MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/11222 chromosome

Total Repeats: 20254

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_017430	AGCTA	2	10	513670	513679	40 %	20 %	20 %	20 %	385240887
10002	NC_017430	AG	4	8	513691	513698	50 %	0 %	50 %	0 %	385240887
10003	NC_017430	TGA	2	6	513780	513785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240887
10004	NC_017430	ACC	2	6	514080	514085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385240888
10005	NC_017430	TCTT	2	8	514093	514100	0 %	75 %	0 %	25 %	385240888
10006	NC_017430	ACA	2	6	514167	514172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240888
10007	NC_017430	ACT	2	6	514173	514178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240888
10008	NC_017430	ACA	2	6	514186	514191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240888
10009	NC_017430	AGC	2	6	514200	514205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240888
10010	NC_017430	T	7	7	514217	514223	0 %	100 %	0 %	0 %	385240888
10011	NC_017430	A	6	6	514558	514563	100 %	0 %	0 %	0 %	385240889
10012	NC_017430	CTG	2	6	514594	514599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240889
10013	NC_017430	CCT	2	6	514601	514606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385240889
10014	NC_017430	TC	3	6	514699	514704	0 %	50 %	0 %	50 %	385240889
10015	NC_017430	CTT	2	6	514730	514735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240889
10016	NC_017430	CAC	2	6	514744	514749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385240889
10017	NC_017430	GAA	2	6	514767	514772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240889
10018	NC_017430	TGC	3	9	514842	514850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240890
10019	NC_017430	CTC	2	6	514864	514869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385240890
10020	NC_017430	CTT	2	6	514997	515002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240890
10021	NC_017430	ATG	2	6	515003	515008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240890
10022	NC_017430	AGA	2	6	515047	515052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240890
10023	NC_017430	CTT	2	6	515072	515077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240890
10024	NC_017430	ACA	2	6	515101	515106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240890
10025	NC_017430	CTC	2	6	515147	515152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385240890
10026	NC_017430	AAG	2	6	515181	515186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240890
10027	NC_017430	AG	3	6	515233	515238	50 %	0 %	50 %	0 %	385240890
10028	NC_017430	GAA	2	6	515239	515244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240890
10029	NC_017430	CT	3	6	515298	515303	0 %	50 %	0 %	50 %	385240890
10030	NC_017430	CTT	2	6	515482	515487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240890
10031	NC_017430	T	6	6	515486	515491	0 %	100 %	0 %	0 %	385240890
10032	NC_017430	A	6	6	515512	515517	100 %	0 %	0 %	0 %	385240890
10033	NC_017430	TTCT	2	8	515529	515536	0 %	75 %	0 %	25 %	385240890
10034	NC_017430	AGA	2	6	515565	515570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240890
10035	NC_017430	CCCA	2	8	515599	515606	25 %	0 %	0 %	75 %	385240890
10036	NC_017430	AGA	2	6	515619	515624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240890
10037	NC_017430	ATC	2	6	515690	515695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240890
10038	NC_017430	CTCTT	2	10	515858	515867	0 %	60 %	0 %	40 %	385240890
10039	NC_017430	TCC	2	6	515912	515917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385240890
10040	NC_017430	CCGC	2	8	515941	515948	0 %	0 %	25 %	75 %	385240890
10041	NC_017430	GAG	2	6	515965	515970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385240890
10042	NC_017430	T	6	6	516020	516025	0 %	100 %	0 %	0 %	385240890
10043	NC_017430	CTC	2	6	516067	516072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385240890
10044	NC_017430	CAC	2	6	516105	516110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385240890
10045	NC_017430	CTCTAT	2	12	516568	516579	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385240891
10046	NC_017430	CT	3	6	516633	516638	0 %	50 %	0 %	50 %	385240891
10047	NC_017430	CTTC	2	8	516671	516678	0 %	50 %	0 %	50 %	385240891
10048	NC_017430	TCT	2	6	516782	516787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240891
10049	NC_017430	AGT	2	6	516939	516944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240891
10050	NC_017430	TCT	2	6	516962	516967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240891
10051	NC_017430	ATAG	2	8	516981	516988	50 %	25 %	25 %	0 %	385240891
10052	NC_017430	TCT	2	6	517063	517068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240891
10053	NC_017430	TGC	2	6	517069	517074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240891
10054	NC_017430	TGAACT	2	12	517075	517086	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385240891
10055	NC_017430	TTG	2	6	517110	517115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240891
10056	NC_017430	CAA	2	6	517568	517573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240892
10057	NC_017430	ATA	2	6	517602	517607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240892
10058	NC_017430	TC	3	6	517700	517705	0 %	50 %	0 %	50 %	385240892
10059	NC_017430	TAA	2	6	517742	517747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240892
10060	NC_017430	AGA	2	6	517780	517785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240892
10061	NC_017430	AAG	2	6	517817	517822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240892
10062	NC_017430	GA	3	6	517855	517860	50 %	0 %	50 %	0 %	385240892
10063	NC_017430	ATCC	2	8	517862	517869	25 %	25 %	0 %	50 %	385240892
10064	NC_017430	CAT	2	6	517897	517902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240892
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10067	NC_017430	TCT	2	6	517962	517967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240892
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10069	NC_017430	GAA	2	6	518032	518037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240892
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10072	NC_017430	AAT	2	6	518147	518152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240892
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10077	NC_017430	TC	3	6	518527	518532	0 %	50 %	0 %	50 %	385240892
10078	NC_017430	A	6	6	518580	518585	100 %	0 %	0 %	0 %	385240892
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10087	NC_017430	TGT	2	6	518904	518909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240892
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10091	NC_017430	GATGAA	2	12	519187	519198	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385240892
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10102	NC_017430	GTT	2	6	519570	519575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240894
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10107	NC_017430	TCA	2	6	519721	519726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240894
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10109	NC_017430	AATC	2	8	519745	519752	50 %	25 %	0 %	25 %	385240894
10110	NC_017430	AGCAC	2	10	519786	519795	40 %	0 %	20 %	40 %	385240894
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10116	NC_017430	TTCTG	2	10	520053	520062	0 %	60 %	20 %	20 %	385240894
10117	NC_017430	AT	3	6	520112	520117	50 %	50 %	0 %	0 %	385240894
10118	NC_017430	TTG	2	6	520178	520183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240894
10119	NC_017430	CA	4	8	520228	520235	50 %	0 %	0 %	50 %	385240894
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10121	NC_017430	ACT	2	6	520332	520337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240894
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10353	NC_017430	GACA	2	8	532831	532838	50 %	0 %	25 %	25 %	385240903
10354	NC_017430	TGG	2	6	532855	532860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385240903
10355	NC_017430	AT	3	6	532872	532877	50 %	50 %	0 %	0 %	385240903
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10483	NC_017430	CTT	2	6	539060	539065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240910
10484	NC_017430	AG	3	6	539080	539085	50 %	0 %	50 %	0 %	385240910
10485	NC_017430	CT	3	6	539105	539110	0 %	50 %	0 %	50 %	385240910
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10487	NC_017430	AGGGAA	2	12	539217	539228	50 %	0 %	50 %	0 %	385240910
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