MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis CIP 52.97 chromosome

Total Repeats: 36698

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017307	AAG	2	6	38	43	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387137614
2	NC_017307	GCT	2	6	54	59	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137614
3	NC_017307	A	6	6	187	192	100 %	0 %	0 %	0 %	387137614
4	NC_017307	ACT	2	6	202	207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387137614
5	NC_017307	TGCA	2	8	275	282	25 %	25 %	25 %	25 %	387137614
6	NC_017307	TGC	2	6	321	326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137614
7	NC_017307	CAA	2	6	400	405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387137614
8	NC_017307	AT	3	6	412	417	50 %	50 %	0 %	0 %	387137614
9	NC_017307	TTC	3	9	456	464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387137614
10	NC_017307	TCA	2	6	513	518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387137614
11	NC_017307	CA	3	6	610	615	50 %	0 %	0 %	50 %	387137614
12	NC_017307	TGC	2	6	627	632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137614
13	NC_017307	G	6	6	661	666	0 %	0 %	100 %	0 %	387137614
14	NC_017307	CTG	2	6	698	703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137614
15	NC_017307	TTCC	2	8	710	717	0 %	50 %	0 %	50 %	387137614
16	NC_017307	CGC	2	6	722	727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387137614
17	NC_017307	AGC	2	6	737	742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387137614
18	NC_017307	CAG	2	6	833	838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387137614
19	NC_017307	AGCC	2	8	857	864	25 %	0 %	25 %	50 %	387137614
20	NC_017307	ATGC	2	8	922	929	25 %	25 %	25 %	25 %	387137614
21	NC_017307	AT	3	6	1005	1010	50 %	50 %	0 %	0 %	387137614
22	NC_017307	CAGG	2	8	1029	1036	25 %	0 %	50 %	25 %	387137614
23	NC_017307	TCC	2	6	1094	1099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387137614
24	NC_017307	AAG	2	6	1106	1111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387137614
25	NC_017307	GAA	2	6	1120	1125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387137614
26	NC_017307	T	6	6	1126	1131	0 %	100 %	0 %	0 %	387137614
27	NC_017307	ACT	2	6	1204	1209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387137614
28	NC_017307	TACG	2	8	1223	1230	25 %	25 %	25 %	25 %	387137614
29	NC_017307	TGA	2	6	1295	1300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137614
30	NC_017307	GGC	2	6	1305	1310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387137614
31	NC_017307	TTG	2	6	1322	1327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387137614
32	NC_017307	ATG	2	6	1489	1494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137614
33	NC_017307	CGA	2	6	1523	1528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387137614
34	NC_017307	CTG	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137614
35	NC_017307	GATG	2	8	1560	1567	25 %	25 %	50 %	0 %	387137614
36	NC_017307	CG	3	6	1611	1616	0 %	0 %	50 %	50 %	387137614
37	NC_017307	ACCAC	2	10	1694	1703	40 %	0 %	0 %	60 %	387137614
38	NC_017307	GAA	2	6	1746	1751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387137614
39	NC_017307	ATG	2	6	1760	1765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137614
40	NC_017307	GCT	2	6	1773	1778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137614
41	NC_017307	GCA	2	6	1782	1787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387137614
42	NC_017307	TTC	2	6	1797	1802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387137614
43	NC_017307	TAAA	2	8	1829	1836	75 %	25 %	0 %	0 %	387137615
44	NC_017307	AGT	2	6	1905	1910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137615
45	NC_017307	GAAG	2	8	2429	2436	50 %	0 %	50 %	0 %	387137616
46	NC_017307	CCCA	2	8	2484	2491	25 %	0 %	0 %	75 %	387137616
47	NC_017307	TAC	2	6	2497	2502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387137616
48	NC_017307	TCA	2	6	2512	2517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387137616
49	NC_017307	GAT	2	6	2523	2528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137616
50	NC_017307	GCT	2	6	2627	2632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137616
51	NC_017307	CAT	2	6	2639	2644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387137616
52	NC_017307	CTGC	2	8	2769	2776	0 %	25 %	25 %	50 %	387137616
53	NC_017307	GCA	3	9	2829	2837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387137616
54	NC_017307	TC	3	6	3005	3010	0 %	50 %	0 %	50 %	387137616
55	NC_017307	GAAA	2	8	3255	3262	75 %	0 %	25 %	0 %	387137616
56	NC_017307	CGG	2	6	3307	3312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387137616
57	NC_017307	AGA	2	6	3335	3340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387137616
58	NC_017307	TTAC	2	8	3398	3405	25 %	50 %	0 %	25 %	387137616
59	NC_017307	GAG	2	6	3492	3497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387137616
60	NC_017307	TCGT	2	8	3683	3690	0 %	50 %	25 %	25 %	387137617
61	NC_017307	TTG	2	6	3766	3771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387137617
62	NC_017307	AT	3	6	3782	3787	50 %	50 %	0 %	0 %	387137617
63	NC_017307	CTG	2	6	3868	3873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137617
64	NC_017307	TTG	2	6	4066	4071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387137617
65	NC_017307	GAT	2	6	4185	4190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137617
