MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/9768 chromosome

Total Repeats: 20302

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_017429	CGA	2	6	563542	563547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240012
11002	NC_017429	TC	3	6	563560	563565	0 %	50 %	0 %	50 %	385240012
11003	NC_017429	GAAA	2	8	563760	563767	75 %	0 %	25 %	0 %	385240013
11004	NC_017429	C	6	6	563771	563776	0 %	0 %	0 %	100 %	385240013
11005	NC_017429	TGT	2	6	563874	563879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240013
11006	NC_017429	GAA	2	6	563902	563907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240013
11007	NC_017429	AGG	2	6	563927	563932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385240013
11008	NC_017429	TA	3	6	563936	563941	50 %	50 %	0 %	0 %	385240013
11009	NC_017429	GAAC	2	8	563988	563995	50 %	0 %	25 %	25 %	385240013
11010	NC_017429	CTA	2	6	564108	564113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240013
11011	NC_017429	AGATCC	2	12	564131	564142	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385240013
11012	NC_017429	CAAA	2	8	564145	564152	75 %	0 %	0 %	25 %	385240013
11013	NC_017429	CCT	2	6	564202	564207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385240013
11014	NC_017429	CAC	2	6	564209	564214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385240013
11015	NC_017429	AGAA	2	8	564278	564285	75 %	0 %	25 %	0 %	385240013
11016	NC_017429	CAAA	2	8	564402	564409	75 %	0 %	0 %	25 %	385240014
11017	NC_017429	GA	3	6	564414	564419	50 %	0 %	50 %	0 %	385240014
11018	NC_017429	CCAT	2	8	564425	564432	25 %	25 %	0 %	50 %	385240014
11019	NC_017429	GGA	2	6	564479	564484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385240014
11020	NC_017429	TCT	2	6	564506	564511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240014
11021	NC_017429	GCTC	2	8	564536	564543	0 %	25 %	25 %	50 %	385240014
11022	NC_017429	ATC	2	6	564574	564579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240014
11023	NC_017429	CT	3	6	564594	564599	0 %	50 %	0 %	50 %	385240014
11024	NC_017429	CAT	2	6	564606	564611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240014
11025	NC_017429	AGA	2	6	564640	564645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240014
11026	NC_017429	CAA	2	6	564663	564668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240014
11027	NC_017429	TGA	2	6	564674	564679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240014
11028	NC_017429	AGA	2	6	564748	564753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240014
11029	NC_017429	AAT	2	6	564765	564770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240014
11030	NC_017429	A	6	6	564815	564820	100 %	0 %	0 %	0 %	385240014
11031	NC_017429	CTT	2	6	564837	564842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240014
11032	NC_017429	ATC	2	6	564886	564891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240014
11033	NC_017429	TC	3	6	564905	564910	0 %	50 %	0 %	50 %	385240014
11034	NC_017429	T	6	6	564924	564929	0 %	100 %	0 %	0 %	385240014
11035	NC_017429	CCCA	2	8	564938	564945	25 %	0 %	0 %	75 %	385240014
11036	NC_017429	CT	3	6	565108	565113	0 %	50 %	0 %	50 %	385240015
11037	NC_017429	GAT	2	6	565154	565159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240015
11038	NC_017429	AAC	2	6	565172	565177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240015
11039	NC_017429	CAG	2	6	565248	565253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240015
11040	NC_017429	TCA	2	6	565257	565262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240015
11041	NC_017429	CAT	2	6	565337	565342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240015
11042	NC_017429	CA	3	6	565435	565440	50 %	0 %	0 %	50 %	385240015
11043	NC_017429	AAT	2	6	565469	565474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240015
11044	NC_017429	GAT	2	6	565486	565491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240015
11045	NC_017429	C	6	6	565511	565516	0 %	0 %	0 %	100 %	385240015
11046	NC_017429	TCA	2	6	565518	565523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240015
11047	NC_017429	TAA	2	6	565584	565589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240015
11048	NC_017429	CGT	2	6	565621	565626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240015
11049	NC_017429	ATC	2	6	565685	565690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240015
11050	NC_017429	TCT	2	6	565698	565703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240015
11051	NC_017429	T	6	6	565790	565795	0 %	100 %	0 %	0 %	385240015
11052	NC_017429	ATCA	2	8	565859	565866	50 %	25 %	0 %	25 %	385240015
11053	NC_017429	CTA	2	6	565972	565977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240015
11054	NC_017429	A	6	6	566022	566027	100 %	0 %	0 %	0 %	385240015
11055	NC_017429	AGA	2	6	566055	566060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240015
11056	NC_017429	AGGTA	2	10	566197	566206	40 %	20 %	40 %	0 %	385240015
11057	NC_017429	CAA	2	6	566313	566318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240015
11058	NC_017429	CTC	2	6	566344	566349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385240015
11059	NC_017429	CTT	2	6	566413	566418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240015
11060	NC_017429	CGTC	2	8	566420	566427	0 %	25 %	25 %	50 %	385240015
