MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/9768 chromosome

Total Repeats: 20302

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_017429	GAT	2	6	664257	664262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240117
13002	NC_017429	C	6	6	664268	664273	0 %	0 %	0 %	100 %	385240117
13003	NC_017429	TAC	2	6	664282	664287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240117
13004	NC_017429	C	6	6	664289	664294	0 %	0 %	0 %	100 %	385240117
13005	NC_017429	AT	3	6	664367	664372	50 %	50 %	0 %	0 %	385240117
13006	NC_017429	CT	3	6	664376	664381	0 %	50 %	0 %	50 %	385240117
13007	NC_017429	GAA	2	6	664413	664418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240117
13008	NC_017429	CTT	2	6	664435	664440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240117
13009	NC_017429	CGA	2	6	664446	664451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240117
13010	NC_017429	TTG	2	6	664475	664480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240117
13011	NC_017429	T	6	6	664505	664510	0 %	100 %	0 %	0 %	385240117
13012	NC_017429	ATG	2	6	664557	664562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240117
13013	NC_017429	TCG	2	6	664568	664573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240117
13014	NC_017429	CCAT	2	8	664583	664590	25 %	25 %	0 %	50 %	385240117
13015	NC_017429	ATC	2	6	664621	664626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240117
13016	NC_017429	A	7	7	664684	664690	100 %	0 %	0 %	0 %	385240117
13017	NC_017429	GAA	2	6	664734	664739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240117
13018	NC_017429	CAA	2	6	664743	664748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240117
13019	NC_017429	AGG	2	6	664823	664828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385240117
13020	NC_017429	TGCG	2	8	664916	664923	0 %	25 %	50 %	25 %	385240117
13021	NC_017429	TGAG	2	8	664963	664970	25 %	25 %	50 %	0 %	385240117
13022	NC_017429	CTC	2	6	664973	664978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385240117
13023	NC_017429	AAG	2	6	664984	664989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240117
13024	NC_017429	CAA	2	6	664995	665000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240117
13025	NC_017429	GCT	2	6	665004	665009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240117
13026	NC_017429	CT	3	6	665008	665013	0 %	50 %	0 %	50 %	385240117
13027	NC_017429	ACAG	2	8	665021	665028	50 %	0 %	25 %	25 %	385240117
13028	NC_017429	TCC	2	6	665195	665200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385240117
13029	NC_017429	AAGC	2	8	665269	665276	50 %	0 %	25 %	25 %	385240117
13030	NC_017429	GA	3	6	665287	665292	50 %	0 %	50 %	0 %	385240117
13031	NC_017429	GAA	2	6	665301	665306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240117
13032	NC_017429	GAA	2	6	665349	665354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240117
13033	NC_017429	TTA	2	6	665459	665464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240117
13034	NC_017429	CTT	2	6	665617	665622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240118
13035	NC_017429	CTC	2	6	665645	665650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385240118
13036	NC_017429	CTTT	3	12	665671	665682	0 %	75 %	0 %	25 %	385240118
13037	NC_017429	AAC	2	6	665700	665705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240118
13038	NC_017429	GAAAA	2	10	665755	665764	80 %	0 %	20 %	0 %	385240118
13039	NC_017429	T	6	6	665838	665843	0 %	100 %	0 %	0 %	385240118
13040	NC_017429	GAT	2	6	665862	665867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240118
13041	NC_017429	TTC	2	6	665904	665909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240118
13042	NC_017429	TA	3	6	665959	665964	50 %	50 %	0 %	0 %	385240118
13043	NC_017429	AACA	2	8	666163	666170	75 %	0 %	0 %	25 %	385240118
13044	NC_017429	TCT	2	6	666183	666188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240118
13045	NC_017429	TC	4	8	666256	666263	0 %	50 %	0 %	50 %	385240118
13046	NC_017429	CT	4	8	666281	666288	0 %	50 %	0 %	50 %	385240118
13047	NC_017429	CTT	2	6	666299	666304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240118
13048	NC_017429	ATT	2	6	666327	666332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240118
13049	NC_017429	GATGG	2	10	666513	666522	20 %	20 %	60 %	0 %	385240118
13050	NC_017429	CT	3	6	666526	666531	0 %	50 %	0 %	50 %	385240118
13051	NC_017429	TACTT	2	10	666672	666681	20 %	60 %	0 %	20 %	385240118
13052	NC_017429	CTG	2	6	666685	666690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240118
13053	NC_017429	AT	3	6	666717	666722	50 %	50 %	0 %	0 %	385240118
13054	NC_017429	TTA	2	6	666733	666738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240118
