MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/11222 chromosome

Total Repeats: 20254

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_017430	TCT	2	6	564064	564069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240939
11003	NC_017430	GCTC	2	8	564094	564101	0 %	25 %	25 %	50 %	385240939
11004	NC_017430	ATC	2	6	564132	564137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240939
11005	NC_017430	CT	3	6	564152	564157	0 %	50 %	0 %	50 %	385240939
11006	NC_017430	CAT	2	6	564164	564169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240939
11007	NC_017430	AGA	2	6	564198	564203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240939
11008	NC_017430	CAA	2	6	564221	564226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240939
11009	NC_017430	TGA	2	6	564232	564237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240939
11010	NC_017430	AGA	2	6	564306	564311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240939
11011	NC_017430	AAT	2	6	564323	564328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240939
11012	NC_017430	A	6	6	564373	564378	100 %	0 %	0 %	0 %	385240939
11013	NC_017430	CTT	2	6	564395	564400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240939
11014	NC_017430	ATC	2	6	564444	564449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240939
11015	NC_017430	TC	3	6	564463	564468	0 %	50 %	0 %	50 %	385240939
11016	NC_017430	T	6	6	564482	564487	0 %	100 %	0 %	0 %	385240939
11017	NC_017430	CCCA	2	8	564496	564503	25 %	0 %	0 %	75 %	385240939
11018	NC_017430	CT	3	6	564666	564671	0 %	50 %	0 %	50 %	385240940
11019	NC_017430	GAT	2	6	564712	564717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240940
11020	NC_017430	AAC	2	6	564730	564735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240940
11021	NC_017430	CAG	2	6	564806	564811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240940
11022	NC_017430	TCA	2	6	564815	564820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240940
11023	NC_017430	CAT	2	6	564895	564900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240940
11024	NC_017430	CA	3	6	564993	564998	50 %	0 %	0 %	50 %	385240940
11025	NC_017430	AAT	2	6	565027	565032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240940
11026	NC_017430	GAT	2	6	565044	565049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240940
11027	NC_017430	C	6	6	565069	565074	0 %	0 %	0 %	100 %	385240940
11028	NC_017430	TCA	2	6	565076	565081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240940
11029	NC_017430	TAA	2	6	565142	565147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240940
11030	NC_017430	CGT	2	6	565179	565184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240940
11031	NC_017430	ATC	2	6	565243	565248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240940
11032	NC_017430	TCT	2	6	565256	565261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240940
11033	NC_017430	T	6	6	565348	565353	0 %	100 %	0 %	0 %	385240940
11034	NC_017430	ATCA	2	8	565417	565424	50 %	25 %	0 %	25 %	385240940
11035	NC_017430	CTA	2	6	565530	565535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240940
11036	NC_017430	A	6	6	565580	565585	100 %	0 %	0 %	0 %	385240940
11037	NC_017430	AGA	2	6	565613	565618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240940
11038	NC_017430	AGGTA	2	10	565755	565764	40 %	20 %	40 %	0 %	385240940
11039	NC_017430	CAA	2	6	565871	565876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240940
11040	NC_017430	CTC	2	6	565902	565907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385240940
11041	NC_017430	CTT	2	6	565971	565976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240940
11042	NC_017430	CGTC	2	8	565978	565985	0 %	25 %	25 %	50 %	385240940
11043	NC_017430	TTG	2	6	566204	566209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240941
11044	NC_017430	CCT	2	6	566245	566250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385240941
11045	NC_017430	AAAG	2	8	566305	566312	75 %	0 %	25 %	0 %	385240941
11046	NC_017430	CTA	2	6	566353	566358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240941
11047	NC_017430	ATC	2	6	566410	566415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240941
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11049	NC_017430	ACA	2	6	566592	566597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240942
11050	NC_017430	TTC	2	6	566599	566604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240942
11051	NC_017430	ATCA	2	8	566740	566747	50 %	25 %	0 %	25 %	385240942
11052	NC_017430	TCC	2	6	566773	566778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385240942
