MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/9768 chromosome

Total Repeats: 20302

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_017429	GAC	2	6	587899	587904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240038
11502	NC_017429	AAG	2	6	587905	587910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240038
11503	NC_017429	AAC	2	6	587941	587946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240038
11504	NC_017429	A	6	6	587988	587993	100 %	0 %	0 %	0 %	385240038
11505	NC_017429	GCAA	2	8	588107	588114	50 %	0 %	25 %	25 %	385240038
11506	NC_017429	T	6	6	588132	588137	0 %	100 %	0 %	0 %	385240038
11507	NC_017429	GCA	2	6	588249	588254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240039
11508	NC_017429	TC	3	6	588313	588318	0 %	50 %	0 %	50 %	385240039
11509	NC_017429	TCTT	2	8	588332	588339	0 %	75 %	0 %	25 %	385240039
11510	NC_017429	GTTGT	2	10	588391	588400	0 %	60 %	40 %	0 %	385240039
11511	NC_017429	TTC	2	6	588404	588409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240039
11512	NC_017429	AGA	2	6	588560	588565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240039
11513	NC_017429	TTC	2	6	588589	588594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240039
11514	NC_017429	ATA	2	6	588658	588663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240040
11515	NC_017429	AG	3	6	588675	588680	50 %	0 %	50 %	0 %	385240040
11516	NC_017429	AGG	2	6	588685	588690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385240040
11517	NC_017429	ATT	2	6	588723	588728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240040
11518	NC_017429	CAT	2	6	588848	588853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240040
11519	NC_017429	TCC	2	6	588882	588887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385240040
11520	NC_017429	T	6	6	588913	588918	0 %	100 %	0 %	0 %	385240040
11521	NC_017429	AGC	2	6	588921	588926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240040
11522	NC_017429	AAACT	2	10	589024	589033	60 %	20 %	0 %	20 %	385240040
11523	NC_017429	CCT	2	6	589039	589044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385240040
11524	NC_017429	AAC	2	6	589047	589052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240040
11525	NC_017429	ACA	2	6	589056	589061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240040
11526	NC_017429	GAC	2	6	589068	589073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240040
11527	NC_017429	CT	3	6	589160	589165	0 %	50 %	0 %	50 %	385240041
11528	NC_017429	CTA	2	6	589186	589191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240041
11529	NC_017429	CTC	2	6	589210	589215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385240041
11530	NC_017429	AAC	2	6	589223	589228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240041
11531	NC_017429	T	6	6	589296	589301	0 %	100 %	0 %	0 %	385240041
11532	NC_017429	CAT	2	6	589369	589374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240041
11533	NC_017429	TA	3	6	589495	589500	50 %	50 %	0 %	0 %	385240041
11534	NC_017429	T	6	6	589538	589543	0 %	100 %	0 %	0 %	385240042
11535	NC_017429	GCT	2	6	589554	589559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240042
11536	NC_017429	ACG	2	6	589571	589576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240042
11537	NC_017429	AACT	2	8	589661	589668	50 %	25 %	0 %	25 %	385240042
11538	NC_017429	TCTA	2	8	589904	589911	25 %	50 %	0 %	25 %	385240042
11539	NC_017429	AACA	2	8	589931	589938	75 %	0 %	0 %	25 %	385240042
11540	NC_017429	CTT	2	6	589966	589971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240042
11541	NC_017429	TCA	2	6	590019	590024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240042
11542	NC_017429	ACCAA	2	10	590116	590125	60 %	0 %	0 %	40 %	385240043
11543	NC_017429	CGC	2	6	590137	590142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385240043
11544	NC_017429	GAG	2	6	590185	590190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385240043
11545	NC_017429	TGC	2	6	590237	590242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240043
11546	NC_017429	CCT	2	6	590255	590260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385240043
11547	NC_017429	AC	3	6	590272	590277	50 %	0 %	0 %	50 %	385240043
11548	NC_017429	TCT	2	6	590307	590312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240043
11549	NC_017429	TCT	2	6	590352	590357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240043
11550	NC_017429	TGC	2	6	590385	590390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240043
11551	NC_017429	CTT	2	6	590542	590547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240044
11552	NC_017429	ATTC	2	8	590620	590627	25 %	50 %	0 %	25 %	385240044
11553	NC_017429	ATC	2	6	590677	590682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240044
11554	NC_017429	CATA	2	8	590784	590791	50 %	25 %	0 %	25 %	385240044
11555	NC_017429	TTA	2	6	590967	590972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240044
11556	NC_017429	TCT	2	6	590976	590981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240044
11557	NC_017429	TCTT	2	8	591033	591040	0 %	75 %	0 %	25 %	385240044
11558	NC_017429	TA	3	6	591051	591056	50 %	50 %	0 %	0 %	385240044
11559	NC_017429	T	7	7	591058	591064	0 %	100 %	0 %	0 %	385240044