13055	NC_017429	TC	3	6	666756	666761	0 %	50 %	0 %	50 %	385240118
13056	NC_017429	AGG	2	6	666807	666812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385240118
13057	NC_017429	ATT	2	6	666827	666832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240118
13058	NC_017429	AAC	2	6	666842	666847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240118
13059	NC_017429	GGTTG	2	10	666865	666874	0 %	40 %	60 %	0 %	385240118
13060	NC_017429	CTT	2	6	666935	666940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240118
13061	NC_017429	CT	3	6	666952	666957	0 %	50 %	0 %	50 %	385240118
13062	NC_017429	TGA	2	6	667035	667040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240118
13063	NC_017429	AAC	2	6	667041	667046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240118
13064	NC_017429	TTCTAT	2	12	667062	667073	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385240118
13065	NC_017429	TTC	2	6	667095	667100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240118
13066	NC_017429	TCC	2	6	667134	667139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385240118
13067	NC_017429	AAC	3	9	667184	667192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240118
13068	NC_017429	CAT	2	6	667239	667244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240118
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13070	NC_017429	A	7	7	667415	667421	100 %	0 %	0 %	0 %	385240119
13071	NC_017429	TGG	2	6	667449	667454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385240119
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13078	NC_017429	ATA	2	6	667781	667786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240119
13079	NC_017429	TCT	2	6	667807	667812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240119
13080	NC_017429	GAA	2	6	667846	667851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240119
13081	NC_017429	AAG	2	6	667862	667867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240119
13082	NC_017429	CTG	2	6	667893	667898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240119
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13086	NC_017429	GA	3	6	668032	668037	50 %	0 %	50 %	0 %	385240119
13087	NC_017429	TCA	2	6	668038	668043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240119
13088	NC_017429	ATA	2	6	668079	668084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240119
13089	NC_017429	TAA	2	6	668102	668107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240119
13090	NC_017429	AT	3	6	668112	668117	50 %	50 %	0 %	0 %	385240119
13091	NC_017429	A	6	6	668146	668151	100 %	0 %	0 %	0 %	385240119
13092	NC_017429	CA	3	6	668170	668175	50 %	0 %	0 %	50 %	385240119
13093	NC_017429	TC	3	6	668176	668181	0 %	50 %	0 %	50 %	385240119
13094	NC_017429	GCT	3	9	668266	668274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240119
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13096	NC_017429	TGC	2	6	668349	668354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240119
13097	NC_017429	AAT	2	6	668414	668419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240119
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13100	NC_017429	CCT	2	6	668549	668554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385240119
13101	NC_017429	A	6	6	668664	668669	100 %	0 %	0 %	0 %	385240119
13102	NC_017429	TTC	2	6	668691	668696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240119
13103	NC_017429	CTC	2	6	668731	668736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385240119
13104	NC_017429	ATA	2	6	668747	668752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240119
13105	NC_017429	CT	3	6	668793	668798	0 %	50 %	0 %	50 %	385240119
13106	NC_017429	T	7	7	668882	668888	0 %	100 %	0 %	0 %	385240119
13107	NC_017429	GCA	2	6	668902	668907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240119
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13109	NC_017429	CTT	2	6	669086	669091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240119
13110	NC_017429	TCA	3	9	669130	669138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240119
13111	NC_017429	TGG	2	6	669170	669175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385240119
13112	NC_017429	TTG	2	6	669176	669181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240119
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13119	NC_017429	TAG	2	6	669489	669494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240119
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13241	NC_017429	AAG	2	6	675573	675578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240125
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