MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis PAT10 chromosome

Total Repeats: 37477

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017305	GCC	2	6	240121	240126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384510109
4002	NC_017305	AGA	2	6	240147	240152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384510109
4003	NC_017305	C	6	6	240154	240159	0 %	0 %	0 %	100 %	384510109
4004	NC_017305	GCT	2	6	240219	240224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510109
4005	NC_017305	GCC	2	6	240233	240238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384510109
4006	NC_017305	AGT	2	6	240270	240275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510109
4007	NC_017305	AGA	3	9	240306	240314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384510109
4008	NC_017305	GCA	2	6	240325	240330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510109
4009	NC_017305	TCC	2	6	240334	240339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384510109
4010	NC_017305	GGGC	2	8	240352	240359	0 %	0 %	75 %	25 %	384510109
4011	NC_017305	GCC	2	6	240392	240397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384510109
4012	NC_017305	ACG	2	6	240515	240520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510109
4013	NC_017305	A	6	6	240631	240636	100 %	0 %	0 %	0 %	384510109
4014	NC_017305	GGA	2	6	240638	240643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384510109
4015	NC_017305	CGCA	2	8	240722	240729	25 %	0 %	25 %	50 %	384510109
4016	NC_017305	GTT	2	6	241244	241249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384510110
4017	NC_017305	CGG	2	6	241254	241259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510110
4018	NC_017305	GCT	2	6	241293	241298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510110
4019	NC_017305	AAG	2	6	241356	241361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384510110
4020	NC_017305	GA	3	6	241386	241391	50 %	0 %	50 %	0 %	384510110
4021	NC_017305	TTTTG	2	10	241435	241444	0 %	80 %	20 %	0 %	384510110
4022	NC_017305	GCGA	2	8	241459	241466	25 %	0 %	50 %	25 %	384510110
4023	NC_017305	GA	3	6	241659	241664	50 %	0 %	50 %	0 %	384510111
4024	NC_017305	ATT	2	6	241707	241712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384510111
4025	NC_017305	T	6	6	241711	241716	0 %	100 %	0 %	0 %	384510111
4026	NC_017305	CGC	2	6	241817	241822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384510111
4027	NC_017305	TGCC	2	8	241841	241848	0 %	25 %	25 %	50 %	384510111
4028	NC_017305	CTT	2	6	241862	241867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384510111
4029	NC_017305	GAT	2	6	241902	241907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510111
4030	NC_017305	GTT	2	6	242037	242042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384510111
4031	NC_017305	AGA	2	6	242048	242053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384510111
4032	NC_017305	ATTGTC	2	12	242082	242093	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384510111
4033	NC_017305	TTC	2	6	242157	242162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384510111
4034	NC_017305	TGC	2	6	242195	242200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510111
4035	NC_017305	GGA	2	6	242274	242279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384510111
4036	NC_017305	GAG	2	6	242356	242361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384510111
4037	NC_017305	CTT	2	6	242402	242407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384510111
4038	NC_017305	TAA	2	6	242429	242434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384510111
4039	NC_017305	TG	3	6	242481	242486	0 %	50 %	50 %	0 %	384510111
4040	NC_017305	GC	3	6	242521	242526	0 %	0 %	50 %	50 %	384510111
4041	NC_017305	TG	3	6	242536	242541	0 %	50 %	50 %	0 %	384510111
4042	NC_017305	TGC	2	6	242630	242635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510111
4043	NC_017305	GAG	2	6	242728	242733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384510111
4044	NC_017305	GCT	2	6	242852	242857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510111
4045	NC_017305	GAG	2	6	242877	242882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384510111
4046	NC_017305	AGC	2	6	242910	242915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510111
4047	NC_017305	CGT	3	9	243044	243052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510111
4048	NC_017305	GTA	2	6	243109	243114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510111
4049	NC_017305	AAG	2	6	243129	243134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384510111
4050	NC_017305	A	6	6	243146	243151	100 %	0 %	0 %	0 %	384510111
4051	NC_017305	GGA	2	6	243156	243161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384510111
4052	NC_017305	GAA	2	6	243187	243192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384510111
4053	NC_017305	CGT	2	6	243244	243249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510111
4054	NC_017305	CAG	2	6	243497	243502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510112
4055	NC_017305	TAT	2	6	243576	243581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384510112
4056	NC_017305	CGG	2	6	243747	243752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510112
4057	NC_017305	CG	3	6	243810	243815	0 %	0 %	50 %	50 %	384510112
4058	NC_017305	AGT	2	6	243816	243821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510112
4059	NC_017305	GCT	2	6	243895	243900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510112
