MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/9768 chromosome

Total Repeats: 20302

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_017429	A	6	6	638478	638483	100 %	0 %	0 %	0 %	385240096
12502	NC_017429	CTCTTT	2	12	638581	638592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240096
12503	NC_017429	ATATCC	2	12	638598	638609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240096
12504	NC_017429	AGC	2	6	638636	638641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240096
12505	NC_017429	T	6	6	638696	638701	0 %	100 %	0 %	0 %	385240096
12506	NC_017429	TAAACA	2	12	638709	638720	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385240096
12507	NC_017429	AGG	2	6	638818	638823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385240097
12508	NC_017429	ACAT	2	8	638875	638882	50 %	25 %	0 %	25 %	385240097
12509	NC_017429	CAA	2	6	638885	638890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240097
12510	NC_017429	GA	3	6	638911	638916	50 %	0 %	50 %	0 %	385240097
12511	NC_017429	TCC	2	6	638947	638952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385240097
12512	NC_017429	A	7	7	638958	638964	100 %	0 %	0 %	0 %	385240097
12513	NC_017429	ATGC	2	8	638974	638981	25 %	25 %	25 %	25 %	385240097
12514	NC_017429	ACGA	2	8	639014	639021	50 %	0 %	25 %	25 %	385240097
12515	NC_017429	GA	4	8	639073	639080	50 %	0 %	50 %	0 %	385240097
12516	NC_017429	AAG	2	6	639081	639086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240097
12517	NC_017429	CTA	2	6	639092	639097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240097
12518	NC_017429	A	6	6	639100	639105	100 %	0 %	0 %	0 %	385240097
12519	NC_017429	ACA	2	6	639176	639181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240098
12520	NC_017429	TCAT	2	8	639197	639204	25 %	50 %	0 %	25 %	385240098
12521	NC_017429	AAG	2	6	639211	639216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240098
12522	NC_017429	TCT	2	6	639218	639223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240098
12523	NC_017429	AAG	2	6	639238	639243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240098
12524	NC_017429	TTTC	2	8	639244	639251	0 %	75 %	0 %	25 %	385240098
12525	NC_017429	CAC	2	6	639260	639265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385240098
12526	NC_017429	TCT	2	6	639272	639277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240098
12527	NC_017429	CAT	2	6	639337	639342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240098
12528	NC_017429	CCA	2	6	639431	639436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385240098
12529	NC_017429	ATA	2	6	639437	639442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240098
12530	NC_017429	CAT	2	6	639463	639468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240098
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12532	NC_017429	AATC	2	8	639578	639585	50 %	25 %	0 %	25 %	385240099
12533	NC_017429	ACC	2	6	639693	639698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385240099
12534	NC_017429	TTC	2	6	639713	639718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240099
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12537	NC_017429	CTT	2	6	639814	639819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240099
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12540	NC_017429	TCT	2	6	639970	639975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240099
12541	NC_017429	T	6	6	640010	640015	0 %	100 %	0 %	0 %	385240099
12542	NC_017429	TCC	2	6	640049	640054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385240099
12543	NC_017429	TTTC	2	8	640144	640151	0 %	75 %	0 %	25 %	385240099
12544	NC_017429	AGAA	2	8	640173	640180	75 %	0 %	25 %	0 %	385240099
12545	NC_017429	CAC	2	6	640181	640186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385240099
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12551	NC_017429	TAA	3	9	640502	640510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240099
12552	NC_017429	TC	4	8	640562	640569	0 %	50 %	0 %	50 %	385240099
12553	NC_017429	AGC	2	6	640604	640609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240099
12554	NC_017429	AAG	2	6	640610	640615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240099
12555	NC_017429	CT	3	6	640616	640621	0 %	50 %	0 %	50 %	385240099
12556	NC_017429	CGT	2	6	640656	640661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240099
12557	NC_017429	T	6	6	640661	640666	0 %	100 %	0 %	0 %	385240099
12558	NC_017429	CGGAA	2	10	640926	640935	40 %	0 %	40 %	20 %	385240100
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12561	NC_017429	TTG	2	6	641088	641093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240100
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12583	NC_017429	CAT	2	6	642217	642222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240100
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12587	NC_017429	AGC	2	6	642296	642301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240101
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12603	NC_017429	TTTC	2	8	643047	643054	0 %	75 %	0 %	25 %	385240101
12604	NC_017429	T	7	7	643081	643087	0 %	100 %	0 %	0 %	385240101
12605	NC_017429	CAA	2	6	643106	643111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240101
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12608	NC_017429	CTT	2	6	643204	643209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240101
12609	NC_017429	ACT	2	6	643298	643303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240101
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12611	NC_017429	CT	3	6	643419	643424	0 %	50 %	0 %	50 %	385240101
12612	NC_017429	AGCG	2	8	643494	643501	25 %	0 %	50 %	25 %	385240101
12613	NC_017429	AGA	2	6	643541	643546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240101
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12619	NC_017429	AGA	2	6	643814	643819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240101
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12983	NC_017429	TAC	2	6	663221	663226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240116
12984	NC_017429	GAA	2	6	663327	663332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240116
12985	NC_017429	AATA	2	8	663534	663541	75 %	25 %	0 %	0 %	385240117
12986	NC_017429	CACG	2	8	663559	663566	25 %	0 %	25 %	50 %	385240117
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12988	NC_017429	TAT	2	6	663602	663607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240117
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