66	NC_017307	GAG	2	6	4389	4394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387137617
67	NC_017307	TCA	2	6	4398	4403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387137617
68	NC_017307	A	6	6	4463	4468	100 %	0 %	0 %	0 %	387137617
69	NC_017307	GAC	2	6	4509	4514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387137617
70	NC_017307	CGA	2	6	4649	4654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387137617
71	NC_017307	GCC	2	6	4734	4739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387137617
72	NC_017307	AAGG	2	8	4839	4846	50 %	0 %	50 %	0 %	387137617
73	NC_017307	CTG	2	6	4868	4873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137618
74	NC_017307	AGA	2	6	4884	4889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387137618
75	NC_017307	GCG	2	6	4932	4937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387137618
76	NC_017307	TC	3	6	4956	4961	0 %	50 %	0 %	50 %	387137618
77	NC_017307	A	6	6	5024	5029	100 %	0 %	0 %	0 %	387137618
78	NC_017307	CGG	2	6	5145	5150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387137618
79	NC_017307	TGG	2	6	5177	5182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387137618
80	NC_017307	A	6	6	5186	5191	100 %	0 %	0 %	0 %	387137618
81	NC_017307	AGC	2	6	5193	5198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387137618
82	NC_017307	AC	3	6	5199	5204	50 %	0 %	0 %	50 %	387137618
83	NC_017307	ATG	2	6	5278	5283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137618
84	NC_017307	ATAC	2	8	5414	5421	50 %	25 %	0 %	25 %	387137618
85	NC_017307	CACGC	2	10	5735	5744	20 %	0 %	20 %	60 %	387137619
86	NC_017307	GTGGA	2	10	5772	5781	20 %	20 %	60 %	0 %	387137619
87	NC_017307	ATGC	2	8	5816	5823	25 %	25 %	25 %	25 %	387137619
88	NC_017307	TGG	2	6	5869	5874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387137619
89	NC_017307	GGT	2	6	5906	5911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387137619
90	NC_017307	ACC	2	6	6059	6064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387137619
91	NC_017307	ACC	3	9	6098	6106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387137619
92	NC_017307	CAT	2	6	6118	6123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387137619
93	NC_017307	CGT	2	6	6128	6133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137619
94	NC_017307	TGA	2	6	6226	6231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137619
95	NC_017307	A	6	6	6261	6266	100 %	0 %	0 %	0 %	387137619
96	NC_017307	CCGATG	2	12	6273	6284	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387137619
97	NC_017307	CTG	2	6	6300	6305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137619
98	NC_017307	GAA	2	6	6310	6315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387137619
99	NC_017307	GAA	2	6	6322	6327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387137619
100	NC_017307	TTA	2	6	6337	6342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387137619
101	NC_017307	TGA	2	6	6430	6435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137619
102	NC_017307	GAA	2	6	6533	6538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387137619
103	NC_017307	TGA	2	6	6564	6569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137619
104	NC_017307	CG	3	6	6577	6582	0 %	0 %	50 %	50 %	387137619
105	NC_017307	AATCT	2	10	6609	6618	40 %	40 %	0 %	20 %	387137619
106	NC_017307	TCT	2	6	6818	6823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387137619
107	NC_017307	GGC	2	6	6838	6843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387137619
108	NC_017307	TGG	2	6	6889	6894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387137619
109	NC_017307	ATT	2	6	7097	7102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387137619
110	NC_017307	ATG	2	6	7125	7130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137619
111	NC_017307	CAA	2	6	7141	7146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387137619
112	NC_017307	GCT	3	9	7210	7218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137619
113	NC_017307	TTG	2	6	7223	7228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387137619
114	NC_017307	CCG	2	6	7280	7285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387137619
115	NC_017307	GAA	2	6	7358	7363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387137619
116	NC_017307	CAA	2	6	7387	7392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387137619
117	NC_017307	GAT	2	6	7394	7399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137619
118	NC_017307	ATG	2	6	7500	7505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137619
119	NC_017307	TGA	2	6	7516	7521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137619
120	NC_017307	TCG	2	6	7558	7563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137619
121	NC_017307	CAG	2	6	7750	7755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387137620
122	NC_017307	T	6	6	7804	7809	0 %	100 %	0 %	0 %	387137620
123	NC_017307	TTC	2	6	7898	7903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387137620
124	NC_017307	GAG	2	6	7946	7951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387137620
125	NC_017307	AGC	2	6	7958	7963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387137620
126	NC_017307	TGC	2	6	7994	7999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137620
127	NC_017307	GAG	2	6	8105	8110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387137620