4060	NC_017305	GCA	2	6	243928	243933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510112
4061	NC_017305	CAT	2	6	244005	244010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384510112
4062	NC_017305	CGG	2	6	244034	244039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510112
4063	NC_017305	GCA	2	6	244403	244408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510113
4064	NC_017305	GC	3	6	244480	244485	0 %	0 %	50 %	50 %	384510113
4065	NC_017305	GAT	2	6	244509	244514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510113
4066	NC_017305	AGG	3	9	244547	244555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384510113
4067	NC_017305	CTCA	2	8	244557	244564	25 %	25 %	0 %	50 %	384510113
4068	NC_017305	CGCT	2	8	244678	244685	0 %	25 %	25 %	50 %	384510113
4069	NC_017305	AGC	2	6	244710	244715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510113
4070	NC_017305	TTC	2	6	244776	244781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384510113
4071	NC_017305	GCCAT	2	10	244792	244801	20 %	20 %	20 %	40 %	384510113
4072	NC_017305	ACT	2	6	244816	244821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384510113
4073	NC_017305	AG	3	6	244891	244896	50 %	0 %	50 %	0 %	384510113
4074	NC_017305	CGT	2	6	244946	244951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510113
4075	NC_017305	CTG	2	6	245073	245078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510113
4076	NC_017305	TGA	2	6	245093	245098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510113
4077	NC_017305	CCTG	2	8	245116	245123	0 %	25 %	25 %	50 %	384510113
4078	NC_017305	TAG	2	6	245143	245148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510113
4079	NC_017305	ATC	2	6	245149	245154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384510113
4080	NC_017305	GCT	2	6	245177	245182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510113
4081	NC_017305	GAT	2	6	245235	245240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510113
4082	NC_017305	CCTT	2	8	245257	245264	0 %	50 %	0 %	50 %	384510114
4083	NC_017305	GTG	2	6	245275	245280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510114
4084	NC_017305	GCCT	2	8	245579	245586	0 %	25 %	25 %	50 %	384510114
4085	NC_017305	ACC	2	6	245599	245604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384510114
4086	NC_017305	GA	3	6	245609	245614	50 %	0 %	50 %	0 %	384510114
4087	NC_017305	TGCG	2	8	245618	245625	0 %	25 %	50 %	25 %	384510114
4088	NC_017305	CAC	2	6	245667	245672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384510114
4089	NC_017305	CAG	2	6	245714	245719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510114
4090	NC_017305	CAG	2	6	245726	245731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510114
4091	NC_017305	AG	3	6	245817	245822	50 %	0 %	50 %	0 %	384510114
4092	NC_017305	AGC	2	6	245847	245852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510114
4093	NC_017305	AGC	2	6	245895	245900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510114
4094	NC_017305	GCG	2	6	245917	245922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510114
4095	NC_017305	T	6	6	246046	246051	0 %	100 %	0 %	0 %	384510114
4096	NC_017305	GGT	2	6	246100	246105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510114
4097	NC_017305	TCTT	2	8	246142	246149	0 %	75 %	0 %	25 %	384510114
4098	NC_017305	AAT	2	6	246221	246226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384510114
4099	NC_017305	C	6	6	246302	246307	0 %	0 %	0 %	100 %	384510114
4100	NC_017305	GATG	2	8	246590	246597	25 %	25 %	50 %	0 %	384510114
4101	NC_017305	CAT	2	6	246600	246605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384510114
4102	NC_017305	TCA	2	6	246632	246637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384510114
4103	NC_017305	GTT	2	6	246656	246661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384510115
4104	NC_017305	CCA	2	6	246686	246691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384510115
4105	NC_017305	TGG	2	6	246796	246801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510115
4106	NC_017305	TAT	2	6	246898	246903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384510115
4107	NC_017305	GAT	2	6	246926	246931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510115
4108	NC_017305	AGGA	2	8	247207	247214	50 %	0 %	50 %	0 %	384510115
4109	NC_017305	TGA	2	6	247290	247295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510115
4110	NC_017305	AGC	2	6	247316	247321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510115
4111	NC_017305	CAG	2	6	247325	247330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510115
4112	NC_017305	GCA	2	6	247404	247409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510115
4113	NC_017305	CGA	2	6	247447	247452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510115
4114	NC_017305	GCA	2	6	247455	247460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510115
4115	NC_017305	CGG	2	6	247578	247583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510115
4116	NC_017305	GCC	2	6	247610	247615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384510115
4117	NC_017305	TTCT	2	8	247629	247636	0 %	75 %	0 %	25 %	384510115
4118	NC_017305	CTT	2	6	247743	247748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384510116
4119	NC_017305	CTA	2	6	247779	247784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384510116
4120	NC_017305	GCC	2	6	247799	247804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384510116
4121	NC_017305	GAA	2	6	247825	247830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384510116