11560	NC_017429	TC	4	8	591086	591093	0 %	50 %	0 %	50 %	385240045
11561	NC_017429	GAA	2	6	591111	591116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240045
11562	NC_017429	TC	3	6	591154	591159	0 %	50 %	0 %	50 %	385240045
11563	NC_017429	ACGT	2	8	591203	591210	25 %	25 %	25 %	25 %	385240045
11564	NC_017429	GAG	2	6	591223	591228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385240045
11565	NC_017429	T	6	6	591279	591284	0 %	100 %	0 %	0 %	385240045
11566	NC_017429	AAC	2	6	591325	591330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240045
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11568	NC_017429	ATC	2	6	591527	591532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240046
11569	NC_017429	GAT	2	6	591533	591538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240046
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11571	NC_017429	CTT	2	6	591632	591637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240046
11572	NC_017429	ATCAC	2	10	591678	591687	40 %	20 %	0 %	40 %	385240046
11573	NC_017429	CGA	2	6	591705	591710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240046
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11577	NC_017429	ATA	2	6	591915	591920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240047
11578	NC_017429	ACC	2	6	591937	591942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385240047
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11580	NC_017429	T	6	6	591992	591997	0 %	100 %	0 %	0 %	385240047
11581	NC_017429	TGA	2	6	592005	592010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240047
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11584	NC_017429	TGA	2	6	592130	592135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240048
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11587	NC_017429	AG	3	6	592182	592187	50 %	0 %	50 %	0 %	385240048
11588	NC_017429	T	6	6	592189	592194	0 %	100 %	0 %	0 %	385240048
11589	NC_017429	TC	3	6	592233	592238	0 %	50 %	0 %	50 %	385240048
11590	NC_017429	TAA	2	6	592249	592254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240048
11591	NC_017429	T	6	6	592259	592264	0 %	100 %	0 %	0 %	385240048
11592	NC_017429	GCA	2	6	592323	592328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240049
11593	NC_017429	TCT	2	6	592353	592358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240049
11594	NC_017429	ACA	2	6	592401	592406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240049
11595	NC_017429	CAG	2	6	592453	592458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240049
11596	NC_017429	T	6	6	592460	592465	0 %	100 %	0 %	0 %	385240049
11597	NC_017429	GGC	2	6	592555	592560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385240049
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11601	NC_017429	ATA	2	6	592689	592694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240049
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11603	NC_017429	AGC	2	6	592741	592746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240050
11604	NC_017429	CTT	2	6	592774	592779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240050
11605	NC_017429	AGT	2	6	592822	592827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240050
11606	NC_017429	CCGA	2	8	592902	592909	25 %	0 %	25 %	50 %	385240050
11607	NC_017429	GAAA	2	8	593008	593015	75 %	0 %	25 %	0 %	385240050
11608	NC_017429	CGA	2	6	593049	593054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240050
11609	NC_017429	TTC	2	6	593159	593164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240050
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11611	NC_017429	GCA	2	6	593240	593245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240050
11612	NC_017429	AAG	2	6	593253	593258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240050
11613	NC_017429	TCT	2	6	593262	593267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240050
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11616	NC_017429	CAA	2	6	593424	593429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240051
11617	NC_017429	T	6	6	593599	593604	0 %	100 %	0 %	0 %	385240051
11618	NC_017429	CAA	2	6	593655	593660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240051
11619	NC_017429	TCA	2	6	593673	593678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240051
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11986	NC_017429	A	6	6	612580	612585	100 %	0 %	0 %	0 %	385240072
11987	NC_017429	AGC	2	6	612633	612638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240072
11988	NC_017429	TTG	2	6	612695	612700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240072
11989	NC_017429	TCAA	2	8	612860	612867	50 %	25 %	0 %	25 %	385240073
11990	NC_017429	TTG	2	6	612873	612878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240073
11991	NC_017429	CGCT	2	8	612906	612913	0 %	25 %	25 %	50 %	385240073
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11993	NC_017429	ATC	2	6	612986	612991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240073
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11998	NC_017429	CTCTC	2	10	613115	613124	0 %	40 %	0 %	60 %	385240073
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