11053	NC_017430	GAA	2	6	566803	566808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240942
11054	NC_017430	GTT	2	6	567000	567005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240942
11055	NC_017430	CGA	2	6	567021	567026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240942
11056	NC_017430	TCA	2	6	567074	567079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240942
11057	NC_017430	ATT	2	6	567109	567114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240942
11058	NC_017430	GAG	2	6	567165	567170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385240942
11059	NC_017430	T	6	6	567418	567423	0 %	100 %	0 %	0 %	385240942
11060	NC_017430	ACG	2	6	567433	567438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240942
11061	NC_017430	TCT	2	6	567464	567469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240942
11062	NC_017430	GGAA	2	8	567472	567479	50 %	0 %	50 %	0 %	385240942
11063	NC_017430	TCA	2	6	567557	567562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240942
11064	NC_017430	TTTC	2	8	567720	567727	0 %	75 %	0 %	25 %	385240942
11065	NC_017430	TCT	2	6	567728	567733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240942
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11068	NC_017430	CGA	2	6	567883	567888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240943
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11071	NC_017430	T	6	6	567938	567943	0 %	100 %	0 %	0 %	385240943
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11073	NC_017430	T	7	7	568001	568007	0 %	100 %	0 %	0 %	385240943
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11077	NC_017430	TCT	2	6	568189	568194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240943
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11080	NC_017430	ACAG	2	8	568491	568498	50 %	0 %	25 %	25 %	385240944
11081	NC_017430	TTC	2	6	568550	568555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240944
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11085	NC_017430	GCA	2	6	568668	568673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240944
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11087	NC_017430	TAA	2	6	568816	568821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240944
11088	NC_017430	CTG	2	6	568825	568830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240944
11089	NC_017430	CTG	2	6	568916	568921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240944
11090	NC_017430	GCT	3	9	568963	568971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240944
11091	NC_017430	CT	3	6	569047	569052	0 %	50 %	0 %	50 %	385240944
11092	NC_017430	AAT	2	6	569104	569109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240944
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11094	NC_017430	T	6	6	569135	569140	0 %	100 %	0 %	0 %	385240944
11095	NC_017430	ACA	2	6	569314	569319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240944
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11100	NC_017430	AAAT	2	8	569672	569679	75 %	25 %	0 %	0 %	385240944
11101	NC_017430	AAGC	2	8	569704	569711	50 %	0 %	25 %	25 %	385240944
11102	NC_017430	C	6	6	569767	569772	0 %	0 %	0 %	100 %	385240944
11103	NC_017430	A	7	7	569782	569788	100 %	0 %	0 %	0 %	385240944
11104	NC_017430	CTT	2	6	569794	569799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240944
11105	NC_017430	GAAA	2	8	569831	569838	75 %	0 %	25 %	0 %	385240944
11106	NC_017430	CACT	2	8	569851	569858	25 %	25 %	0 %	50 %	385240944
11107	NC_017430	CTG	2	6	569881	569886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240944
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11109	NC_017430	A	6	6	569972	569977	100 %	0 %	0 %	0 %	385240944
11110	NC_017430	AAGCA	2	10	569984	569993	60 %	0 %	20 %	20 %	385240944
11111	NC_017430	TA	3	6	570017	570022	50 %	50 %	0 %	0 %	385240944
11112	NC_017430	TTGG	2	8	570029	570036	0 %	50 %	50 %	0 %	385240944
11113	NC_017430	AAG	2	6	570067	570072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240944
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11115	NC_017430	TGC	2	6	570225	570230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240944
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11117	NC_017430	GTC	2	6	570291	570296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240944
11118	NC_017430	TCT	2	6	570363	570368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240944
11119	NC_017430	AACT	2	8	570410	570417	50 %	25 %	0 %	25 %	385240944
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