4122	NC_017305	CGCAG	2	10	247848	247857	20 %	0 %	40 %	40 %	384510116
4123	NC_017305	ATC	2	6	247894	247899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384510116
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4241	NC_017305	CCCCG	2	10	254675	254684	0 %	0 %	20 %	80 %	384510121
4242	NC_017305	CGC	2	6	254741	254746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384510121
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4274	NC_017305	TCT	2	6	257041	257046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384510122
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4344	NC_017305	TTA	2	6	261211	261216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384510126
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4347	NC_017305	GGC	2	6	261294	261299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510126
4348	NC_017305	AAG	2	6	261342	261347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384510126
4349	NC_017305	GC	4	8	261389	261396	0 %	0 %	50 %	50 %	384510126
4350	NC_017305	CTT	2	6	261397	261402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384510126
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4352	NC_017305	GGCA	2	8	261502	261509	25 %	0 %	50 %	25 %	384510126
4353	NC_017305	TGA	2	6	261536	261541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510126
4354	NC_017305	TGC	2	6	261620	261625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510126
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4357	NC_017305	GC	4	8	261769	261776	0 %	0 %	50 %	50 %	384510126
4358	NC_017305	ATT	2	6	261831	261836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384510126
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4362	NC_017305	GCT	2	6	262117	262122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510127
4363	NC_017305	AGC	2	6	262143	262148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510127
4364	NC_017305	TGGG	2	8	262201	262208	0 %	25 %	75 %	0 %	384510127
4365	NC_017305	GCT	2	6	262209	262214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510127
4366	NC_017305	TTGGA	2	10	262260	262269	20 %	40 %	40 %	0 %	384510127
4367	NC_017305	GGT	3	9	262372	262380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510128
4368	NC_017305	TGA	2	6	262408	262413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510128
4369	NC_017305	GCA	2	6	262493	262498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510128
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4375	NC_017305	CGA	2	6	262732	262737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510128
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4381	NC_017305	GCT	2	6	263198	263203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510129
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4468	NC_017305	GTG	2	6	268853	268858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510134
4469	NC_017305	ACC	2	6	268957	268962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384510134
4470	NC_017305	TAC	2	6	268969	268974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384510134
4471	NC_017305	ACG	2	6	269123	269128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510134
4472	NC_017305	TGCA	2	8	269158	269165	25 %	25 %	25 %	25 %	384510134
4473	NC_017305	GCTG	2	8	269174	269181	0 %	25 %	50 %	25 %	384510134
4474	NC_017305	AGC	2	6	269293	269298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510135
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4480	NC_017305	GTG	2	6	269400	269405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510135
4481	NC_017305	CAG	2	6	269530	269535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510135
4482	NC_017305	GGTGT	2	10	269568	269577	0 %	40 %	60 %	0 %	384510135
4483	NC_017305	GTC	2	6	269586	269591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510135
4484	NC_017305	G	6	6	269616	269621	0 %	0 %	100 %	0 %	384510135
4485	NC_017305	CTG	2	6	269650	269655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510135
4486	NC_017305	CTG	2	6	269761	269766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510135
4487	NC_017305	CGGGG	2	10	269809	269818	0 %	0 %	80 %	20 %	384510135
4488	NC_017305	TGG	2	6	269915	269920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510135
4489	NC_017305	GAT	2	6	270003	270008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510135
4490	NC_017305	CCG	2	6	270022	270027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384510135
4491	NC_017305	T	6	6	270033	270038	0 %	100 %	0 %	0 %	384510135
4492	NC_017305	ATT	2	6	270048	270053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384510135
4493	NC_017305	GCG	2	6	270135	270140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510135
4494	NC_017305	CCA	2	6	270232	270237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384510135
4495	NC_017305	TGG	2	6	270286	270291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510135
4496	NC_017305	GAACCA	2	12	270345	270356	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384510135
4497	NC_017305	CGG	3	9	270515	270523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510136
4498	NC_017305	AAT	2	6	270606	270611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384510136
4499	NC_017305	GCG	2	6	270659	270664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510136
4500	NC_017305	ACA	2	6	270665	270670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384510136

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