128	NC_017307	AT	3	6	8127	8132	50 %	50 %	0 %	0 %	387137620
129	NC_017307	ATT	2	6	8304	8309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387137621
130	NC_017307	GAAA	2	8	8471	8478	75 %	0 %	25 %	0 %	387137622
131	NC_017307	CTG	2	6	8548	8553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137622
132	NC_017307	TGT	2	6	8593	8598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387137622
133	NC_017307	CTG	2	6	8601	8606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137622
134	NC_017307	TGC	2	6	8652	8657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137622
135	NC_017307	GTC	2	6	8662	8667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137622
136	NC_017307	GCG	2	6	8724	8729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387137623
137	NC_017307	TGA	2	6	8810	8815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137623
138	NC_017307	GCT	2	6	8827	8832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137623
139	NC_017307	CGA	2	6	9088	9093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387137624
140	NC_017307	GCG	2	6	9102	9107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387137624
141	NC_017307	GAG	2	6	9143	9148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387137624
142	NC_017307	CCG	2	6	9235	9240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387137624
143	NC_017307	ACG	2	6	9441	9446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387137624
144	NC_017307	CGC	2	6	9451	9456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387137624
145	NC_017307	ACTC	2	8	9478	9485	25 %	25 %	0 %	50 %	387137624
146	NC_017307	TTC	2	6	9573	9578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387137624
147	NC_017307	CG	3	6	9582	9587	0 %	0 %	50 %	50 %	387137624
148	NC_017307	TGA	2	6	9600	9605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137624
149	NC_017307	CAAC	2	8	9636	9643	50 %	0 %	0 %	50 %	387137624
150	NC_017307	TCT	2	6	9681	9686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387137624
151	NC_017307	GCAT	2	8	9731	9738	25 %	25 %	25 %	25 %	387137624
152	NC_017307	GAA	3	9	9857	9865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387137624
153	NC_017307	ACA	2	6	9918	9923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387137624
154	NC_017307	CG	3	6	10047	10052	0 %	0 %	50 %	50 %	387137624
155	NC_017307	TGC	2	6	10158	10163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137624
156	NC_017307	TTA	2	6	10165	10170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387137624
157	NC_017307	TCG	2	6	10198	10203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137624
158	NC_017307	GAA	2	6	10220	10225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387137624
159	NC_017307	CGA	2	6	10279	10284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387137624
160	NC_017307	GC	3	6	10325	10330	0 %	0 %	50 %	50 %	387137624
161	NC_017307	AGA	2	6	10422	10427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387137624
162	NC_017307	GAAATT	3	18	10445	10462	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387137624
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164	NC_017307	ATT	2	6	10568	10573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387137624
165	NC_017307	GAA	2	6	10595	10600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387137624
166	NC_017307	GTG	2	6	10622	10627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387137624
167	NC_017307	CGT	2	6	10688	10693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137624
168	NC_017307	CTT	2	6	10747	10752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387137624
169	NC_017307	CACG	2	8	10762	10769	25 %	0 %	25 %	50 %	387137624
170	NC_017307	CG	4	8	10846	10853	0 %	0 %	50 %	50 %	387137624
171	NC_017307	AAG	2	6	10973	10978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387137624
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174	NC_017307	ATG	2	6	11076	11081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137624
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177	NC_017307	TGA	3	9	11131	11139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137624
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229	NC_017307	TGA	2	6	13855	13860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137627
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249	NC_017307	CAGTG	2	10	15505	15514	20 %	20 %	40 %	20 %	387137629
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253	NC_017307	ATT	2	6	15689	15694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387137629
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257	NC_017307	CGA	2	6	16014	16019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387137630
258	NC_017307	TGC	2	6	16164	16169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137630
259	NC_017307	TGCG	2	8	16299	16306	0 %	25 %	50 %	25 %	387137630
260	NC_017307	T	6	6	16311	16316	0 %	100 %	0 %	0 %	387137630
261	NC_017307	GCA	2	6	16406	16411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387137630
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383	NC_017307	TGCGT	2	10	24367	24376	0 %	40 %	40 %	20 %	387137642
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386	NC_017307	A	6	6	24567	24572	100 %	0 %	0 %	0 %	387137642
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