11061	NC_017429	TTG	2	6	566646	566651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240016
11062	NC_017429	CCT	2	6	566687	566692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385240016
11063	NC_017429	AAAG	2	8	566747	566754	75 %	0 %	25 %	0 %	385240016
11064	NC_017429	CTA	2	6	566795	566800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240016
11065	NC_017429	ATC	2	6	566852	566857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240016
11066	NC_017429	AAC	2	6	567000	567005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240017
11067	NC_017429	ACA	2	6	567034	567039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240017
11068	NC_017429	TTC	2	6	567041	567046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240017
11069	NC_017429	ATCA	2	8	567182	567189	50 %	25 %	0 %	25 %	385240017
11070	NC_017429	TCC	2	6	567215	567220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385240017
11071	NC_017429	GAA	2	6	567245	567250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240017
11072	NC_017429	GTT	2	6	567442	567447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240017
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11074	NC_017429	TCA	2	6	567516	567521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240017
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11076	NC_017429	GAG	2	6	567607	567612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385240017
11077	NC_017429	T	6	6	567860	567865	0 %	100 %	0 %	0 %	385240017
11078	NC_017429	ACG	2	6	567875	567880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240017
11079	NC_017429	TCT	2	6	567906	567911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240017
11080	NC_017429	GGAA	2	8	567914	567921	50 %	0 %	50 %	0 %	385240017
11081	NC_017429	TCA	2	6	567999	568004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240017
11082	NC_017429	TTTC	2	8	568162	568169	0 %	75 %	0 %	25 %	385240017
11083	NC_017429	TCT	2	6	568170	568175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240017
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11085	NC_017429	CT	3	6	568272	568277	0 %	50 %	0 %	50 %	385240017
11086	NC_017429	CGA	2	6	568325	568330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240018
11087	NC_017429	TTC	2	6	568333	568338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240018
11088	NC_017429	ATT	2	6	568348	568353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240018
11089	NC_017429	T	6	6	568380	568385	0 %	100 %	0 %	0 %	385240018
11090	NC_017429	AGA	2	6	568393	568398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240018
11091	NC_017429	T	7	7	568443	568449	0 %	100 %	0 %	0 %	385240018
11092	NC_017429	ACA	2	6	568530	568535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240018
11093	NC_017429	CAA	2	6	568599	568604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240018
11094	NC_017429	AC	3	6	568609	568614	50 %	0 %	0 %	50 %	385240018
11095	NC_017429	TCT	2	6	568631	568636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240018
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11098	NC_017429	ACAG	2	8	568933	568940	50 %	0 %	25 %	25 %	385240019
11099	NC_017429	TTC	2	6	568992	568997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240019
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11101	NC_017429	TAA	3	9	569034	569042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240019
11102	NC_017429	TTAA	2	8	569098	569105	50 %	50 %	0 %	0 %	385240019
11103	NC_017429	GCA	2	6	569110	569115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240019
11104	NC_017429	CT	3	6	569199	569204	0 %	50 %	0 %	50 %	385240019
11105	NC_017429	TAA	2	6	569258	569263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240019
11106	NC_017429	CTG	2	6	569267	569272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240019
11107	NC_017429	CTG	2	6	569358	569363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240019
11108	NC_017429	GCT	3	9	569405	569413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240019
11109	NC_017429	CT	3	6	569489	569494	0 %	50 %	0 %	50 %	385240019
11110	NC_017429	AAT	2	6	569546	569551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240019
11111	NC_017429	A	6	6	569560	569565	100 %	0 %	0 %	0 %	385240019
11112	NC_017429	T	6	6	569577	569582	0 %	100 %	0 %	0 %	385240019
11113	NC_017429	ACA	2	6	569756	569761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240019
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11115	NC_017429	TCT	2	6	569812	569817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240019
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11117	NC_017429	TCT	2	6	570100	570105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240019
11118	NC_017429	AAAT	2	8	570114	570121	75 %	25 %	0 %	0 %	385240019
11119	NC_017429	AAGC	2	8	570146	570153	50 %	0 %	25 %	25 %	385240019
11120	NC_017429	C	6	6	570209	570214	0 %	0 %	0 %	100 %	385240019
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11122	NC_017429	CTT	2	6	570236	570241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240019
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11241	NC_017429	ACCA	2	8	575462	575469	50 %	0 %	0 %	50 %	385240024
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11243	NC_017429	A	7	7	575503	575509	100 %	0 %	0 %	0 %	385240024
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