023
12507	NC_017430	TCT	2	6	638829	638834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241023
12508	NC_017430	CAT	2	6	638894	638899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241023
12509	NC_017430	CCA	2	6	638988	638993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385241023
12510	NC_017430	ATA	2	6	638994	638999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241023
12511	NC_017430	CAT	2	6	639020	639025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241023
12512	NC_017430	GAA	2	6	639116	639121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241024
12513	NC_017430	AATC	2	8	639135	639142	50 %	25 %	0 %	25 %	385241024
12514	NC_017430	ACC	2	6	639250	639255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385241024
12515	NC_017430	TTC	2	6	639270	639275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241024
12516	NC_017430	TCC	2	6	639345	639350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385241024
12517	NC_017430	AAC	2	6	639354	639359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241024
12518	NC_017430	CTT	2	6	639371	639376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241024
12519	NC_017430	CCT	2	6	639448	639453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385241024
12520	NC_017430	CAG	2	6	639461	639466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241024
12521	NC_017430	TCT	2	6	639527	639532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241024
12522	NC_017430	T	6	6	639567	639572	0 %	100 %	0 %	0 %	385241024
12523	NC_017430	TCC	2	6	639606	639611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385241024
12524	NC_017430	TTTC	2	8	639701	639708	0 %	75 %	0 %	25 %	385241024
12525	NC_017430	AGAA	2	8	639730	639737	75 %	0 %	25 %	0 %	385241024
12526	NC_017430	CAC	2	6	639738	639743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385241024
12527	NC_017430	TGC	2	6	639786	639791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241024
12528	NC_017430	TAA	2	6	639833	639838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241024
12529	NC_017430	CT	3	6	639871	639876	0 %	50 %	0 %	50 %	385241024
12530	NC_017430	AAG	2	6	639974	639979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241024
12531	NC_017430	CAGC	2	8	639989	639996	25 %	0 %	25 %	50 %	385241024
12532	NC_017430	TAA	3	9	640059	640067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241024
12533	NC_017430	TC	4	8	640119	640126	0 %	50 %	0 %	50 %	385241024
12534	NC_017430	AGC	2	6	640161	640166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241024
12535	NC_017430	AAG	2	6	640167	640172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241024
12536	NC_017430	CT	3	6	640173	640178	0 %	50 %	0 %	50 %	385241024
12537	NC_017430	CGT	2	6	640213	640218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241024
12538	NC_017430	T	6	6	640218	640223	0 %	100 %	0 %	0 %	385241024
12539	NC_017430	CGGAA	2	10	640483	640492	40 %	0 %	40 %	20 %	385241025
12540	NC_017430	TAA	2	6	640553	640558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241025
12541	NC_017430	CA	3	6	640580	640585	50 %	0 %	0 %	50 %	385241025
12542	NC_017430	TTG	2	6	640645	640650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241025
12543	NC_017430	ATA	2	6	640654	640659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241025
12544	NC_017430	CAT	2	6	640708	640713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241025
12545	NC_017430	GGA	2	6	640911	640916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385241025
12546	NC_017430	TCT	2	6	640917	640922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241025
12547	NC_017430	TA	3	6	640969	640974	50 %	50 %	0 %	0 %	385241025
12548	NC_017430	GTC	2	6	640980	640985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241025
12549	NC_017430	AGG	2	6	641050	641055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385241025
12550	NC_017430	AGG	2	6	641066	641071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385241025
12551	NC_017430	ACC	2	6	641127	641132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385241025
12552	NC_017430	ATGA	2	8	641141	641148	50 %	25 %	25 %	0 %	385241025
12553	NC_017430	TCC	2	6	641183	641188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385241025
12554	NC_017430	TAA	2	6	641266	641271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241025
12555	NC_017430	GCTC	2	8	641379	641386	0 %	25 %	25 %	50 %	385241025
12556	NC_017430	AAG	2	6	641453	641458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241025
12557	NC_017430	TA	3	6	641542	641547	50 %	50 %	0 %	0 %	385241025
12558	NC_017430	AAT	2	6	641564	641569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241025
12559	NC_017430	CTT	2	6	641575	641580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241025
12560	NC_017430	T	7	7	641647	641653	0 %	100 %	0 %	0 %	385241025
12561	NC_017430	GCA	2	6	641698	641703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241025
12562	NC_017430	AAT	2	6	641704	641709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241025
12563	NC_017430	A	6	6	641718	641723	100 %	0 %	0 %	0 %	385241025
12564	NC_017430	CAT	2	6	641774	641779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241025
12565	NC_017430	GGA	2	6	641802	641807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385241026
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12567	NC_017430	TTTC	2	8	641833	641840	0 %	75 %	0 %	25 %	385241026
12568	NC_017430	AGC	2	6	641853	641858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241026
12569	NC_017430	CTG	2	6	641859	641864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241026
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12577	NC_017430	AAT	2	6	642108	642113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241026
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12585	NC_017430	T	7	7	642638	642644	0 %	100 %	0 %	0 %	385241026
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12589	NC_017430	CTT	2	6	642761	642766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241026
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12593	NC_017430	AGCG	2	8	643051	643058	25 %	0 %	50 %	25 %	385241026
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12600	NC_017430	AGA	2	6	643371	643376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241026
12601	NC_017430	CTT	2	6	643556	643561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241026
12602	NC_017430	GAT	2	6	643679	643684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241026
12603	NC_017430	C	9	9	643709	643717	0 %	0 %	0 %	100 %	385241026
12604	NC_017430	GTT	2	6	643763	643768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241026
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12606	NC_017430	GA	3	6	643833	643838	50 %	0 %	50 %	0 %	385241026
12607	NC_017430	CTT	2	6	643844	643849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241026
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12610	NC_017430	TCC	2	6	644052	644057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385241027
12611	NC_017430	CAA	2	6	644150	644155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241027
12612	NC_017430	TCT	2	6	644263	644268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241027
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12615	NC_017430	CTG	2	6	644354	644359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241027
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12618	NC_017430	CTG	2	6	644460	644465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241027
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12620	NC_017430	CAT	2	6	644502	644507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241027
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